家蚕滞育生物钟蛋白质EA4基因的结构以及时空表达研究

家蚕滞育生物钟蛋白质EA4基因的结构以及时空表达研究

论文摘要

家蚕是卵滞育昆虫,蚕业生产上通过低温冷藏和盐酸处理等方法解除蚕卵滞育。酯酶A4(Esterase A4,EA4)是一种能够感受蚕卵活化所需低温时间或酸刺激而发生蛋白质空间结构变化,获得瞬时ATPase活性的时间间隔测定酶(TIME),被称作家蚕滞育生物钟蛋白质。本实验以家蚕C108品种为材料,根据本实验室完成的ea4基因cDNA的ORF序列(NCBI登陆号:DQ086424),利用快速扩增cDNA末端法获得了其全长cDNA。测序结果表明,ea4基因全长cDNA 606 bp,ORF为519 bp,编码172个氨基酸。根据NCBI家蚕基因组数据,推断家蚕ea4基因至少含有4个外显子、3个内含子。由于家蚕全基因组数据存在缺口,通过拼接、修复GAP得到ea4基因从第2个外显子到第4个外显子全部序列,但第1个内含子序列未能确定。用核酸杂交技术以及半定量RT-PCR方法调查了ea4基因在家蚕5龄幼虫和蛹期不同组织的表达情况。随机引物地高辛(digoxygenin,DIG)标记ea4基因cDNA的核酸点杂交结果表明,在家蚕5龄幼虫和蛹期,ea4基因的表达不存在组织和性别特异性。采用Actin3基因做阳性对照,RT-PCR检测ea4基因的表达谱,结果在家蚕5龄幼虫和蛹期,ea4基因不存在发育时期的表达特异性,在丝腺、造血器官、中肠和脂肪体ea4基因的mRNA表达量较高,而在卵巢中表达量较低。证明了EA4蛋白质可能由家蚕造卵时期的幼虫至成虫期亲代非特异性合成后储存于卵。为了在基因表达水平进一步研究EA4蛋白质的生物测时机理,根据家蚕蛋白质EA4具有卵期瞬时ATPase活性(即生物钟活性)和整个卵期超氧化物歧化酶(Superoxide Dismutase,SOD)活性的特点,本文研究了家蚕以及野桑蚕ea4基因cDNA、EA4蛋白及SOD蛋白结构特点。比较家蚕和野桑蚕(NCBI:De154907)的ea4基因,两者的ORF同源性97%,蛋白同源性为99%。克隆野桑蚕的Cu/Zn-sod基因cDNA(NCBI登陆号:AM410997)后,推测的家蚕与野桑蚕SOD蛋白质氨基酸同源性为100%,家蚕EA4与SOD蛋白质的同源性为46%。家蚕EA4与Cu/Zn-SOD蛋白质有着相似的活性位点,包括金属配基氨基酸和二硫键,但N末端的相似性不高,这是EA4的特有结构,这部分是β-折叠重复空间结构,柔软可动,推测为EA4的计时功能的活性中心,是瞬时ATPase计时活性出现的关键结构,而EA4的钢性结构域可能是一直具有SOD活性的结构基础。从基因和蛋白质结构分析推测,家蚕EA4可能是起源于Cu/Zn-SOD家族的特异酯酶,家蚕EA4由幼虫至成虫期母体非特异性合成后储存于卵,其对环境低温、盐酸等活化刺激的时间间隔测定酶作用,依靠蛋白质空间结构变化测时,没有反馈环境刺激激活基因表达的调控方式。

论文目录

  • 中文摘要
  • Abstract
  • 前言
  • 第一部分 文献综述
  • 第一章 昆虫滞育的研究进展
  • 1 环境与昆虫滞育
  • 1.1 光周期
  • 1.2 温度
  • 1.3 食料
  • 1.4 密度
  • 1.5 湿度
  • 2 昆虫滞育的调控机制
  • 2.1 卵滞育调控
  • 2.2 幼虫与蛹滞育的调控
  • 2.3 成虫滞育的控制
  • 3 昆虫滞育的分子生物学研究
  • 3.1 滞育的生理生化机制
  • 3.2 滞育的分子生物学研究
  • 3.3 滞育激素调控代谢过程中的关键酶研究
  • 4 昆虫滞育的研究展望
  • 第二章 家蚕滞育生物钟蛋白质酯酶A4研究进展
  • 1 果蝇的昼夜生物钟基因及分子作用机制
  • 1.1 果蝇的昼夜生物钟基因
  • 1.2 果蝇昼夜节律调节的分子机制
  • 2 家蚕的滞育生物钟基因及分子作用机制
  • 2.1 家蚕滞育的规律
  • 2.2 酯酶A4的活性变化与蚕卵滞育性的关系
  • 2.3 酯酶A4的分子结构
  • 2.4 酯酶A4生物钟作用机制
  • 2.5 家蚕滞育生物钟的研究展望
  • 第二部分 研究内容
  • 第一章 一般材料和分子生物学常用方法
  • 1 一般材料
  • 2 方法
  • 第二章 家蚕滞育生物钟蛋白质EA4基因结构分析
  • 1 材料与方法
  • 2 结果与分析
  • 2.1 家蚕滞育生物钟蛋白质EA4 3'RACE扩增、克隆及测序
  • 2.2 家蚕滞育生物钟蛋白质EA4 5'RACE扩增、克隆及测序
  • 2.3 ea4全长cDNA
  • 2.4 ea4基因在基因组定位结果
  • 3 结论
  • 第三章 家蚕滞育生物钟蛋白质EA4基因时空表达研究
  • 1 材料与方法
  • 2 结果与分析
  • 2.1 家蚕ea4基因组织表达谱分析
  • 2.2 家蚕ea4基因各组织不同时期的表达谱分析
  • 2.3 家蚕ea4基因不同性别表达分析
  • 3 结论与讨论
  • 第四章 家蚕滞育生物钟蛋白EA4与铜锌超氧化物歧化酶相关性研究
  • 1 材料与方法
  • 2 结果与分析
  • 2.1 野桑蚕Cu/Zn-SOD cDNA的克隆与序列分析
  • 2.2 家蚕、野桑蚕的ea4和sod基因的cDNA同源性分析
  • 2.3 家蚕EA4及Cu/Zn-SOD的蛋白序列、结构和功能域分析
  • 2.5 家蚕、野桑蚕的EA4及Cu/Zn-SOD蛋白质同源性分析
  • 2.6 家蚕EA4蛋白序列与模式生物的Cu/Zn-SOD同源性及进化分析
  • 3 讨论
  • 结论
  • 1. 家蚕ea4基因的结构
  • 2. 家蚕ea4基因的时空表达
  • 3. 家蚕滞育生物钟蛋白EA4的作用机理
  • 参考文献
  • 研究生期间发表的文章
  • 研究生期间参加课题
  • 附录一
  • 附录二
  • 缩略语
  • 致谢
  • 详细摘要
  • 相关论文文献

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