鸡H-FABP/EX-FABP基因PCR-SSCP分析及其与屠宰性状和肉质性状的相关研究

论文摘要

本试验以四川省畜牧科学研究院和大恒家禽育种有限公司共同培育的优质肉鸡（共240只）为研究对象，对H-FABP基因和EX-FABP基因的PCR-SSCP遗传多样性进行了研究，同时结合测定的生产资料，分析不同基因型与屠宰性状和肉质性状的相关性。结果表明：在第2、4、5、7和第11对引物中发现鸡H-FABP基因的PCR-SSCP多态性位点且这些位点都主要存在于内含子区域。经PCR-SSCP分析并结合测序结果发现：第一内含子存在2个多态位点即332 G→A、534 G→A；第二外显子也存在2个多态位点即783 C→T，835C→T；在第二内含子中存在的变异位点为：1198T→C、2329C→T。通过最小二乘分析和显著性检验发现，第2对引物产生的不同基因型在各品种或品系之间的差异显著（P＜0.05），第4对，第5对和第7对引物产生的不同基因型在各品种或品系之间的差异极显著（P＜0.01）。经过不同基因型与屠宰性状和肉质性状的关联分析得知：第5对引物产生的不同基因型间的活重、屠体重、胸肌重、腹脂重和腹脂率差异显著（P＜0.05）；第4对引物产生的不同基因型间的肌纤维密度（MFN）、精氨酸（Arg）和苏氨酸（Thr）含量差异显著（P＜0.05）；第7对引物产生的不同基因型间的肌苷酸含量（IMP）、苯丙氨酸（Phe）和苏氨酸（Thr）含量差异显著（P＜0.05）。通过对鸡EX-FABP基因进行PCR-SSCP分析并结合测序结果发现：在该基因的扩增区域内存在645C→T、3254C→T、3266T→C、4272A→G和4282A→G等5处突变。通过最小二乘分析和显著性检验发现，在第4对引物产生的不同基因型在各品种或品系之间差异极显著（P＜0.01）。经过不同基因型与屠宰性状和肉质性状的关联分析得知：第4对引物产生的不同基因型间的谷氨酸（Glu）和粗灰分（Ash）含量差异显著（P＜0.05）；第14对引物产生的不同基因型间的缬氨酸（Val）含量差异显著（P＜0.05）。在本次实验鸡群中，H-FABP基因和EX-FABP基因与脂肪性状如皮下脂肪厚、肌间脂肪含量等不存在显著的相关性，但它们却对于肌纤维密度、谷氨酸、肌苷酸等影响肉质风味的性状有着较大程度的影响。通过本次实验结果可以推测：H-FABP基因可能对于鸡屠宰性状和肉质性状具有很大的影响或与控制屠宰性能和肉质性状的主基因连锁，所检测到的M1M1-B282-D1D1基因型的各项性状指标值均较优良，是很有价值的基因型组合，EZ-FASP基因可能对于鸡肉质风味性状有一定的影响，尚可进行更深入的研究。

论文目录

• 中文摘要
• 英文摘要
• 1.文献综述
• 1.1 FABPs家族的研究进展
• 1.1.1 概述
• 1.1.2 FABPs染色体定位
• 1.1.3 FABPs的结构
• 1.1.4 FABPs对动物脂肪代谢的作用
• 1.2 H-FABP基因的研究进展
• 1.2.1 H-FABP基因的分子结构
• 1.2.2 H-FABP基因的功能
• 1.2.3 H-FABP基因的多态性与脂肪性状的关系
• 1.3 EX-FABP基因的研究进展
• 1.3.1 EX-FABP基因的概述
• 1.3.2 EX-FABP基因的分子结构
• 1.3.3 EX-FABP基因的功能
• 1.3.4 EX-FABP基因作为影响禽肉质性状候选基因的研究
• 1.4 肉质风味的研究现状
• 1.4.1 畜禽肉质风味的概念
• 1.4.2 风味物质的产生及其种类
• 1.4.3 家禽肉质风味的研究现状
• 1.4.4 影响肉质风味的因素
• 1.5 本试验研究的目的和意义
• 2.试验材料与方法
• 2.1 试验材料
• 2.1.1 供试样本
• 2.1.2 主要仪器设备
• 2.1.3 主要试剂及配制
• 2.1.4 引物及其信息
• 2.2 试验方法
• 2.2.1 总DNA的提取
• 2.2.2 DNA浓度和纯度的检测
• 2.2.3 目的片断的PCR扩增
• 2.2.4 SSCP的分析步骤
• 2.2.5 测序
• 2.2.6 目标生产性状的测定与数据收集
• 2.3 数据处理
• 2.3.1 基因频率和基因型频率的计算
• 2.3.2 独立性检验
• 2.3.3 基因多态性位点的遗传效应
• 3.结果与分析
• 3.1 模板DNA的抽提结果
• 3.2 PCR扩增结果
• 3.2.1 H-FABP基因PCR产物的扩增结果
• 3.2.2 EX-FABP基因PCR产物的扩增结果
• 3.3 PCR-SSCP多态性检测结果
• 3.3.1 H-FABP基因PCR-SSCP多态性检测结果
• 3.3.2 EX-FABP基因PCR-SSCP多态性检测结果
• 3.4 FABP基因测序结果
• 3.4.1 H-FABP基因测序结果
• 3.4.2 EX-FABP基因测序结果
• 3.5 FABP基因遗传多态性分析
• 3.5.1 H-FABP不同基因型在各品系的分布
• 3.5.2 EX-FABP不同基因型在各品系的分布
• 3.6 FABP基因多态位点的遗传效应分析
• 3.6.1 各品系鸡屠宰性状的分析与比较
• 3.6.2 不同基因型与屠宰性状的关联分析
• 3.6.3 各品系鸡肉质性状的分析与比较
• 3.6.4 不同基因型与肉质性状的关联分析
• 4.讨论
• 4.1 关于SSCP技术的操作要领
• 4.2 FABP基因序列多态性分析
• 4.3 FABP基因多态性与鸡屠宰性状的关系
• 4.4 FABP基因多态性与鸡肉质性状的关系
• 5.结论
• 参考文献
• 致谢
• 附录