利用微卫星标记分析3个鹅品种的遗传多样性

利用微卫星标记分析3个鹅品种的遗传多样性

论文摘要

为了更好的开发利用鹅资源,为其物种保护供分子水平的理论依据,运用微卫星标记技术对伊犁鹅、灰雁、非洲雁3个鹅品种资源的起源问题和遗传多样性进行了研究。并进行了微卫星标记与伊犁鹅体尺、体重的相关分析。主要结果如下:1.3个鹅品种的遗传多样性研究(1)采用12个微卫星座位对3个鹅品种共108个体进行等位基因频率计算,并以等位基因频率为基础,检验哈代—温伯格平衡,发现只有部分座位在各群体中是处于平衡的,其中1个座位在伊犁鹅群体处于平衡,6个座位在灰雁群体中处于平衡,5个座位在非洲雁处于平衡;大多数位点处于不平衡。(2)伊犁鹅、灰雁、非洲雁的多态信息含量(PIC)分别为,0.4590、0.4806、0.5107,期望杂合度(He)分别为0.6463、0.7265、0.7499,有效等位基因数(Ne)分别为2.9196、3.6399、3.9322, Shannon指数分别为1.1305、1.3222、1.3910。表明3个鹅品种处于中等遗传多样性,其中伊犁鹅最低,非洲雁最高。(3)伊犁鹅与非洲雁间Fst=0.1142,灰雁与非洲雁间Fst=0.1106,为中度分化;而伊犁鹅与灰雁间Fst=0.0458处于较低程度的分化。(4)3个品种间的基因Nm值都大于1.5,伊犁鹅与非洲雁基因流最小,Nm=1.9393;伊犁鹅与灰雁基因流最大,Nm=5.2084;灰雁与非洲雁的Nm=3.9791。(5)标准遗传距离(Ds)和Nei’s遗传距离(Da)与固定指数(Fst)吻合,表明伊犁鹅与非洲雁遗传距离最大,灰雁与非洲雁距离次之,伊犁鹅与灰雁遗传距离最小,与利用MEGA4.0软件根据Ds、Da遗传距离得到的NJ、UPGMA聚类结果一致。2.微卫星标记与伊犁鹅体重、体尺的相关分析(1)少数性状之间未表现出显著相关,大部分都与两个以上的体尺性状相关。如体重与体斜长、胸宽、胸深、龙骨长、半潜水长、胫长差异极显著(P<0.01),与盆骨宽差异显著(P<0.05)。(2)不同标记基因型对伊犁鹅8个性状的方差分析结果表明:在所测定的12个微卫星座位中,体重、体斜长、胸宽、胸深和龙骨长5个性状在不同基因型中有显著效应。其中只有ADL0136的不同基因型对5个性状差异均不显著(P>0.05)。其它基因座位都与体重和不同体尺性状有显著差异(P<0.05)。

论文目录

  • 摘要
  • ABSTRACT
  • 第一章 鹅遗传多样性研究进展
  • 1.1 鹅的资源概况
  • 1.1.1 鹅的生物学特性
  • 1.1.2 鹅分类与分布
  • 1.1.3 鹅的遗传资源现状
  • 1.2 鹅分子系统进化研究
  • 1.3 鹅遗传多样性研究
  • 1.3.1 鹅遗传多样性研究方法
  • 1.3.2 鹅遗传多样性研究现状
  • 1.4 开展本项研究的目的和意义
  • 第二章 鹅微卫星遗传多样性的研究
  • 2.1 材料与方法
  • 2.1.1 材料
  • 2.1.2 试剂配制及实验步骤
  • 2.1.3 统计分析方法
  • 2.2 结果与分析
  • 2.2.1 微卫星电泳检测
  • 2.2.2 等位基因频率
  • 2.2.3 群体内的遗传变异检测
  • 2.2.4 品种间的遗传关系
  • 2.3 讨论
  • 2.3.1 关于取样和样本含量
  • 2.3.2 关于微卫星位点
  • 2.3.3 关于"影子带"的问题
  • 2.3.4 关于无效等位基因
  • 2.3.5 群体内遗传多样性
  • 2.3.6 群体间遗传分化与距离
  • 2.4 结论
  • 第三章 微卫星标记与伊犁鹅体尺、体重的相关分析
  • 3.1 材料与方法
  • 3.1.1 实验材料
  • 3.1.2 测定工具
  • 3.1.3 测定内容
  • 3.2 结果与分析
  • 3.2.1 体尺性状间的表型相关分析
  • 3.2.2 微卫星位点与伊犁鹅体尺性状的相关分析
  • 3.3 讨论
  • 3.4 结论
  • 参考文献
  • 致谢
  • 附录
  • 作者简介
  • 相关论文文献

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