十株海洋亚历山大藻ITS区序列测定和对比分析

十株海洋亚历山大藻ITS区序列测定和对比分析

论文摘要

本文使用分子生物学实验方法,对来自中国东海海域、南海大鹏湾、香港海域、台湾省海域等地的 10 株海洋亚历山大藻(Alexamdrium)进行特异性 PCR扩增,获得由核基因编码的核糖体基因内转录间隔区(Internal Transcribed Spacer, ITS)DNA 片段,经测序得到 10 个序列的信息。利用分子生物学软件,对这些序列及选自 GenBank 的 11 个代表性亚历山大藻株 ITS 序列进行比对分析,计算了序列间的距离值,绘制了分子系统树,对序列进行了相似性研究,并且推论出株藻间亲缘关系的远近;同时发现原先鉴定为 A.minutum AM 的藻株可能是一株A.tamarense。实验中,8 株藻采用了传统的 DNA 提取方法获得 PCR 扩增模板,2 株藻尝试藻液 10 分钟预处理后直接扩增的办法,成功建立了一种经济、快捷获得目标 PCR 产物的新方法。

论文目录

  • 中文摘要
  • 英文摘要
  • 引言
  • 第一章 研究进展
  • 一、分子系统学
  • 1. 分子系统学概念
  • 2. 分子系统学实验技术
  • 3. 分子系统学分析方法
  • 二、植物分子系统学
  • 1. 植物分子系统学概念
  • 2. 植物分子系统学发展史
  • 3. 植物分子系统学研究方法
  • 三、海洋亚历山大藻研究
  • 1. 亚历山大藻形态、生理特征
  • 2. 亚历山大藻分类学研究状况
  • 3. 亚历山大藻分子生物学研究
  • 第二章 实验内容
  • 一、材料与方法
  • 1. 实验材料
  • 2. 实验方法
  • 二、实验结果
  • 1. 电泳图片
  • 2. 对齐排序
  • 3. 距离值计算
  • 4. 系统树构建
  • 第三章 讨论
  • 一、实验方法讨论
  • 二、序列相似性比较与系统树分析
  • 参考文献
  • 硕士期间发表论文情况
  • 致谢
  • 附录A
  • 附录B
  • 相关论文文献

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