利用基因芯片技术筛选原发性肺癌顺铂耐药与敏感相关基因

论文摘要

目的:用基因芯片技术研究原发性非小细胞肺癌中与顺铂耐药和敏感相关的基因 方法:以临床上未经化疗的原发性非小细胞肺癌标本为研究对象,应用MTT琼脂法检测化疗药物DDP对非小细胞肺癌的体外抑制率,筛选出对DDP耐药和敏感的标本,提取这些标本的总RNA,以Oligo dT作为引物,Cy5 dCTP直接标记的cDNA与本室自己点样制备的基因芯片杂交,获得这些样本的基因表达谱,并运用gene cluster和SAM软件对这些基因进行统计学分析,获得与临床原发性顺铂耐药和敏感相关的基因。 结果:经过体外MTT琼脂法实验发现,93份肺癌标本中,50份标本出现体外药敏结果,其中30份线性关系较好。以1PPC的DDP浓度为标准,肺癌细胞的抑制率>50%为敏感,30%—50%为中度敏感,<30%为不敏感（耐药）。在我们所有的50份标本中,4例敏感,占全部标本的8%。15例中度敏感,占全部标本的30%。31例耐药,占全部标本的62%。这与临床报道的DDP单药有效率能够达到21%基本一致。 我们共选择了9份标本（3份敏感,6份耐药）进行芯片实验,对芯片实验的结果进行聚类分析,发现聚类的结果与样本的组织学类型和药物敏感性相关。样本1与样本5同属敏感的标本,在组织学类型上也同属于鳞癌。样本8也是敏感标本,但是没有样本与1,5聚在一起,这可能跟本8在组织学类型上属于肺母细胞瘤有关。 我们采用gene cluster结合SAM分析法,以detal=0.47209规定的上下限作为可信区间,并以1.5倍以上差异的基因为域值,发现了PDCD5,P53AIP1,MOG基因表达上调与顺铂的耐药呈正相关。CDH15,DLX4,M-cadherin,RAD23A,RAD23B等基因表达上调与顺铂耐药呈负相关。

论文目录

• 英文缩略语
• 中文摘要
• 英文摘要
• 前言
• 论文正文
• 第一部分：人肺癌细胞的原代培养及其对化疗药的敏感性
• 材料方法
• 实验结果
• 第二部分：利用基因芯片技术筛选肺癌与化疗药物敏感和耐药相关的基因
• 材料方法
• 实验结果
• 讨论
• 参考文献
• 小结
• 致谢