大连地区汉族人群HLA-DRB1等位基因多态性研究

论文摘要

目的:HLA（人类白细胞抗原,human leukocyte antigen）是人类主要组织相容性复合体（MHC,major histocompatibility complex）,是位于人类第6号染色体短臂上的2区1带的具有多基因性与多态性的紧密连锁的基因群,总长度3600kb,约占人类基因组总长度的1/3000。其上有224个基因位点,有功能的基因占128个。HLA是迄今所知最复杂的一个人类遗传多态性系统。不同种族,同一种族的不同民族,甚至同一民族在不同地理环境中HLA参数不尽相同,因此HLA的多态性有人种差异。目前HLA的应用已从器官移植的组织配型检测扩展到与疾病的关联、亲子鉴定、免疫应答、人类学、某些先天遗传病的早期诊断及未来基因治疗等领域。本研究旨在通过对3387名大连地区汉族健康人群HLA-DRB座位上的等位基因进行分型,建立大连地区人群的HLA分型数据库,从而为患者提供HLA配型尽可能相合的供者;通过计算、与有关文献报道比较分析得出大连地区汉族人群的HLA等位基因分布特点,为亲子鉴定及人类学研究提供理论依据;同时由于HLA多态性的差异可决定个体免疫应答的不同,一个地区正常人群的HLA基因研究资料也必将为HLA基因与疾病关系的研究发挥重大作用。方法:选取大连地区汉族志愿捐献骨髓的献血者3387名,身体健康,体检标准符合“全国采供血管理规范”。家族无遗传病史,年龄在18-55周岁,均无血缘关系。留取3387名个体外周静脉血3～5ml,EDTA抗凝,DNA提取试剂盒提取DNA。HLA-DRB1的分型采用PCR-SSO方法,使用美国Onelambda公司开发的SSO分型试剂盒,配合Luminex 100 IS分析系统进行全自动化结果判读和基因分析。在SSO技术基础上采用流式细胞技术,将标记有生物素的序列特异性引物,扩增HLA等基因座位,扩增产物与标记荧光的寡核苷酸探针进行杂交冲洗后,在Luminex100流式细胞仪上进行判读结果。当扩增的DNA片段与探针结合并发出荧光为阳性,否则为阴性。HLA-DRB1的各等位基因的基因频率和基因型频率采用直接计数法。与其他国家和地区间的等位基因频率分布的比较应用遗传学分析软件Arlequin（3.11版本）。结果:1.等位基因、基因型和等位基因频率:本研究检测的大连地区汉族3387人的HLA-DRB1位点中,共检测到HLA-DRB1等位基因13种,基因型90种。HLA-DRB1等位基因频率由高到低分别为DRB1*15（16.33%）、DRB1*09（13.46%）、DRB1*12（11.93%）、DRB1*07（11.6%）、DRB1*04（10.16%）、DRB1*14（7.19%）、DRB1*08（6.79%）、DRB1*13（6.21%）、DRB1*11（6.13%）、DRB1*03（4.02%）、DRB1*01（2.63%）、DRB1*16（1.96%）、DRB1*10（1.59%）。在大连汉族人群中HLA-DRB1的基因型比较多样,几乎所有组合都已经出现。2.等位基因频率地区间比较:大连地区汉族人群HLA-DRB1等位基因频率与山西汉族、山东人、南方汉族、辽宁汉族、以及欧洲人、日本人、喀麦隆人之间有显著性差异,与北方汉族之间无显著性差异。结论:1. HLA-DRB1最常见等位基因为HLA-DRB1*15,占16.33%;最常见的基因型为基因型09/15。等位基因频率最低的是DRB1*10,占1.59% ;基因型频率最低的10/16,占0.3%。2.大连地区汉族人群的HLA-DRB1等位基因频率有其独特的分布方式,HLA有地区差异。

论文目录

• 一、正文
• （一） 中文摘要
• （二） 英文摘要
• （三） 前言
• （四） 对象与方法
• （五） 结果
• （六） 讨论
• （七） 结论
• （八） 参考文献
• 二、文献综述
• （一） 综述
• （二） 参考文献
• 三、致谢