本文主要研究内容
作者付苏宏,雷鸣,张勇群,施静,郝豆豆（2019）在《菊叶香藜转录组单核苷酸多态性(SNP)信息挖掘及功能注释分析》一文中研究指出：【目的】挖掘菊叶香藜转录组数据中的SNP信息,对具有SNP位点的unigene(SNP-unigene)进行功能注释分析,为菊叶香藜SNP分子标记的开发提供理论依据。【方法】利用Samtools和VarScan v.2.2.7软件寻找候选的SNP位点,并对SNP-unigene进行GO注释、COG注释和KEGG注释。【结果】在菊叶香藜花和叶转录组中,分别鉴定出了889个和673个SNP位点,转换分别占63.0%和62.7%,颠换分别占37.0%和37.3%,转换和颠换的比值分别为1.70和1.68,非编码区分别占21.15%和21.10%,编码区分别占67.27%和67.46%。菊叶香藜所有SNP位点分布于643条SNP-unigene上,功能注释结果显示,总共有343条SNP-unigene具有GO注释,370条SNP-unigene具有COG注释,232条SNP-unigene具有KEGG注释,这些SNP-unigene涉及较多的功能主要与代谢、核糖体、次生代谢产物的生物合成相关。【结论】本研究通过大规模地筛选菊叶香藜中的候选SNP位点,可以为研究菊叶香藜基因分型、构建遗传图谱等方面奠定基础,对于开发利用菊叶香藜植物资源具有重要的价值。
Abstract
【mu de 】wa jue ju xie xiang li zhuai lu zu shu ju zhong de SNPxin xi ,dui ju you SNPwei dian de unigene(SNP-unigene)jin hang gong neng zhu shi fen xi ,wei ju xie xiang li SNPfen zi biao ji de kai fa di gong li lun yi ju 。【fang fa 】li yong Samtoolshe VarScan v.2.2.7ruan jian xun zhao hou shua de SNPwei dian ,bing dui SNP-unigenejin hang GOzhu shi 、COGzhu shi he KEGGzhu shi 。【jie guo 】zai ju xie xiang li hua he xie zhuai lu zu zhong ,fen bie jian ding chu le 889ge he 673ge SNPwei dian ,zhuai huan fen bie zhan 63.0%he 62.7%,dian huan fen bie zhan 37.0%he 37.3%,zhuai huan he dian huan de bi zhi fen bie wei 1.70he 1.68,fei bian ma ou fen bie zhan 21.15%he 21.10%,bian ma ou fen bie zhan 67.27%he 67.46%。ju xie xiang li suo you SNPwei dian fen bu yu 643tiao SNP-unigeneshang ,gong neng zhu shi jie guo xian shi ,zong gong you 343tiao SNP-unigeneju you GOzhu shi ,370tiao SNP-unigeneju you COGzhu shi ,232tiao SNP-unigeneju you KEGGzhu shi ,zhe xie SNP-unigeneshe ji jiao duo de gong neng zhu yao yu dai xie 、he tang ti 、ci sheng dai xie chan wu de sheng wu ge cheng xiang guan 。【jie lun 】ben yan jiu tong guo da gui mo de shai shua ju xie xiang li zhong de hou shua SNPwei dian ,ke yi wei yan jiu ju xie xiang li ji yin fen xing 、gou jian wei chuan tu pu deng fang mian dian ding ji chu ,dui yu kai fa li yong ju xie xiang li zhi wu zi yuan ju you chong yao de jia zhi 。
论文参考文献
论文详细介绍
论文作者分别是来自西南农业学报的付苏宏,雷鸣,张勇群,施静,郝豆豆，发表于刊物西南农业学报2019年04期论文，是一篇关于菊叶香藜论文,转录组论文,功能注释论文,西南农业学报2019年04期论文的文章。本文可供学术参考使用，各位学者可以免费参考阅读下载，文章观点不代表本站观点，资料来自西南农业学报2019年04期论文网站，若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权，请联系我们删除。
标签：菊叶香藜论文; 转录组论文; 功能注释论文; 西南农业学报2019年04期论文;