由印迹主基因决定的数量性状选择方法的研究

论文摘要

基因组印迹现象与经典的孟德尔遗传理论不同,本文是以基因组印迹现象为讨论对象,首先说明了基因组印迹的分子遗传机理,主要是由于遗传物质(DNA或RNA)在复制过程中的甲基化和去甲基化的作用;同时,将该印迹基因考虑为控制其对应性状的主基因,并分析了父系印迹与母系印迹两种情况在性状的遗传过程中的不同遗传规律;利用蒙特卡罗方法,模拟不同的选择过程;将个体性状的表型值剖分为四个向量,即群体平均值、个体育种值、印迹效应值和随机效应值;主程序利用计算机编程语言VBA进行编程,按照不同的参数共计2400个组合,分别模拟了15个世代的选择过程,其中用到的主要参数包括:遗传力、遗传方式、初始基因频率、公畜选留个数、印迹效应占表型值的比例;模拟程序主要比较了利用表型值的选育过程、利用BLUP方法进行的选择过程和利用真实育种值的效果,表明表型值方法较好;三种方法都在第6代之后表型值进展缓慢或出现波动;BLUP法不利于控制群体近交系数。

论文目录

• 1 文献综述
• 1.1 基因组印迹
• 1.1.1 基因组印迹的可能机制
• 1.1.2 哺乳动物印迹性状的特点
• 1.1.3 哺乳动物常见的印迹基因
• 1.1.4 基因组印迹作用的生物学意义
• 1.2 数量性状主基因的研究及应用
• 1.2.1 主基因的概念
• 1.2.2 畜禽主基因研究的例证
• 1.2.3 主基因的测定方法
• 1.2.4 主基因研究的意义及应用前景
• 2 VBA简介
• 2.1 VBA的发展
• 2.2 VBA的主要功能介绍
• 2.3 VBA的应用前景
• 3 蒙特卡罗方法简介
• 3.1 蒙特卡罗概述
• 3.2 随机数的正态化处理过程
• 3.3 产生正态分布随机数的子程序
• 3.4 产生和储存正态分布随机数子程序
• 3.5 读出正态分布随机数及χ2检验子程序
• 4 模拟程序的设计与实验分析
• 4.1 由印迹主基因决定的数量性状表型值选择的模拟研究
• 4.1.1 模拟假设与方法
• 4.1.2 印迹基因的遗传规律研究
• 4.1.3 表型值选择试验的模拟研究
• 4.1.4 模拟程序的设计过程及程序模块介绍
• 4.1.5 表型值选择的模拟结果
• 4.2 由印迹主基因决定的数量性状BLUP育种值选择方法的模拟研究
• 4.2.1 动物模型BLUP的应用
• 4.2.2 BLUP方法的基本原理
• 4.2.3 动物模型BLUP方法的特点
• 4.2.4 BLUP估计育种值的基本步骤
• 4.2.5 BLUP育种值选择模拟的结果
• 4.3 由印迹主基因决定的数量性状真实育种值选择方法的模拟研究
• 4.3.1 材料与方法
• 4.3.2 系统假设
• 4.3.3 模拟模型
• 4.3.5 选择试验的模拟
• 4.3.6 模块程序代码举例
• 4.3.7 真实育种值选择模拟的结果
• 5 分析与讨论
• 5.1 近交增量的分析
• 5.2 表型值进展
• 5.3 真实育种值变化
• 5.4 基因频率的变化
• 6 结论
• 致谢
• 参考文献
• 作者简介