甘肃猪种资源微卫星DNA遗传多样性研究

论文摘要

采用世界粮农组织(FAO)和国际动物遗传学会(ISAG)联合推荐的9对微卫星引物,检测了甘肃省7个猪品种(系):地方猪种合作猪、培育品系华特A系和B系及四个外引品种杜洛克、长白、大约克夏和皮特兰,共计273个样品的基因型。通过计算等位基因频率、遗传杂合度、多态信息含量、奈氏标准遗传距离,分析品种(系)内和品种(系)间的遗传变异。采用邻近结合法及非加权组对算术平均法,进行聚类分析。以期从分子水平来揭示现阶段甘肃省猪种资源的丰富度和遗传差异,从而为甘肃猪种资源的保护、开发利用、科学选育和合理杂交等提供理论依据。结果表明:1.在9个微卫星座位中,所有位点共检测到131个等位基因,每个位点有8个以上等位基因,说明9个微卫星位点都具有较高的多态性。2.7个甘肃省猪品种(系)的9个位点的平均杂合度都较高,在0.7427～0.8109之间,皮特兰最小,大约克夏最大。平均多态信息含量(PIC)在0.6820～0.7807之间,均表现为高度多态,说明群体内变异性大。对于外引品种而言选育的潜力大,而对于华特A系、B系与合作猪而言,已经导入外源基因,需要近一步纯化基因。皮特兰猪由于在甘肃省数量较少,遗传基础较窄,所以杂合度相对较低。3.7个甘肃省猪品种(系)间的DA遗传距离和DS遗传距离得到了一致的结果:华特B系与大约克夏遗传距离较小,合作猪与其他6个猪品种(系)间的遗传距离较大。4.根据奈氏遗传距离及奈氏标准遗传距离,绘制了甘肃省7品种(系)猪的UPGMA及NJ聚类图,结果显示:两个国外品种大约克和杜洛克聚为一类,引进品种长白和培育品系华特B系聚为一类,地方品种合作猪另成一类。两种方法的聚类一致。在奈氏遗传距离绘制的UPGMA聚类图中,华特A系单独聚为一类,皮特兰和大约克夏、杜洛克、华特B系和长白聚为一类。5.甘肃省猪种资源已引入了一定程度的外源基因,基因的纯化和遗传多样性保护已受到严重威胁。

论文目录

• 摘要
• Summary
• 第一部分 文献综述
• 1 甘肃省猪种资源介绍
• 1.1 外引品种
• 1.2 培育品种（系）
• 1.3 地方品种
• 2 畜禽遗传多样性
• 2.1 遗传多样性概述及其意义
• 2.2 畜禽遗传多样性的现状
• 2.3 保种理论与方法研究
• 2.4 家畜遗传多样性的评估方法
• 3 微卫星标记在动物遗传资源多样性评估中的研究与应用
• 3.1 微卫星标记的概念及其类型
• 3.2 微卫星的形成机制
• 3.3 微卫星的功能与作用
• 3.4 微卫星的特点
• 3.5 微卫星在畜禽群体遗传结构和遗传多样性方面的研究进展
• 第二部分 试验研究
• 1 研究目的、意义及创新
• 2 试验材料
• 2.1 材料来源
• 2.2 样品的采集
• 2.3 主要仪器及设备
• 2.4 主要工具酶和试剂
• 2.5 常规试剂的配制
• 3 试验方法
• 3.1 基因组DNA 的提取及检测
• 3.2 基因组DNA 的PCR 扩增
• 3.3 电泳分离基因型
• 4 统计分析
• 4.1 统计软件
• 4.2 等位基因频率
• 4.3 杂合度
• 4.4 多态信息含量
• 4.5 Nei 氏标准遗传距离
• 4.6 聚类分析
• 5 结果与分析
• 5.1 DNA 提取结果的琼脂糖检测
• 5.2 PCR 扩增产物的检测结果
• 5.3 PCR 扩增产物的非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳图谱
• 5.4 微卫星多态位点的等位基因及其频率
• 5.5 杂合度（H）和多态信息含量（PIC）
• 5.6 各品种（系）间的遗传距离及聚类结果
• 6 讨论
• 6.1 样本含量
• 6.2 微卫星位点数目的选择
• 6.3 基因组DNA 的提取
• 6.4 PCR 影响因素分析及其条件优化
• 6.5 关于聚丙烯酰胺凝胶电泳
• 6.6 带型的判别
• 6.7 品种遗传多态性、遗传距离、聚类分析和选育背景的关系
• 7 结论
• 致谢
• 参考文献
• 作者简介
• 导师简介