小麦耐盐相关基因的作图及克隆

小麦耐盐相关基因的作图及克隆

论文题目: 小麦耐盐相关基因的作图及克隆

论文类型: 博士论文

论文专业: 遗传学

作者: 马丽清

导师: 贾继增,王国英

关键词: 小麦,耐盐性,吡咯琳羧酸合成酶,吡咯琳羧酸还原酶

文献来源: 中国农业大学

发表年度: 2005

论文摘要: 小麦是我国的第二人粮食作物,土壤的盐渍化严重制约着小麦的生产,提高小麦的抗盐性是小麦的重要育种目标之一。运用分子生物学手段,通过耐盐相关基因作图和克隆,不公为小麦耐盐分子机制提供理论依据,而且为最终实现转基因耐盐小麦奠定了基础。本研究通过QTL分析,抗盐相关基因的同源序列克隆及功能验证取得了以下结果: 1.本实验采用Opata85×W7984 RIL群体及已构建的遗传连锁图,用芽期耐盐指数,胚根鲜重、干重,胚芽鲜重、干重,苗期盐害指数,植株干重、鲜重,根冠比,叶片脯氨酸含量,叶片叶绿素含量等多个耐盐相关生理指标,采用QTLmapper1.0软件对耐盐相关性状进行了QTL定位。共定位到69个QTLs,其中芽期22个,苗期47个。在3A染色体xglk683-xcd0460间,3B染色体xfbbl68-xbcd147间,4D染色体xcko1081-xfbb226间和6D染色体xpsr106-xfbb283间是多个性状的QTL共同指向的区段,可能是主效QTL位点。其中4D染色体上xcko1081-xfbb226间是控制芽期耐盐性的QTL位点,6D染色体xpsr106-xfbb283间是控制苗期耐盐性的QTL位点,3A染色体xglk683-xcd0460间和3B染色体xfbb168-xbcd147间是同时控制曲期和芽期的QTL位点。这些QTL位点为分子标记辅助育种和耐盐QTL的图位克隆提供了帮助。 2.吡咯啉-5-羧酸合成酶(P5CS)基因是脯氨酸生物合成的限速酶,本研究以耐盐的小国小麦地方品种茶淀红为试材,采用同源序列克隆方法,得到了小麦TaP5CS基因,其cDNAK度为2260bp,包含2151bp的ORF,编码717个氨基酸,含有ATP、NADPH结合位点和谷氨酸激酶、谷氨酸脱氢酶保守域,脯氨酸反馈抑制作用位点。该基因在GenBank的登陆号为AY888045。在基因组DNA上获得了7400bp的片段,约含有18个内含子,19个外显子。Southern杂交的结果表明,TaP5CS基困在小麦基因组中有2个拷贝,定位在小麦的第二部分同源群上。Northern杂交和半定量RT-PCR的结果表明,小麦TaP5CS基因是受盐胁迫诱导上调表达的基因,在盐胁迫下有2个转录高峰。将该基因转入拟南芥中,Northern blotting的结果表明在正常情况下,小麦TaPSCS基因在拟南芥中能够正常表达,在盐、PEG、ABA胁迫下,TaP5CS基因的转录本进一步积累。并且在低度和中度盐胁迫下,能促进根的伸长,根的生物量增加,提高脯氨酸的含量、可溶性蛋白含量、叶绿素的含量、促进植株的生长,提高植株地上部分的生物量。而TaP5CS基因在拟南芥中的反义表达,抑制了拟南芥AtP5CS基因的活力,降低了脯氨酸的合成积累,降低根的伸长速率。反义表达的拟南芥植株开花结实率低,果荚变小,种子数少,但种子变大。反义表达短片段P5CS262的作用要大于反义表达长片段P5CS-2151。 3.以同源序列克隆的方法在cDNA利基因组DNA水平上,获得了小麦吡咯啉-5-羧酸还原酶(TaP5CR)基因,TaP5CR1基因cDNA全长1025bp,基阅组DNA为2600bp,包含7个外显子和6个内含子,编码288个氨基酸的多肽,GenBank登陆号为AY880317。Southern杂交的结果表明,该基因有2个以上的拷贝。不同六倍体小麦的等位变异分析表明该基因是很保守的。Northern blot分

论文目录:

缩略词

摘要

ABSTRACT

第一章 文献综述

1.研究意义

2.植物耐盐机理研究进展

2.1.盐胁迫对植物的伤害机理

2.2.植物的耐盐机理

3.脯氨酸及其合成代谢途径研究进展

3.1.脯氨酸作为渗透调节物质的地位和作用

3.2.脯氨酸的合成途径

3.3.脯氨酸和ABA

4.QTL定位及植物耐盐QTL研究进展植物:

4.1.植物耐盐QTL定位的研究进展

4.2.耐盐相关QTLs定位、克隆及展望

5.植物新基因发掘的方法和策略

5.1.利用图位克隆技术进行新基因发掘

5.2.利用比较基因组学进行新基因发掘

5.3.利用突变体进行新基因发掘:

5.4.利用基因表达技术进行新基因发掘

6.本研究的目的和意义

第二章 小麦耐盐相关QTLS的定位

1.材料与方法

1.1.Opata85xW7984RIL群体

1.2.芽期耐盐相关性状的鉴定

1.3.苗期耐盐性的鉴定

1.4 数据分析及QTL定位

2.结果和分析

2.1.RIL群体及亲本的表型值

2.2.耐盐相关性状和耐盐指数的相关分析

2.3.耐盐相关指标的QTL作图

3.讨论

3.1.耐盐相关指标的选择

3.2.耐盐QTL的定位及成簇分布

第三章 小麦TAP5CS(⊿~L-PYRROLINE-5-CARBOXYLATE SYNTHETASE)基因的克隆和功能验证

1.材料

2.方法

3.结果与分析

3.1.小麦吡咯啉-5-羧酸合成酶基因的克隆

3.2.小麦TaP5CS基因在拟南芥中过量表达

3.3.小麦TaP5CS基因在拟南芥中的反义表达

4.讨论

第四章 小麦TAP5CR(⊿~1-PYRROLINE-5-CARBOXYLATE REDUCTASE)基因的克隆和功能验证

1.材料

2.方法

3.结果与分析

3.1.小麦吡咯啉-5-羧酸还原酶基因的克隆与序列分析

3.2.小麦吡咯啉-5-羧酸还原酶基因的Southern杂交分析

3.3 小麦吡咯啉-5-羧酸还原酶基因的等位变异分析

3.4.小麦吡咯啉-5-羧酸还原酶基因Nornthern blot分析

3.5.小麦吡咯啉-5-羧酸还原酶基因过量表达载体的构建

3.6.过量表达TaP5CR基因的转基因植株鉴定

3.7.转基因植株的功能鉴定

4.讨论

第五章 结论

参考文献

致谢

个人简历

发布时间: 2005-07-18

参考文献

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