龙须菜(Gracilaria lemaneiformis)微卫星标记的筛选及品系间多态性分析

龙须菜(Gracilaria lemaneiformis)微卫星标记的筛选及品系间多态性分析

论文摘要

龙须菜(Gracilaria lemaneiformis)已经成为我国继海带和紫菜之后的第三大栽培海藻,不仅是江蓠属的一个重要的产琼胶物种,而且还是遗传学研究的好材料。因此,进行龙须菜的基础研究,对更好地开发其经济效益具有重要意义和推动作用。微卫星(SSR)是一种广泛用于遗传多样性、系统发生和种质鉴定等领域的分子标记技术。本论文从三个方面对龙须菜微卫星进行了初步的开发,并对开发出的微卫星进行了多态性检测及种间转移扩增。1.利用生物信息学方法,从公开发表的龙须菜公共核苷酸数据库中寻找多态信息含量丰富的微卫星位点,在筛选出的微卫星位点中选取序列,成功设计合成了5对引物,并在青岛野生龙须菜群体中进行多态性检测。结果显示,5对引物均有扩增产物,但却未检测到多态性。2.从江蓠属其它种的EST数据库中查找微卫星位点,根据Gracilaria changii的EST序列设计合成了10对微卫星引物。通过对青岛野生龙须菜群体中的多态性检测,其中1对引物的扩增产物具有多态性。3.为了获得更多的微卫星引物,通过查找相关文献获得江蓠属其他种(细江蓠Gracilaria gracilis)的4对已知微卫星引物,用在龙须菜上进行引物种间转移扩增研究,有2对引物在龙须菜中有具多态性的扩增产物。实验获得的微卫星引物可用来进行龙须菜种群遗传多样性研究、遗传图谱构建。此外,为比较龙须菜不同品系及江蓠属不同物种在微卫星位点的差异,我们将从龙须菜核酸公共数据库中查找到的微卫星引物在相关品系和相关种间做了转移扩增研究。根据计算得到的各样品间Nei氏遗传相似系数进行聚类分析,结果显示青岛野生型龙须菜样品QD与养殖选育品系样品981、石岛的龙须菜样品SD与龙须岛的龙须菜样品LD之间的遗传相似系数最高;LV与龙须菜之间的差异远远高于种内水平的差异,而成为一种种间水平的差异。

论文目录

  • 摘要
  • Abstract
  • 第一章 文献综述
  • 第一节 江蓠属海藻简介
  • 第二节 分子标记技术概述
  • 第三节 分子标记技术在江蓠分子系统学中的应用
  • 第四节 研究的内容及意义
  • 第二章 龙须菜微卫星位点的查找
  • 第一节 前言
  • 第二节 材料与方法
  • 第三节 实验结果与讨论
  • 第三章 龙须菜微卫星标记多态性检测
  • 第一节 前言
  • 第二节 材料与方法
  • 第三节 实验结果与讨论
  • 第四章 微卫星引物在不同龙须菜品系间的多态性分析
  • 第一节 前言
  • 第二节 材料与方法
  • 第三节 实验结果与讨论
  • 小结
  • 参考文献
  • 致谢
  • 个人简历
  • 发表的学术论文
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    • [1].In Vitro Anti-influenza Virus Activities of Sulfated Polysaccharide Fractions from Gracilaria lemaneiformis[J]. Virologica Sinica 2010(05)
    • [2].Structure of reproductive apparatus of Gracilaria/Gracilariopsis lemaneiformis (Gracilariaceae,Rhodophyta)[J]. Science in China(Series C:Life Sciences) 2008(12)
    • [3].Identification of a Putative Tetrasporophyte-Specific Gene in Gracilaria lemaneiformis(Gracilariales,Rhodophyte)[J]. Journal of Ocean University of China 2008(03)
    • [4].Extraction Technology of Polysaccharides from Gracilaria lamaneiformis and Its Antioxidation Research[J]. Medicinal Plant 2013(09)
    • [5].Removal of Cypermethrin with Seaweed Gracilaria lemaneiformis[J]. Journal of Ocean University of China 2015(05)
    • [6].Adverse Effect of TiO_2 Nanoparticles on Antioxidant System and Antitumor Activities of Macroalgae Gracilaria lemaneiformis[J]. Journal of Ocean University of China 2019(05)
    • [7].龙须菜多糖的提取纯化及生物活性研究进展[J]. 海洋渔业 2020(01)
    • [8].粤东地区江蓠属Gracilaria(江蓠科,红藻门)的形态分类学[J]. 热带海洋学报 2014(04)
    • [9].Effects of salinity, light and temperature on growth rates of two species of Gracilaria (Rhodophyta)[J]. Chinese Journal of Oceanology and Limnology 2009(02)
    • [10].菊花心江蓠(Gracilaria lichevoides)营养成分分析及评价[J]. 河北渔业 2020(03)
    • [11].Comparison in copper accumulation and physiological responses of Gracilaria lemaneiformis and G. lichenoides (Rhodophyceae)[J]. Chinese Journal of Oceanology and Limnology 2013(04)
    • [12].Searching for the best agarose candidate from genus Gracilaria, Eucheuma,Gelidium and local brands[J]. Asian Pacific Journal of Tropical Biomedicine 2015(10)
    • [13].Physiological responses of macroalga Gracilaria lemaneiformis(Rhodophyta) to UV-B radiation exposure[J]. Chinese Journal of Oceanology and Limnology 2015(02)
    • [14].Effects of temperature,algae biomass and ambient nutrient on the absorption of dissolved nitrogen and phosphate by Rhodophyte Gracilaria asiatica[J]. Chinese Journal of Oceanology and Limnology 2013(02)
    • [15].Removal of eutrophication factors and heavy metal from a closed cultivation system using the macroalgae,Gracilaria sp.(Rhodophyta)[J]. Chinese Journal of Oceanology and Limnology 2010(06)
    • [16].真江蓠(Gracilaria verrucosa)对网箱养殖海区的生态修复及生态养殖匹配模式[J]. 生态学报 2008(04)
    • [17].Comparative analysis of four essential Gracilariaceae species in China based on whole transcriptomic sequencing[J]. Acta Oceanologica Sinica 2014(02)
    • [18].Rapid biosorption and reduction removal of Cr(Ⅵ) from aqueous solution by dried seaweeds[J]. Journal of Central South University 2014(07)
    • [19].龙须菜(Gracilaria lemaneiformis)中多种植物激素的GC-MS检测及对氮胁迫的响应[J]. 海洋与湖沼 2011(06)
    • [20].中国海洋红藻门新分类系统[J]. 广西科学 2015(02)
    • [21].硼胁迫对龙须菜生长及其生理特征的影响[J]. 南方水产科学 2014(04)
    • [22].Polyculture of the lined seahorse,Hippocampus erectus Perry,1810 with two species of macroalgae in aquaria[J]. Acta Oceanologica Sinica 2010(01)
    • [23].福建沿海试养中间球海胆的初步研究[J]. 南方水产科学 2020(03)
    • [24].碳酸氢铵对龙须菜(Gracilaria lemaneaformis)污损生物多棘麦杆虫(Caprella acanthogaster)的防除效果[J]. 渔业科学进展 2014(04)
    • [25].菊花江蓠(Gracilaria lichenoides)对N、P吸收效应及其细胞超微结构变化[J]. 海洋与湖沼 2013(01)
    • [26].Phaeocystis globosa Scherffel,a harmful microalga,and its production of dimethylsulfoniopropionate[J]. Chinese Journal of Oceanology and Limnology 2011(04)
    • [27].Inhibition of photosynthesis in the microalga Chaetoceros curvisetus(Bacillariophyta) by macroalga Gracilaria lemaneiformis(Rhodophyta)[J]. Chinese Journal of Oceanology and Limnology 2013(06)
    • [28].Isolation and identification of bacteria associated with the surfaces of several algal species[J]. Chinese Journal of Oceanology and Limnology 2009(03)
    • [29].Phylogenetic Analysis of Epibacterial Communities on the Surfaces of Four Red Macroalgae[J]. Journal of Ocean University of China 2014(06)
    • [30].不同龙须菜品系在高温胁迫下的生理响应比较[J]. 南方水产科学 2011(03)

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