烟草微核心种质构建及相关性状数量遗传分析

烟草微核心种质构建及相关性状数量遗传分析

论文摘要

微核心种质是核心种质的核心种质,是核心种质的代表性子集,具有最小的遗传重复,能够最大程度地代表原资源群体的遗传多样性和遗传结构。烟草微核心种质研究的最终目的是为了促进烟草种质资源的高效管理、深入评价和充分利用,最大程度地满足生产和科研的需要。本研究以烟草原核心种质为材料,比较研究数量性状数据和分子标记数据不同整合比例及不同抽样策略构建微核心种质的遗传多样性保有量,构建了烟草微核心种质。在烟草微核心种质的基础上,筛选2份有代表性的烤烟微核心种质,运用植物数量性状“主基因+多基因”混合遗传模型,进行烤烟重要植物学及生理性状的遗传研究,以期为烤烟数量遗传育种提供一定的理论指导。主要研究结论如下:(1)通过12份不同烟草种质类型,筛选均匀分布于烟草24条连锁群上的700对SSR标记,综合考虑PIC值、扩增带型统计的难易及引物的重复性,获得54对SSR核心引物,建立了核心引物数据库。本研究有利于规范引物筛选程序、提高引物筛选效率,对烟草种质资源的遗传多样性分析、核心种质构建、指纹图谱构建以及种子真伪性和纯度的鉴定等都具有现实意义。(2)以我国2001年构建的446份烟草核心种质为材料,根据23个数量性状资料和54对SSR引物的分子标记数据,开展微核心种质构建研究。不同取样比例(40%、30%、25%、20%、15%、10%和5%)分析表明,15%的取样比例可获得普通烟草90%以上的多态位点百分率,30%的取样比例可获得黄花烟草80%以上的多态位点百分率,是较好的微核心种质取样规模;表型数据和分子数据整合后的数据要比不整合好,且表型数据与分子数据的比例为0.1:0.9时,整合效果最好。对于连续型数据遗传距离估算的2种距离(欧氏距离和马氏距离)中,欧氏距离效果最优;对于离散型数据遗传距离估算的4种距离(Simple matching、Jaccard、Nei-Li和主成分距离)中,Jaccard距离效果最优。对4种分组取样策略(简单比例法、平方根比例法、对数比例法和多样性比例法)和3种取样方法(随机取样法、优先取样法和变异度取样法)比较表明,总体取样方法中变异度取样法最优,在组内样本含量较大时,简单比例法和多样性比例法获得的微核心种质代表性最好,为最优取样策略;而当组内样本含量较小时,对数比例法获得的微核心种质代表性最好,为最优取样策略。最后,在简单比例法和对数比例法取样筛选出的117份核心样品中,又通过定向选择补充了10份具有优异表型性状的材料,构建了含127份烟草的微核心种质。分子和表型检验都表明本研究所构建的微核心种质具有较好的代表性。(3)利用“主基因+多基因”混合遗传模型的6个世代联合分离分析方法,分析烤烟组合丸叶×Coker319几个重要植物学性状的遗传效应。结果表明,烤烟的株高、叶数、叶面积和鲜叶重受2对加性-显性-上位性主基因+加性-显性-上位性多基因控制,株高与叶数遗传以加性效应及显性×显性上位性效应为主,叶面积和鲜叶重各遗传效应相差不多,其上位性效应>加性效应>显性效应,F2世代的主基因遗传率分别为57.53%、42.63%、30.32%和44.26%。移栽至中心花开放天数受2对加性-显性-上位性主基因+加性-显性多基因控制,以加性×加性上位性效应、加性效应及显性×显性上位性效应为主,主基因遗传率为64.79%。茎围和比叶重均受1对完全显性主基因+加性-显性多基因控制,茎围遗传以多基因为主,其多基因加性效应和显性效应大小相当,比叶重遗传主基因、多基因的加性效应和显性效应大致相当,主基因遗传率分别为2.48%和38.71%。叶形指数受1对加性-显性主基因+加性-显性-上位性多基因控制,主基因加性效应与显性效应基本相当,主基因遗传率为49.64%。叶长、叶宽、节距和蒴果重受加性-显性-上位性多基因控制,多基因遗传率分别为60.75%、62.14%、75.08%和82.34%。(4)应用主基因+多基因6个世代联合分析方法对烤烟丸叶×Coker319组合的几个生理性状进行了分析。结果表明,丸叶×Coker319组合的总叶绿素含量受1对加性-显性主基因+加性-显性-上位性多基因控制,主基因加性效应为-5.89,主基因显性效应为-3.47;B1、B2和F2世代总叶绿素含量的主基因遗传率分别为3.61%、46.11%和48.94%;多基因遗传率分别为52.04%、8.25%和0.00%,说明F2世代总叶绿素含量表现出较高的主基因遗传率,并受环境影响。对烤烟总叶绿素含量的改良要以主基因为主,同时注意环境的影响。光合速率和蒸腾速率受加性-显性-上位性多基因控制,多基因遗传率分别为20.69%和13.56%。气孔导度受2对加性-显性-上位性主基因+加性-显性-上位性多基因控制,以显性×显性上位性效应为主,B1、B2和F2世代气孔导度的主基因遗传率分别为58.03%、35.11%和40.59%;多基因遗传率分别为1.43%、21.34%和2.03%。

论文目录

  • 附件
  • 摘要
  • Abstract
  • 英文缩略表
  • 第一章 引言
  • 1.1 烟草种质资源及其研究现状
  • 1.1.1 我国烟草种质资源类型
  • 1.1.2 我国烟草种质资源现状
  • 1.1.3 我国烟草种质资源展望
  • 1.2 核心种质研究进展
  • 1.2.1 微核心种质的概念
  • 1.2.2 构建核心种质的数据
  • 1.2.3 种质材料的分组
  • 1.2.4 核心种质的评价
  • 1.2.5 核心种质的应用
  • 1.3 烟草相关数量性状“主基因+多基因”研究进展
  • 1.3.1 植物数量性状“主基因+多基因”混合遗传模型的主要环节
  • 1.3.2 植物数量性状“主基因+多基因”混合遗传模型在烟草中的应用
  • 1.4 本研究的目的意义、理论依据与技术路线
  • 1.4.1 本研究的目的意义
  • 1.4.2 本研究的理论依据和技术路线
  • 第二章 烟草核心引物的筛选
  • 2.1 材料与方法
  • 2.1.1 材料
  • 2.1.2 烟草叶片 DNA 提取
  • 2.1.3 SSR 引物筛选及扩增
  • 2.1.4 数据统计
  • 2.2 结果与分析
  • 2.2.1 供试种质的代表性检验
  • 2.2.2 SSR 核心引物的筛选及供试种质的标记多态性分析
  • 2.2.3 核心引物有效性验证
  • 2.3 总结和讨论
  • 第三章 烟草微核心种质构建及评价
  • 3.1 材料与方法
  • 3.1.1 材料与数据
  • 3.1.2 微核心种质取样规模
  • 3.1.3 微核心种质聚类方法
  • 3.1.4 微核心种质分组及取样策略
  • 3.1.5 微核心种质表型数据和分子数据加权整合比例
  • 3.1.6 统计分析
  • 3.2 结果与分析
  • 3.2.1 烟草微核心种质取样规模研究
  • 3.2.2 烟草微核心种质表型数据和分子数据加权整合研究
  • 3.2.3 烟草微核心种质聚类方法研究
  • 3.2.4 烟草微核心种质遗传距离研究
  • 3.2.5 烟草微核心种质抽样方法研究
  • 3.2.6 烟草微核心种质取样策略研究
  • 3.2.7 烟草微核心种质的构建结果
  • 3.2.8 烟草微核心种质的代表性评价
  • 3.3 讨论
  • 3.3.1 总体取样规模的确定
  • 3.3.2 利用数量性状和分子标记技术研究核心种质
  • 3.3.3 具体取样策略的确定
  • 3.3.4 关于主成分分析和相关系数评价
  • 3.4 结论
  • 3.4.1 关于取样规模
  • 3.4.2 关于表型数据和分子数据整合
  • 3.4.3 关于聚类方法
  • 3.4.4 关于遗传距离估算
  • 3.4.5 关于抽样方法
  • 3.4.6 关于取样策略
  • 3.4.7 最终结果
  • 第四章 烤烟几个重要植物学性状的遗传分析
  • 4.1 材料与方法
  • 4.1.1 试验材料
  • 4.1.2 试验方法
  • 4.2 结果与分析
  • 4.2.1 性状遗传方差分析及世代平均数分析
  • 4.2.2 性状的遗传模型
  • 4.2.3 性状遗传效应预测及遗传参数估计
  • 4.3 讨论
  • 4.3.1 性状遗传率比较
  • 4.3.2 性状基因效应分析
  • 4.4 结论
  • 第五章 烤烟几个生理性状的遗传分析
  • 5.1 材料和方法
  • 5.1.1 试验材料
  • 5.1.2 遗传设计
  • 5.1.3 数据分析
  • 5.2 结果与分析
  • 5.2.1 6 世代 SPAD 次数分布
  • 5.2.2 性状的遗传模型
  • 5.2.3 性状遗传效应预测及遗传参数估计
  • 5.3 讨论
  • 第六章 结论
  • 6.1 全文主要结论
  • 6.2 全文主要创新点
  • 6.3 关于核心种质的几点思考
  • 6.3.1 材料间遗传差异的准确评价
  • 6.3.2 抽样策略的合理应用
  • 6.3.3 核心种质的动态调整
  • 6.3.4 核心种质的代表性评价
  • 6.3.5 建立基因组计划重大专项应用核心种质
  • 6.4 关于“主基因+多基因”混合遗传模型的几点思考
  • 6.4.1 极端亲本材料的选择
  • 6.4.2 试验设计
  • 6.4.3 数据分析
  • 6.4.4 多年多点多时期数据的精准测定
  • 6.4.5 “主基因+多基因”混合遗传模型基因对数的拓展
  • 6.4.6 “主基因+多基因”混合遗传模型在烟草上的优先应用策略
  • 参考文献
  • 附录 部分微核心种质
  • 致谢
  • 作者简历
  • 相关论文文献

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