hsa-miRNA在皮肤黑素瘤中的表达及hsa-miRNA-21在黑素瘤细胞中的作用机制研究

hsa-miRNA在皮肤黑素瘤中的表达及hsa-miRNA-21在黑素瘤细胞中的作用机制研究

论文摘要

目的筛选在人皮肤黑素瘤中表达的已知hsa-microRNA,根据筛选结果,探讨相应的hsa-microRNA在该疾病中的功能,为阐明黑素瘤发病机制、寻求有效的治疗途径提供理论和实验依据。方法采用SBC microRNA芯片技术,将6例人皮肤黑素瘤组织总RNA分别与9例健康人色素痣总RNA的混合物对比,筛选其中已知的468条hsa-microRNA表达情况。根据生物信息学的有关方法处理芯片实验数据,筛选出共同差异表达的候选hsa-microRNA。采用荧光实时定量PCR的方法,分别检测这6例人皮肤黑素瘤组织中的各候选hsa-microRNA的表达情况。将芯片和qPCR两种方法结论一致的候选hsa-microRNA确定为有意义的共同差异表达hsa-microRNA。检测表达差异最明显的hsa-microRNA在A375和M14细胞系中的表达情况。采用microRNA-21 inhibitor脂质体瞬时转染黑素瘤细胞系,设立对照组,并设立microRNA-21 inhibitor 90nmol/L、180 nmol/L、270 nmol/L三个浓度,分别用CCK-8试剂盒检测细胞活性变化,并分析该浓度与细胞活性之间的关系。将活性变化最明显的一组细胞系用FCM术检测细胞周期与细胞凋亡的改变,同时用RT-PCR法检测其中的BRAF和p27基因mRNA表达水平。结果1、此6例人皮肤黑素瘤中miRNA-21明显上调表达,miRNA-320和miRNA-494明显下调表达。2、黑素瘤细胞系A375和M14中均有miRNA-21不同程度的表达。3、将miRNA-21 inhibitor转染A375和M14细胞,当抑制剂浓度为90nmol/L时,细胞活性受到明显抑制;提高抑制剂浓度,A375细胞活性受到进一步抑制,且二者之间存在相关性。4、经转染miRNA-21 inhibitor且细胞活性发生明显抑制的A375细胞,其G1期细胞比率明显增高,而S期细胞比率明显降低,细胞凋亡比率增高。5、经转染miRNA-21 inhibitor且细胞活性发生明显抑制的A375细胞中的BRAF基因和p27基因mRNA表达水平没有明显变化。结论运用miRNA芯片技术,首次发现人皮肤黑素瘤组织中miRNA-21明显上调表达,miRNA-320和miRNA-494明显下调表达。miRNA-21在黑素瘤细胞中抑制细胞凋亡、促进细胞增殖,可能起原癌基因样的作用。miRNA-21对BRAF和p27基因的mRNA表达水平无明显影响。

论文目录

  • 缩略语
  • 前言
  • 参考文献
  • 摘要
  • Abstract
  • 第一部分 人皮肤黑素瘤中microRNA表达的研究
  • 第一节 实验材料、试剂及仪器
  • 一、临床标本
  • 二、主要试剂及溶液的配制
  • 三、主要仪器及软件
  • 四、人microRNA芯片V1.0
  • 第二节 实验方法
  • 一、miRNA的提取
  • 二、miRNA样品标记
  • 三、miRNA芯片杂交
  • 四、miRNA芯片清洗
  • 五、数据分析
  • 六、RT-qPCR验证差异表达的miRNA
  • 第三节 结果
  • 一、总RNA的质量检测
  • 二、总RNA的电泳图
  • 三、芯片杂交图像
  • 四、二倍以上差异表达的miRNA
  • 五、芯片检出率
  • 六、散点图
  • 七、聚类分析
  • 八、芯片筛选的共同差异表达miRNA
  • 九、RT-qPCR对芯片结果的验证
  • 十、经RT-qPCR验证的共同差异表达miRNA
  • 第四节 讨论
  • 参考文献
  • 第二部分 microRNA-21在人黑素瘤细胞系中的表达及其功能的初步研究
  • 第一节 实验试剂、材料及仪器
  • 一、主要试剂及溶液的配制
  • 二、主要仪器及耗材
  • 第二节 实验方法
  • 一、miRNA的提取
  • 二、miRNA-21定量检测
  • 三、细胞转染
  • 四、细胞增殖试验
  • 五、细胞转染效率
  • 六、流式细胞术检测凋亡细胞DNA含量
  • 七、流式细胞术检测A375细胞凋亡
  • 第三节 结果
  • 一、细胞总RNA的提取与质量检测
  • 二、miRNA-21在细胞中的表达
  • 三、细胞转染效率
  • 四、细胞增殖的变化
  • 五、细胞周期的变化
  • 六、细胞凋亡的变化
  • 第四节 讨论
  • 参考文献
  • 第三部分 microRNA-21影响人黑素瘤细胞活性的机制研究
  • 第一节 实验试剂、材料及仪器
  • 一、主要试剂及溶液的配制
  • 二、主要仪器
  • 第二节 实验方法
  • 一、细胞培养与转染
  • 二、提取A375细胞总RNA
  • 三、半定量逆转录PCR(RT-PCR)
  • 第三节 结果
  • 一、细胞转染效率
  • 二、A375细胞总RNA的提取与质量检测
  • 三、miRNA-21 inhibitor对A375细胞中BRAF与p27基因mRNA表达的影响
  • 第四节 讨论
  • 参考文献
  • 全文小结
  • 一、创新与结论
  • 二、不足与展望
  • 论文相关综述
  • 研究生就读期间发表论文及参加学术活动情况
  • 致谢
  • 相关论文文献

    标签:;  ;  ;  ;  ;  ;  ;  

    hsa-miRNA在皮肤黑素瘤中的表达及hsa-miRNA-21在黑素瘤细胞中的作用机制研究
    下载Doc文档

    猜你喜欢