猪戊型肝炎病毒感染性克隆及复制子的构建

猪戊型肝炎病毒感染性克隆及复制子的构建

论文摘要

戊型肝炎是由戊型肝炎病毒引起的一种急性、自限性人畜共患传染病,该病主要经粪—口途径传播,临床病变以黄疸为主。主要暴发于发展中国家。继1988-1989年我国新疆暴发戊型肝炎后,该病在我国开始散在分布。1997年,美国学者Meng等首次在猪血清中分离到戊型肝炎病毒,随后在其他各国也相继报道了猪的戊型肝炎病毒,主要是HEV基因Ⅲ型和Ⅳ型,在我国养猪业以基因型Ⅳ型为主。本实验室检测并分离到的戊型肝炎病毒从属于基因Ⅳ型,相关报道显示,人所感染的戊型肝炎病毒的基因序列与猪的戊型肝炎病毒的基因序列相比,基因Ⅳ型的同源性最高。由于缺乏有效的体外培养系统,对戊型肝炎病毒的复制及其转录机制的研究进展相当缓慢。为了打破这一瓶颈,panda等在2000年引入了感染性克隆技术。鉴于以上基础,本实验对在华中地区戊型肝炎阳性病料中的病毒进行了感染性克隆以及复制子的研究,主要内容包括:(1)戊型肝炎病毒感染性克隆质粒的构建在已经测通的WH09株HEV的全基因组序列的基础上,将HEV的全长分割成5个片段分别设计引物进行克隆,测序,序列比对正确后将其按照全长基因组的顺序依次连在pCDNA3.1载体上,得到了含有戊型肝炎病毒全基因组的重组质粒。(2)戊型肝炎病毒感染性克隆质粒恢复病毒活性的验证将质粒在末端(载体上)线性化,纯化后转染肝癌细胞PLC/PRF/5,进一步通过RT-PCR方法检测到戊型肝炎病毒能够在细胞中复制三代,且随着复制代数增加其活性也会逐渐消失,通过IFA的方法能够检测到病毒蛋白的表达。(3)戊型肝炎病毒的复制子质粒的构建与复制能力的恢复验证在戊型肝炎病毒的全基因组中缺失掉部分结构基因,插入易于检测的外源基因,构建了分别含有外源基因IRES-EGFP、IRES-Luc的复制子,进行验证,含有IRES-EGFP的复制子没能找到发光的细胞,结果显示含有IRES-Luc的复制子经过双荧光素酶的检测能够检测到Luc的表达,对缺失掉ORF1部分的缺失体进行验证发现几乎检测不到Luc的表达,从而证实了Luc的表达依赖复制子本身的自复制能力。(4)复制子细胞系的构建将证实能够表达的复制子HEV-IRES-Luc构建细胞系,使其能够稳定表达,为今后的研究建立平台。

论文目录

  • 摘要
  • Abstract
  • 缩略语表(Abbreviation)
  • 第1章 文献综述
  • 1.1 戊型肝炎的研究进展
  • 1.1.1 戊型肝炎的病原学
  • 1.1.2 戊型肝炎的的流行病学
  • 1.1.3 戊型肝炎的临床症状和病理变化
  • 1.1.4 戊型肝炎的诊断与预防
  • 1.2 RNA病毒的感染性克隆的研究
  • 1.2.1 感染性克隆的构建及其转录本的产生
  • 1.2.2 RNA病毒的感染性克隆的研究进展
  • 1.3 复制子的研究进展及其展望
  • 1.3.1 RNA复制子载体的研究
  • 1.3.2 HEV复制子的研究进展与展望
  • 第2章 试验目的与意义
  • 第3章 材料与方法
  • 3.1 实验材料
  • 3.1.1 毒株与细胞
  • 3.1.2 菌种与质粒
  • 3.1.3 主要药品与试剂
  • 3.1.4 主要培养基
  • 3.1.5 主要缓冲液
  • 3.1.6 本研究中所用的寡核苷酸引物
  • 3.2 实验方法
  • 3.2.1 病料的处理
  • 3.2.2 RNA的提取
  • 3.2.3 RT-PCR
  • 3.2.4 PCR产物的回收和纯化
  • 3.2.5 大肠杆菌感受态细胞的制备
  • 3.2.6 连接产物的转化
  • 3.2.7 质粒的制备与鉴定
  • 3.2.8 质粒的线性化与去磷酸化
  • 3.2.9 细胞的培养
  • 3.2.10 细胞的转染
  • 3.2.11 间接免疫荧光
  • 第4章 结果与分析
  • 4.1 感染性克隆的构建
  • 4.1.1 HEV-1的克隆
  • 4.1.2 HE-2的克隆
  • 4.1.3 HEV-3的克隆
  • 4.1.4 HE-4的克隆
  • 4.1.5 HE-5的克隆
  • 4.1.6 全长质粒的构建
  • 4.2 全长质粒的验证
  • 4.2.1 RT-PCR验证
  • 4.2.2 间接免疫荧光试验鉴定
  • 4.3 复制子的构建
  • 4.3.1 缺失体的构建
  • 4.3.2 外源基因IRES-EGFP、IRES-Luc的克隆
  • 4.3.3 复制子HEV-IRES-Luc、HEV-IRES-EGFP的构建
  • 4.3.4 缺失体的构建
  • 4.4 复制子的验证
  • 4.5 复制子HEV-IRES-Luc的细胞系的构建及其鉴定结果
  • 第5章 讨论与结论
  • 5.1 讨论
  • 5.1.1 研究HEV遇到问题及其解决方法
  • 5.1.2 复制子细胞系的应用研究
  • 5.2 结论
  • 参考文献
  • 致谢
  • 相关论文文献

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