高山离子芥MAP激酶基因CbMAPK3的克隆及功能分析

高山离子芥MAP激酶基因CbMAPK3的克隆及功能分析

论文摘要

为了适应各种生物胁迫和非生物胁迫,植物在长期进化过程中形成了完整的调节机制,感受外界刺激,调整基因的表达,调节代谢途径。通过完整的信号调节系统,激活或者抑制适当的基因以响应外界刺激。由促分裂原活化蛋白激酶(MAPK)、促分裂原活化蛋白激酶激酶(MAPKK)、促分裂原活化蛋白激酶激酶激酶(MAPKKK)组成的磷酸化级联途径在酵母和动物细胞中,起着重要的信号传递作用。植物中,鉴定出了多种MAP激酶基因,大量的研究表明植物MAPK激酶可以被激素,非生物胁迫,病原体侵染所激活,也可以在细胞分裂的特定时期被激活。 高山离子芥是稀有的高山冰缘植物,具有较高的适应寒冷环境的能力。由于高山离子芥是一种胁迫耐受植物,我们克隆得到了高山离子芥中与抗逆境胁迫有关的MAP激酶基因CbMAPK3,并通过RT—PCR和Western blotting分析等方法研究了MAPK在高山离子芥抵御非生物胁迫过程中所发挥的作用。研究结果如下: (1) 获得了高山离子芥MAP激酶基因CbMAPK3,全长1419bp,其中包括1110bp的开放阅读框(ORF),91bp的5′非翻译区(5′UTR),218bp的3′非翻译区(3′UTR),包括15bp的polyA。该基因编码一个369个氨基酸的蛋白质,分子量42.5kDa,等电点(PI)5.79。由于该基因与拟南芥AtMPK3同源性最高,达到了90%以上,因此命名为CbMAPK3(genbank accession number:AY805424)。CbMAPK3包含有MAP激酶所具有的11个保守序列区,以及MAP激酶的磷酸化位点TEY基序。因此该基因很可能编码一个MAP激酶蛋白。 (2) 序列分析结果显示,该蛋白与植物抗逆境胁迫有关的MAP激酶亚组A有很高的同源性,CbMAPK3与Arabidopsis AtMPK3同源性最高,达到了95%,其次是 Nicotiana tabacum NtWIPK(82%),Capsicum annuum CaMPKI(81%),PsMAPK3(80%),Medicago sativa MsMMK4(80%),Petrosecinum crispum PARSLEY MAPK(80%)。应用SOPMA在线分析将CbMAPK3预测蛋白序列进行二级结构预测,结果显示,CbMAPK3预测蛋白序列包含46%α—螺旋(alpha helix),13%伸展链 (extended strand),6%β—转角(beta turn),35%无规卷曲(random coil)。α—螺旋和无规卷曲为该蛋白的主要二级结构。

论文目录

  • 致谢
  • 缩写词表
  • 摘要
  • Abstract
  • 第一章 前言
  • 植物MAPKs级联途径成分
  • MPAKs级联在植物逆境反应中的作用
  • MAPKs与病原体响应
  • MAPKs与植物激素信号调节
  • MAPKs级联在决定细胞周期和发育中的作用
  • 未来的研究方向
  • 本论文的研究意义
  • 第二章 高山离子芥MAP激酶基因CbMAPK3的克隆
  • 1.实验材料
  • 2.实验方法
  • 2.1 高山离子芥总RNA的提取及反转录
  • 2.2 MAP激酶基因CbMAPK3片段的克隆(530bp)
  • 2.3 MAP激酶基因CbMAPK3片段的克隆(1030bp)
  • 2.4 RACE
  • 2.5 高山离子芥MAP激酶基因CbMAPK3全长基因的扩增
  • 2.6 分子生物学软件分析
  • 3.实验结果与讨论
  • 3.1 高山离子芥愈伤组织总RNA的提取
  • 3.2 MAP激酶基因CbMAPK3的克隆(530bp)
  • 3.3 MAP激酶基因CbMAPK3的克隆(1030bp)
  • 3.4 3`RACE
  • 3.5 5`RACE
  • 3.6 全长高山离子芥MAP激酶基因CbMAPK3的克隆
  • 3.7 登录Genbank的结果
  • 3.8 构建植物MAP激酶基因序列的系统发生树
  • 3.9 CbMAPK3与部分植物MAP激酶基因氨基酸序列比对
  • 3.10 等电点及分子量计算
  • 3.11 二级结构预测
  • 3.12 CbMAPK3蛋白中磷酸化位点的预测
  • 4.小结
  • 第三章 高山离子芥CbMAPK3激酶在抗逆境胁迫中的功能研究
  • 1 材料与方法
  • 1.1 逆境胁迫下CbMAPK3基因在转录水平的变化
  • 1.2 CbMAPK3基因组织特异性表达检测
  • 1.3 逆境胁迫下CbMAPK3基因在蛋白水平的变化
  • 1.4 CbMAPK3基因功能互补分析
  • 2.实验结果
  • 2.1 逆境胁迫下CbMAPK3基因在转录水平的变化
  • 2.2 CbMAPK3基因组织特异性表达检测
  • 2.3 逆境胁迫下CbMAPK3基因在蛋白水平的变化
  • 2.4 CbMAPK3基因功能互补分析
  • 3.讨论
  • 第四章 高山离子芥CbMAPK3基因在E.coli BL21中的表达
  • 1.实验方法
  • 1.1 目的基因的扩增
  • 1.2 目的基因与表达载体pET30a的连接
  • 1.3 大肠杆菌JM109感受态细胞的制备
  • 1.4 连接产物的转化
  • 1.5 碱裂解法小量提取质粒
  • 1.6 重组质粒的鉴定
  • 1.7 重组表达质粒的诱导表达
  • 1.8 表达产物的SDS—PAGE电泳检测
  • 1.9 表达产物的Western blotting分析
  • 2.实验结果与讨论
  • 2.1 重组表达载体的构建
  • 2.2 重组表达质粒的电泳鉴定
  • 2.3 重组表达质粒酶切及PCR鉴定
  • 2.4 表达产物检测
  • 3.讨论
  • 参考文献
  • 博士期间发表的文章
  • 相关论文文献

    • [1].高山离子芥CbMAPK3基因功能分析[J]. 植物生理学通讯 2010(08)
    • [2].高山离子芥CbMAPK3基因克隆与原核表达[J]. 植物研究 2009(06)
    • [3].高山离子芥MAP激酶基因CbMAPK3的克隆[J]. 植物生理学通讯 2010(04)

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