导读:本文包含了免培养法论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献，主要关键词:免培养,川金丝猴,肠道内生细菌,多样性
免培养法论文文献综述
杨曼,兰阿峰,郭素芬,丁小维,邓百万[1]（2014）在《免培养法研究野生川金丝猴肠道内生细菌多样性》一文中研究指出【目的】了解野生川金丝猴(Rhinopithecus roxellana)肠道内生细菌的组成及其多样性。【方法】提取川金丝猴肠道内生细菌总DNA,选用细菌通用引物799F和1492R对总DNA进行16S rRNA基因特异性扩增,构建川金丝猴肠道内生细菌16S rRNA基因克隆文库,对阳性克隆进行限制性内切酶片段长度多态性(PCR-RFLP)分析,并对HaeⅢ酶切带谱菌株进行测序,构建系统发育树。【结果】根据酶切带谱分析和测序结果,将随机挑取的157个阳性克隆归为27个不同的可操作分类单元(OTUs)。系统发育分析表明这些克隆序列有62.10%属于厚壁菌门(Firmicutes),其中包括梭菌属(Clostridium)、Cellulosilyticum属、Robinsoniella属、Anaerofustis属、Blautia属和Anaerovorax属,有37.90%属于未培养细菌。【结论】川金丝猴肠道内生细菌多样性丰富,并且可能存在新的分类单元。(本文来源于《微生物学通报》期刊2014年08期）
兰阿峰,杨曼,郭素芬,丁小维,邓百万[2]（2014）在《免培养法对大鲵肠道微生物多样性的研究》一文中研究指出【目的】了解大鲵肠道内生细菌的组成及多样性。【方法】采用美国Mo Bio公司试剂盒提取大鲵肠道内容物总DNA,选用细菌通用引物799F和1492R对总DNA进行16S rRNA基因特异性扩增,构建大鲵肠道内容物内生细菌16S rRNA基因克隆文库,对阳性克隆进行限制性内切酶片段长度多态性(PCR-RFLP)分析,并对HaeⅢ酶切带谱不同的菌液进行测序,构建系统发育树。【结果】根据酶切带谱分析和测序结果的不同,将随机挑取的101个阳性克隆归为28个不同的可操作分类单元(OTUs),系统发育分析表明这些克隆序列分别属于变形菌门(Proteobacteria)、梭菌门(Clostridia)、芽孢杆菌门(Bacilli)和衣原体门(Chlamydiae)4个门。其中,变形菌门(Proteobacteria,占克隆总数的92.08%)为最优势类群。序列比对结果表明这些克隆序列分别与已报道的20个属具有较高的相似性。此外,还有一个OTU在系统发育树上形成独立分支且未能确定其分类。【结论】大鲵肠道内生细菌多样性丰富,并且可能存在新的分类单元。(本文来源于《微生物学通报》期刊2014年07期）
叶光斌,董瑞丽,王彩虹,王毅,熊俐[3]（2013）在《基于免培养法的中高温大曲细菌群落结构研究》一文中研究指出通过构建细菌16S rRNA基因克隆文库、测序及构建系统发育树,对泸州老窖中高温大曲的细菌群落结构进行了研究。结果表明:中高温大曲的细菌组成较为丰富,且大部分与可培养的细菌类群相关,主要分布于芽孢杆菌纲、梭菌纲以及放线菌纲。其中芽孢杆菌纲内克隆子多样性最为丰富,主要包括乳杆菌属、乳球菌属、魏斯氏菌属、芽孢杆菌属、明串珠菌属、片球菌属和高温放线菌属;放线菌纲内克隆子分布于糖多孢菌属;梭菌纲内克隆子分布于Symbiobacterium和一个属级分类地位未知的梭菌纲内。中高温大曲内细菌的优势种群为魏斯氏菌(占全部克隆子比例的30.35%,2 OTUs)、高温放线菌(28.57%,2 OTUs)和乳杆菌(19.65%,6 OTUs)。(本文来源于《江苏农业科学》期刊2013年08期）
叶光斌,罗惠波,杨晓东,李丹宇,王毅[4]（2013）在《基于免培养法研究泸州地区浓香型白酒窖泥原核微生物群落结构》一文中研究指出通过构建细菌和古菌的16S rRNA基因克隆文库、测序及系统发育树分析,确定浓香型白酒成熟窖泥中细菌和古菌的群落组成。结果表明:窖泥中的细菌多样性丰富,多达34个OTUs。主要分布于14科以及2个科级分类地位未知的梭菌纲和拟杆菌纲类群内,且大多属于严格厌氧细菌。其中梭菌纲为窖泥内细菌群落的绝对优势种群(克隆子数比例为68.2%),除此之外还存在一定比例的芽孢杆菌纲(21.6%)、拟杆菌门(8.0%)、柔膜菌门(1.1%)和Synergistetes门(1.1%)的分布。古菌的群落组成较为简单,仅4个OTUs,主要分布于甲烷囊菌属、甲烷八迭球菌属、甲烷杆菌属和Methanomassiliicoccus内,克隆子数的比例分别为58.8%、29.4%、5.9%和5.9%。(本文来源于《食品科学》期刊2013年17期）
李辉,林匡飞,牟伯中,张卫,顾继光[5]（2011）在《培养法和免培养法联合检测油藏环境烃降解菌和产甲烷菌群多样性》一文中研究指出烃降解菌和产甲烷菌是油藏环境微生物生态系统中重要的功能菌群,采用DGGE和FISH方法分析了不同油藏样品中两类菌群的多样性和产甲烷活性。DGGE结果表明,不同水样的alkB基因多样性相差较大,而且注水井条带明显多于采油井。FISH结果表明,油藏水样中产甲烷菌含量明显高于烃降解菌,且两者空间分布的位置较近;说明油藏环境中烃降解菌和产甲烷菌结成一定的相互关系。富集培养表明,胜利油田产出液接种物培养130 d后,石油烃降解率达到50%以上,产甲烷的最大速率达到1.57×10-2 mmol/(L.d)。利用分子生物学方法分析油藏环境功能菌群的多样性,可以为开展微生物采油技术的应用提供有用信息。(本文来源于《微生物学通报》期刊2011年01期）
徐建华[6]（2010）在《免培养法对新疆热气泉土壤原核微生物多样性及生物地理的研究》一文中研究指出本文采用免培养方法研究了新疆热气泉土壤原核微生物多样性及生物地理。通过构建细菌和古菌16S rDNA克隆文库,分析新疆玛纳斯热气泉土壤细菌和古菌多样性。采用T-RFLP方法,分析新疆玛纳斯3眼和石河子1眼热气泉土壤硫氧化和硫循环菌多样性及其与环境因子、样点位置间关系。主要研究内容与实验结果如下:1.从新疆玛纳斯热气泉土壤细菌16S rDNA克隆文库中,随机挑选170个阳性克隆,用Hae III限制性内切酶进行RFLP分析,经分型测序,构建系统发育树,得到29个不同的分类单元(operational taxonomic unit,OTU)。系统发育分析归为6个门:酸杆菌门(Acidobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、厚壁菌门(Firmicutes)、变形菌门(Proteobacteria)和浮霉菌门(Planctomycetes),其中厚壁菌门(Firmicutes)为绝对优势类群,占整个细菌文库的71%。29个OTUs中有14条序列与GenBank中相关序列的相似性低于97%(序列长度约1.5 kb),占序列总数的48%。结果表明热气泉土壤细菌多样性较低,但存在大量潜在细菌新种。2.从新疆玛纳斯热气泉土壤古菌16S rDNA克隆文库中,随机挑选98个阳性隆子,用HhaⅠ限制性内切酶进行RFLP分析,经分型测序,构建系统发育树,共得到16个不同的分类单元(operational taxonomic unit,OTU)。系统发育分析均归为泉古菌门(Crenarchaeota),隶属于该门的两个分类单元(GroupⅠ和GroupⅡ)。结果表明栖息于热气泉土壤古菌中泉古菌占绝对优势。3.从新疆玛纳斯3眼热气泉和石河子市1眼热气泉土壤总DNA中扩增硫氧化和硫还原菌arp A基因后,进行T-RFLP分析,结合测定土壤环境因子参数,经聚类分析、主成分分析(PCA)和典型相关分析(CCA),结果表明土壤温度和pH值影响热气泉土壤硫氧化和硫还原菌多样性,即在一定范围内,土壤温度和pH值能预测土壤硫氧化和硫还原菌多样性,而与其它环境因子无关。4.从新疆玛纳斯3眼热气泉和石河子市1眼热气泉土壤总DNA中扩增细菌16S rDNA后,进行T-RFLP分析,并结合测定土壤环境因子参数,经聚类分析、主成分分析(PCA)和典型相关分析(CCA),结果表明除温度和pH值外的土壤有机质含量、铵态氮和硝态氮含量等理化因子影响土壤细菌多样性,此外样点间地理位置差异也影响土壤细菌多样性。(本文来源于《新疆大学》期刊2010-05-25）
胡佳[7]（2007）在《利用免培养法对浓香型白酒曲药细菌菌群的解析研究》一文中研究指出浓香型白酒的生产过程实际上包含了一个庞大的微生物区系的复杂代谢过程。这个庞大微生物区系的微生物来源主要是窖泥和曲药，这两者是糟醅微生物区系形成的基础。细菌是曲药微生物的重要组成部分，曲药中细菌的构成及其衍变情况对浓香型白酒的酒体风格的形成有重要影响。长期以来，由于受到科研力量分散以及研究方法单一等限制，广大科研工作者对曲药的研究和认识还非常有限。本研究选取的来自泸州老窖股份公司的中高温曲药块，每块曲粉碎混匀为混合曲样。以混合曲样作为分析对象。由于曲药组成成分复杂，本研究经过多次试验摸索，最后采用的是机械破碎法(玻珠破碎法)、酶处理法和表面活性剂处理相结合的方法成功提取到曲药中细菌的总DNA，然后对细菌的16S rDNA序列进行PCR扩增，利用纯化后的PCR扩增产物建立基因组文库，通过连接、转化、筛选阳性克隆等一系列步骤，测得曲药中细菌16S rDNA的近全序列。最后对曲药微生物进行了克隆分析、同源性比较和建立系统发育树，从而对曲药中不可培养细菌类微生物的构成有了更新的认识。利用免培养法取得的研究结果表明：在对曲药中细菌的分析中，共发现hj01代表的Uncul tured bets proteobacterium(AJ318110．1)紫细菌群(蛋白菌或变形杆菌)，hj03代表的Comamonas cf．acidovorans(AF181575．1)和Delftia acidovorans(AB020186．1)食酸丛毛单胞菌，hj02代表的Encultured bacterium(AB176235．1)不可培养杆菌，hj07代表的Dysgonomonas变形菌属mossii(AJ319867．2)，hj04代表的Uncultured Bacteroidetes bacterium(AJ318110．1)不可培养拟杆菌类群，hj06代表的Dysgonomonas wimpennyi(AY643492．1)，hj05代表的Delftia tsuruhatensis(AY899912．1)，hjl2代表的Pseudomonas sp．(AJ704794．1)假单孢菌属，hj11代表的Arthrobacter sp．(AJ810897．1)节杆菌属以及hjl3代表的Nocardiopsis sp．(AM236241．1)拟诺卡氏属。其中，Deiftia acidovorans，Dysgonomonas mossii，Dysgonomonas wimpennyi，Uncultured Bacteroidetes bacterium，Deiftia tsuruhatensis，Arthrobacter sp．，Nocardiopsis sp．等多个细菌类群在白酒糟醅及曲药中的发现尚未见有关报道。系统发育分析结果表明，在进化树上，Uncultured beta proteobacterium，Comamonas cf．acidovorans/Delftia acidovorans，Uncultured bacterium这四大菌群的亲缘关系比较近，Dysgonomonas mossii，Uncultured Bacteroidetes bacterium和Dysgonomonas wimpennyi这叁大菌群的亲缘关系比较近，Delftia tsuruhatensis，Pseudomonas sp．和Arthrobacter sp．以及Nocardiopsis sp．的亲缘关系比较近。而这叁大类分别属于不同的分支，相互之间亲缘关系也比较远，表明曲药中的细菌有着很高的生物多样性。从以上鉴定到的细菌类群来看，与已有的研究报告有一定的相似性，也有一定的差异性。相似性表现在，已有研究报告中利用传统的细菌分类方法都检出曲药中假单孢菌属为其优势菌，本次研究应用免培养法也检出假单孢菌。而微生物区系研究结果的差异性表现在很多方面，比如一些学者通过常规方法所鉴定到的大曲中常见的乳酸菌，醋杆菌等，免培养法却没有鉴定出相关菌种。大曲生产是传统工艺，自然培菌，网罗和富集环境中的微生物。而环境中的微生物种类和数量受自然地域条件的影响。我国地域辽阔，环境、气候千差万别，生产的大曲质量也不稳定。这些估计与各酿酒厂的地理气候及土质、曲药生产工艺差异以及实验方法不同等诸多因素有关。特别是利用分子生物学分析获得的一些在微生物分类学上尚未定性以及一些在常规分析鉴定方法中尚未被报道的细菌微生物菌系，其在曲药中的地位和作用，尚有待作进一步的研究。(本文来源于《四川大学》期刊2007-04-15）
林毅,洪雪梅,蔡丽希,方光伟,彭锟[8]（2005）在《重金属污染土壤中泛基因组的提取及其细菌种类的免培养法分析》一文中研究指出采用玻璃粉吸附法提取重金属污染土壤的泛基因组,利用细菌16SrDNA保守区段B2/B3为引物,经PCR扩增获得包含V8和V9两个高变区的大小为1050bp的产物.将回收纯化的PCR产物与克隆载体pMD18-T连接,转化大肠杆菌DH5α感受态细胞,经抗生素抗性和蓝白斑筛选,并提取质粒作酶切分析,随机挑取3个阳性克隆菌进行序列测定,结果表明3个序列所代表的均是芽孢杆菌属(Bacillus)细菌,而且均是与Bacillusflexus亲缘关系非常接近的细菌.(本文来源于《漳州师范学院学报(自然科学版)》期刊2005年01期）
王涛,柴丽红,崔晓龙,彭谦,姜成林[9]（2003）在《免培养法对一热泉细菌多样性的初步研究》一文中研究指出应用免培养法 (Culture independent)对云南腾冲热海大滚锅高温热泉中细菌的多样性进行初步的分析。经过克隆筛选 ,测定了 5个克隆的 1 6SrDNA插入片段的近全序列 ,系统发育分析的结果表明 ,它们分属于Bacillus、Hydrogenobacter和Pseudomonas,有一个克隆尚难确定其分类地位 ,它属于Thermodesulfobacteriaceae科 ,介于Geothermbacterium属和Thermodesulfo bacteria属之间。经PCR扩增出上述 5个克隆 1 6SrDNA插入序列中及环境样品总DNA中的1 6SrDNAV8高变区约 60 0bp片段 ,进行变性梯度电泳 (DGGE)。所得电泳图谱和 5个序列的系统发育树不仅表明该高温热泉存在着丰富的细菌多样性 ,还显示了它们是该高温热泉中细菌的优势物种(本文来源于《微生物学报》期刊2003年05期）
免培养法论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
【目的】了解大鲵肠道内生细菌的组成及多样性。【方法】采用美国Mo Bio公司试剂盒提取大鲵肠道内容物总DNA,选用细菌通用引物799F和1492R对总DNA进行16S rRNA基因特异性扩增,构建大鲵肠道内容物内生细菌16S rRNA基因克隆文库,对阳性克隆进行限制性内切酶片段长度多态性(PCR-RFLP)分析,并对HaeⅢ酶切带谱不同的菌液进行测序,构建系统发育树。【结果】根据酶切带谱分析和测序结果的不同,将随机挑取的101个阳性克隆归为28个不同的可操作分类单元(OTUs),系统发育分析表明这些克隆序列分别属于变形菌门(Proteobacteria)、梭菌门(Clostridia)、芽孢杆菌门(Bacilli)和衣原体门(Chlamydiae)4个门。其中,变形菌门(Proteobacteria,占克隆总数的92.08%)为最优势类群。序列比对结果表明这些克隆序列分别与已报道的20个属具有较高的相似性。此外,还有一个OTU在系统发育树上形成独立分支且未能确定其分类。【结论】大鲵肠道内生细菌多样性丰富,并且可能存在新的分类单元。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
免培养法论文参考文献
[1].杨曼,兰阿峰,郭素芬,丁小维,邓百万.免培养法研究野生川金丝猴肠道内生细菌多样性[J].微生物学通报.2014
[2].兰阿峰,杨曼,郭素芬,丁小维,邓百万.免培养法对大鲵肠道微生物多样性的研究[J].微生物学通报.2014
[3].叶光斌,董瑞丽,王彩虹,王毅,熊俐.基于免培养法的中高温大曲细菌群落结构研究[J].江苏农业科学.2013
[4].叶光斌,罗惠波,杨晓东,李丹宇,王毅.基于免培养法研究泸州地区浓香型白酒窖泥原核微生物群落结构[J].食品科学.2013
[5].李辉,林匡飞,牟伯中,张卫,顾继光.培养法和免培养法联合检测油藏环境烃降解菌和产甲烷菌群多样性[J].微生物学通报.2011
[6].徐建华.免培养法对新疆热气泉土壤原核微生物多样性及生物地理的研究[D].新疆大学.2010
[7].胡佳.利用免培养法对浓香型白酒曲药细菌菌群的解析研究[D].四川大学.2007
[8].林毅,洪雪梅,蔡丽希,方光伟,彭锟.重金属污染土壤中泛基因组的提取及其细菌种类的免培养法分析[J].漳州师范学院学报(自然科学版).2005
[9].王涛,柴丽红,崔晓龙,彭谦,姜成林.免培养法对一热泉细菌多样性的初步研究[J].微生物学报.2003