湘西黄牛遗传多样性及微卫星标记与生长发育性状相关性研究

论文摘要

本试验利用6对微卫星标记对湘西黄牛群体进行了研究。利用SAS软件GLM过程，分析微卫星座位及等位基因对湘西黄牛体长、胸深等8个性状的影响；并对湘西黄牛的遗传多样性进行了分析；此外，根据Nei’s遗传距离，对湘西黄牛、鲁西牛、晋南牛、秦川牛、南阳牛和延边牛进行了聚类分析。主要结果如下：1．微卫星IDVGA27对湘西黄牛胸围、胸深的影响达到显著水平(P＜0.05)，其等位基因144bp对胸深和胸围的正效应都最大；ETH10和BM2113对胸深的影响显著(P＜0.05)，对胸深的正效应较大的等位基因分别是248bp和158bp；BM2113对腰角宽有显著影响(P＜0.05)，等位基因158bp正效应最大；BM2113和BM1824对十字部高的影响达到显著水平(P＜0.05)，对应等位基因141bp和169bp的正效应较大。2．6对微卫星引物在湘西黄牛中共检测到65个等位基因，平均每对引物上检测到9.3个等位基因。有效等位基因数在5.6583～11.1312之间，平均有效等位基因7.8759个，等位基因在湘西黄牛群体中的分布很均匀。3．微卫星座位在湘西黄牛群体中观测杂合度范围在0.8231～0.9102间，平均杂合度为0.8669。期望杂合度为0.8432～0.9175，平均期望杂合度为0.8829。平均多态信息含量(PIC)为0.8297，最小的是BM2113(0.7998)，最大的是ETH10(0.9032)。6个座位的PIC值均大于0.5，都是高度多态性的。湘西黄牛遗传多样性丰富，具有较大的遗传潜力，可承受的选择压比较大。4．湘西黄牛不同产区间分化水平不高，个体迁移普遍，固定指数(Fst)0.3670，基因流(Nm)0.4312。经x~2检验，湘西黄牛群体在6个位点都处于哈—温不平衡状态。5．根据Nei’s遗传距离，将鲁西牛、南阳牛、秦川牛和晋南牛聚为一类，延边牛与这四个品种的遗传距离稍远，因此延边牛单独划为一类。湘西黄牛与5个品种的遗传距离都相当大，单独归为一类。

论文目录

• 摘要
• Abstract
• 一 综述
• 1 中国黄牛的起源、进化与分类
• 2 湘西黄牛介绍
• 3 群体遗传多样性
• 3.1 遗传多样性的定义及研究意义
• 3.2 遗传多样性的的测度
• 4 关于微卫星序列
• 4.1 微卫星的多态性
• 4.2 微卫星位点的保守性
• 4.3 微卫星的形成
• 4.5 微卫星标记在牛中的应用
• 5 本研究的目的和意义
• 二 材料与方法
• 1 材料
• 1.1 试验样品
• 1.2 主要药品
• 1.3 主要试剂和缓冲液的配置
• 1.4 微卫星座位选择
• 1.5 主要设备和仪器
• 2 方法
• 2.1 血液中DNA的提取
• 2.2 PCR反应体系和条件
• 2.3 非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳,银染
• 2.4 体重计算及体尺测量方法
• 2.5 计算方法
• 2.6 统计分析
• 三 结果与分析
• 1 DNA提取结果
• 2 聚丙烯酰胺凝胶电泳、银染
• 3 微卫星标记与生长发育性状之间的关系
• 4 湘西黄牛遗传多样性
• 4.1 等位基因、等位基因频率
• 4.2 特有等位基因和缺失等位基因
• 4.3 等位基因数和有效等位基因数
• 4.4 期望杂合度、观测杂合度、多态信息含量
• 5 群体遗传分化、哈—温平衡检验及基因流分析
• 6 遗传距离
• 四 讨论
• 4.1 研究群体遗传结构和遗传变异的抽样方法和样本含量
• 4.2 微卫星DNA标记的数目
• 4.3 与湘西黄牛部分体尺相关的微卫星标记
• 4.4 关于群体等位基因、有效等位基因和遗传杂合度
• 4.5 多态信息含量（PIC）
• 4.6 F统计量（Fst、Fis、Fit）、基因流
• 4.7 湘西黄牛群体哈-温平衡检验
• 4.8 遗传距离
• 结论
• 1 主要结论
• 2 本研究的创新点
• 3 本研究的不足
• 参考文献
• 致谢
• 作者简历