嗜热厌氧梭菌降解纤维素及产氢特性研究

嗜热厌氧梭菌降解纤维素及产氢特性研究

论文摘要

木质纤维素是最丰富的可再生资源和能够转化成燃料的底物,将纤维质的生物量转化为可再生能源具有重大的意义。由于纤维素具有高度有序、紧密结合的晶体结构,又与半纤维素相联结,外周还由木质素包围,要把它直接水解成可利用的葡萄糖相当困难。目前对木质纤维素酶解多使用来源于丝状真菌的纤维素酶,但由于酶降解效率低下,酶解过程受产物抑制,酶蛋白不耐高温等,制约了其大规模应用。某些纤维素降解菌,如热纤梭菌具有高效的纤维素降解复合体——纤维小体,能有效降解纤维素,具有直接把生物质转化为乙醇和H2的能力,为利用一种微生物直接转化生物质的设想提供了可能。但在利用热纤梭菌进行乙醇发酵过程中往往伴有乙酸和丁酸等副产物的产生,而且最终产物的最高积累浓度仅为3%左右,只及酿酒酵母与发酵单胞菌属的25~30%。利用DNA重组技术重新设计糖酵解途径,阻断副产物的形成路线,解除乙醇生物合成的代谢阻遏作用,同时提高细胞对高浓度乙醇的耐受性,是高产乙醇的梭菌属工程菌构建的主要内容。高温厌氧菌还具有产H2的能力。氢气具有热值高,无污染的特点。生物产氢包括光合产氢和发酵产氢。发酵产氢需要设备简单,不需光照,但H2的摩尔产量低和原材料价格高仍是未解决的问题。发酵产氢只能利用有机物降解的15%能量。因此提高H2的产量将是今后研究的重点。另外,也可利用两步法,将发酵产氢与光合产氢或与产甲烷结合,提高对生物质的利用效率。使用纤维素或废水产氢,可降低原料的成本。本论文通过研究嗜热厌氧纤维素降解菌的降解特性,对其纤维素酶系和调控机制有更深入的了解,同时可利用其能够转化纤维素生成氢气的特性,研究纤维素发酵产氢的可行性。本论文的主要研究内容如下:1.嗜热厌氧纤维素降解菌的筛选与鉴定以纤维素为唯一碳源,对嗜热厌氧纤维素降解菌进行富集。采用纤维素粉和纤维二糖滚管法对富集后的菌群进一步纯化,得到纤维素降解菌JN4和其伴生菌GD17。JN4能有效降解微晶纤维素和滤纸,也可利用玉米芯粉、玉米秸粉、木糖渣等天然底物作为碳源生长,GD17在富集液中数量较多,能利用纤维二糖、葡萄糖和木糖生长。通过形态观察,生理生化特性和16S rDNA分析进行鉴定,确定JN4为热纤梭菌(Clostridium thermocellum),GD17为热解糖高温厌氧杆菌(Thermoanaerobacterium thermosaccharolyticum)。2.C.thermocellum JN4和伴生菌T.thermosaccharolyticum GD17的生长和产氢特性以纤维二糖为碳源,确定了C.thermocellum JN4和T.thermosaccharolyticumGD17的最适生长温度为55~60℃,并进行了生长曲线的测定。利用GC和HPLC对发酵产物的分析表明,C.thermocellum JN4分解纤维素生成H2、乙酸、乙醇和乳酸,T.thermosaccharolyticum GD17可利用各种还原糖生成乙酸、乙醇、乳酸和丁酸。C.thermocellum JN4可降解微晶纤维素、滤纸,未经预处理的玉米秸粉和玉米芯粉。对C.thermocellum JN4的胞外蛋白酶活测定表明,C.thermocellum JN4以微晶纤维素为碳源生长时,发酵液具有CMC酶活、磷酸膨胀纤维素酶活和微晶纤维素酶活。以纤维二糖为碳源时,C.thermocellum JN4的H2产率(YH2)约为0.7mol H2/mol二糖;以纤维二糖、葡萄糖和木糖为碳源时,T.thermosaccharolyticum GD17的H2产率(YH2)分别为4mol H2/mol纤维二糖,2.2mol H2/mol葡萄糖和1.7mol H2/mol木糖。3.C.thermocellum JN4单独培养和与T.thermosaccharolyticum GD17混合培养利用纤维素生长和产氢的动力学研究以微晶纤维素为碳源,研究了厌氧管内C.thermocellum JN4单独培养和与T.thermosaccharolyticum GD17混合培养的生长和产氢动力学。结果表明单独培养C.thermocellum JN4可有效降解0.5%微晶纤维素,生长后期有纤维二糖、葡萄糖的积累,乳酸、乙酸和乙醇的量逐渐增加,到60 h达到稳定,产H2能力为0.8 mol H2/mol葡萄糖。加入伴生菌T.thermosaccharolyticum GD17,与Cthermocellum JN4共同培养,可将C.thermocellum JN4产生的纤维二糖和葡萄糖完全利用,乙酸和乙醇产量与C.thermocellum JN4单独接种相比变化不大,有端岵?并在60 h后仍有增长,乳酸产生在60 h之后开始下降,最终完全检测不到,而混合菌的产H2能力提高到1.8 mol H2/mol葡萄糖。4.2L反应器中C.thermocellum JN4单独培养和与T.thermosaccharolyticumGD17混合培养利用纤维素的生长和产氢情况用自制的2L厌氧反应器在不控制pH的情况下,以滤纸为碳源单独培养C.thermocellum JN4,产氢量约为18mmol/1培养基,其它发酵产物有乙酸、乳酸和乙醇,其中乙醇的含量较高,达到24 mmol/1培养基以上,显示该菌有改造成为纤维素乙醇生产菌的可能。与用厌氧管培养不同,发酵液中没检测到纤维二糖和葡萄糖,表明扩大培养较有利于JN4的生长和代谢。C.thermocellum JN4与T.thermosaccharolyticum GD17混合培养,在不控制pH的情况下,产氢量约为35mmol/1培养基,其它发酵产物有乙酸、乳酸、丁酸和乙醇。乳酸含量在50h到达最高,然后逐渐减少,同时丁酸含量逐渐增加,与厌氧管培养结果相似。控制pH在pH6.0-6.5,产氢量约为25mmol/1培养基,比不控制pH要少。其它发酵产物中,乳酸含量最高,这表明pH在6.0-6.5的情况下,更有利于乳酸的生成,造成产氢量的减少。如果延长培养时间,T.thermosaccharolyticum GD17可利用乳酸,会有更多的H2产生。5.C.thermocellum JN4外切葡聚糖酶基因celS的原核表达以C.thermocellum JN4的基因组为模板,以C.thermocellum ATCC 27405的celS基因为参考设计引物,PCR扩增得到的序列与Genbank的已知序列进行比对,结果表明扩增获得的片段为celS基因,且与Clostridium thermocellum ATCC27405的celS基因仅有3个碱基的差异。将C.thermocellum JN4的celS基因和质粒pET-22b连接,构建表达载体,并利用大肠杆菌BL21(DE3)进行CelS的异源表达,得到的重组蛋白rCelS具有水解磷酸膨胀纤维素的能力。6.C.thermocellum JN4外切葡聚糖酶基因CelS的定点突变结合蛋白质结构生物学信息,对C.thermocellum JN4的rCelS蛋白催化中心的相关位点进行D255N和Y351F定点突变和原核表达,结果表明定点突变后的两种rCelS蛋白均没有水解磷酸膨胀纤维素的能力。表明Asp255有可能作为广义碱基团在外切葡聚糖酶CelS的催化反应中与广义酸基团Glu87进行翻转型催化反应。Tyr351是CelS的保守位点,将其变成Phe可能对CelS的结构与催化功能造成影响。

论文目录

  • 目录
  • 摘要
  • ABSTRACT
  • 符号说明及缩略词
  • 第一章 绪论
  • 1.1 纤维素酶概述
  • 1.2 纤维小体的研究进展
  • 1.2.1 C.thermocellum纤维小体酶组分组成和结构
  • 1.2.2 C.thermocellum纤维小体纤维素酶活性的特点
  • 1.2.3 C.thermocellum外切葡聚糖酶CelS
  • 1.2.4 C.thermocellum纤维素酶、半纤维素酶合成的调节机制
  • 1.2.5 人工纤维小体
  • 1.3 嗜热厌氧纤维素降解细菌工业化潜力的研究
  • 1.3.1 C.thermocellum产乙醇的研究进展
  • 1.3.2 梭菌联合培养
  • 1.3.3 利用DNA重组技术来解决选择性难题
  • 1.3.4 梭菌发酵产氢的研究
  • 1.4 本研究的目的与主要工作内容
  • 第二章 嗜热厌氧纤维素降解菌的筛选与鉴定
  • 引言
  • 2.1 材料和方法
  • 2.1.1 样品来源
  • 2.1.2 培养基
  • 2.1.3 主要仪器与试剂
  • 2.1.4 厌氧培养方法
  • 2.1.5 菌种的富集和分离纯化
  • 2.1.6 菌种鉴定
  • 2.2 结果与分析
  • 2.2.1 厌氧培养方法的建立
  • 2.2.2 菌种的富集
  • 2.2.3 菌群的16S rDNA序列分析
  • 2.2.4 菌种的培养特征与个体形态
  • 2.3 讨论
  • 小结
  • 第三章 嗜热厌氧纤维素降解菌C.thermocellum JN4和伴生菌T.thermosaccharolyticum GD17的生长及产氢特性
  • 引言
  • 3.1 材料和方法
  • 3.1.1 菌株
  • 3.1.2 培养基
  • 3.1.3 主要仪器与试剂
  • 3.1.4 厌氧培养方法
  • 3.1.5 生长曲线的测定
  • 3.1.6 最适生长温度的确定
  • 3.1.7 pH的测定
  • 3.1.8 发酵产物的分析
  • H2)的计算'>3.1.9 氢气产率(YH2)的计算
  • 3.1.10 蛋白质电泳和活性染色
  • 3.1.11 胞外蛋白酶活测定
  • 3.2 结果与分析
  • 3.2.1 最适生长温度的确定
  • 3.2.2 菌体生长测定
  • 3.2.3 纤维素降解菌C.thermocellum JN4和伴生菌T.thermosaccharolyticum GD17的产氢特性
  • 3.2.4 C.thermocellum JN4和T.thermosaccharolyticum GD17以不同浓度纤维素底物为碳源时的生长
  • 3.2.5 C.thermocellum JN4和T.thermosaccharolyticum GD17对木聚糖的降解
  • 3.2.6 C.thermocellum JN4和T.thermosaccharolyticum GD17对天然纤维素类物质的利用
  • 3.2.7 C.thermocellum JN4的胞外蛋白及其纤维素酶活分析
  • 3.3 讨论
  • 小结
  • 第四章 C.thermocellum JN4和伴生菌T.thermosaccharolyticum GD17利用纤维素生长和产氢的动力学研究
  • 引言
  • 4.1 材料和方法
  • 4.1.1 菌株
  • 4.1.2 培养基
  • 4.1.3 主要仪器与试剂
  • 4.1.4 厌氧培养方法
  • 4.1.5 蛋白浓度的测定
  • 4.1.6 碳源利用
  • 4.1.7 pH的测定
  • 4.1.8 发酵产物的分析
  • H2)的计算'>4.1.9 氢气产率(YH2)的计算
  • 4.1.10 2L厌氧反应器的设计与使用
  • 4.2 结果与分析
  • 4.2.1 菌体的生长与碳源的利用
  • 4.2.2 pH的变化
  • 2的产生'>4.2.3 H2的产生
  • 4.2.4 还原糖、有机酸和乙醇的生成
  • 4.2.5 2L反应器的设计与使用
  • 4.3 讨论
  • 小结
  • 第五章 嗜热厌氧纤维素降解菌C.thermocellum JN4外切葡聚糖酶基因CelS的原核表达和定点突变
  • 引言
  • 5.1 材料和方法
  • 5.1.1 菌株和质粒
  • 5.1.2 培养基
  • 5.1.3 试剂、工具酶与仪器
  • 5.1.4 C.thermocellum JN4外切葡聚糖酶基因celS的克隆及序列分析
  • 5.1.5 表达载体的构建
  • 5.1.6 重组蛋白的诱导表达与复性
  • 5.1.7 酶活测定方法
  • 5.1.8 CelS基因的D255N和Y351F点突变
  • 5.2 结果与分析
  • 5.2.1 基因组DNA的提取
  • 5.2.2 C.thermocellum JN4 celS基因PCR扩增
  • 5.2.3 测序结果和已知序列差异
  • 5.2.4 表达载体的构建
  • 5.2.5 重组蛋白的诱导表达与复性
  • 5.2.6 rCelS蛋白的酶活性测定
  • 5.2.7 celS基因的D255N和Y351F点突变
  • 5.3 讨论
  • 小结
  • 全文总结与展望
  • 参考文献
  • 攻读学位期间发表的学术论文
  • 致谢
  • 学位论文评阅及答辩情况表
  • 附件
  • 相关论文文献

    标签:;  ;  ;  ;  ;  

    嗜热厌氧梭菌降解纤维素及产氢特性研究
    下载Doc文档

    猜你喜欢