大豆重组自交系遗传图谱构建及重要性状QTL定位

论文摘要

大豆是严格的自花授粉作物,是由古四倍体演变而来的二倍体,基因组较大、染色体又很小、难于进行细胞遗传学研究,因此,构建分子遗传图谱并对重要性状进行QTL定位,对于重要性状基因的图位克隆及分子标记辅助育种具有重要意义。本研究以合丰25为母本,固新野生大豆为父本培育的F2∶10代重组自交系群体（RIL）为材料,构建了基于SSR标记的分子遗传图谱,并对花色、荚色、粒色、脐色、茸毛色、叶型、结荚习性、生长习性、泥膜、成熟期、百粒重、蛋白质和油分13个性状进行QTL定位分析,主要结果如下:1、利用合丰25×固新野生大豆群体构建了一张含有126个SSR标记,分布于27个连锁群的大豆遗传图谱。该图谱覆盖基因组长度为924.1cM,标记间平均距离为7.3cM。每个连锁群长度范围为1.9～116.9cM之间,标记数范围为2～12个。本研究图谱上定位的标记与Cregan等发表的大豆公共图谱具有较好的可比性。2、应用复合区间作图法对花色、荚色、粒色、脐色、茸毛色、叶型、结荚习性、生长习性、泥膜、生育期、百粒重、蛋白质和油分13个数量性状进行QTL定位和遗传效应分析,在LOD>2.5时共检测到26个QTL位点,遗传贡献率在6.94%-45.88%之间,分布于与公共图谱对应的9个连锁群。这些QTL遗传贡献率大于10%的有16个。其中,分别于2005和2006两年蛋白质含量和油份含量性状进行了QTL分析和定位,在I连锁群Satt239-Satt700区间各获得一个稳定的OTL,距离标记Satt700仅有0.03cM。

论文目录

• 摘要
• ABSTRACT
• 第1章 综述
• 1.1 概述
• 1.2 标记类型
• 1.2.1 形态标记
• 1.2.2 生物化学标记—同工酶标记
• 1.2.3 分子标记
• 1.3 遗传图谱的构建过程
• 1.3.1 亲本选择
• 1.3.2 定位群体的类型和应用重组自交系群体作图
• 1.3.3 分子标记在 RIL群体中的偏分离分析
• 1.4 数量性状 QTL定位
• 1.4.1 QTL定位的基本原理
• 1.4.2 QTL定位的统计分析方法
• 1.5 大豆遗传图谱类型及其研究进展
• 1.5.1 基于 RFLP标记为主的大豆遗传图谱
• 1.5.2 基于 SSR标记为主的大豆遗传图谱
• 1.6 大豆QTL研究进展
• 1.6.1 大豆蛋白质和脂肪含量的 QTL研究进展
• 1.6.2 大豆产量及相关性状的QTL研究进展
• 1.7 本研究的目的与意义
• 第2章 合丰25×固新野生大豆 RIL群体遗传图谱的构建
• 2.1 前言
• 2.2 材料与方法
• 2.2.1 实验材料
• 2.3 实验方法
• 2.3.1 大豆总 DNA的提取
• 2.3.2 SSR标记
• 2.3.3 PCR扩增
• 2.3.4 电泳凝胶制备
• 2.3.5 PCR扩增产物的电泳检测
• 2.3.6 硝酸银染色及显影
• 2.3.7 数据记录与统计分析
• 2.3.8 遗传图谱的构建
• 2.3.9 农艺性状的调查
• 2.4 结果与分析
• 2.4.1 亲本间SSR位点的多态性分析
• 2.4.2 多态性SSR位点在RIL群体上的分布
• 2.4.3 亲本对后代的遗传贡献率分析
• 2.4.4 遗传图谱的构建
• 2.5 讨论
• 2.5.1 群体的亲本选择及群体构建
• 2.5.2 分子标记的分离分析
• 2.5.3 偏分离产生的遗传因素
• 2.5.4 偏分离标记对图谱构建和 QTL定位的影响
• 第3章 大豆重要性状QTL分析
• 3.1 材料与方法
• 3.1.1 材料
• 3.1.2 方法
• 3.2 大豆重要性状之间的关联分析
• 3.3 大豆重要性状的QTL定位
• 3.3.1 大豆种子蛋白质和脂肪QTL分析
• 3.3.2 大豆种子百粒重QTL分析
• 3.3.3 大豆种子成熟期QTL分析
• 3.2.4 大豆其他性状的QTL分析
• 3.4 讨论
• 3.4.1 大豆蛋白质含量和脂肪含量的QTL分析
• 3.4.2 大豆百粒重的QTL分析
• 3.4.3 大豆成熟期的QTL分析
• 3.4.4 大豆其他性状QTL分析
• 第4章 结论
• 附录
• 参考文献
• 致谢