集胞藻PCC6803中基因slr2049功能的初步研究

集胞藻PCC6803中基因slr2049功能的初步研究

论文摘要

藻胆蛋白是存在于蓝藻、红藻和隐藻中的一类结构相似的捕光色素蛋白,藻蓝蛋白是其中的一种,由此可见,藻胆蛋白在藻的光合作用过程中起着至关重要的作用。目前,我国的水环境富营养化情况严重,而造成这一现象,很多藻类都有不可脱卸的责任;另外,现在有很多研究表明藻胆蛋白也极具商业价值。因此,研究清楚藻胆蛋白的合成过程不仅对水环境的保护和改善有着十分重要的意义,并且能够带来不小的经济效益。藻胆蛋白是由藻胆色素与相应的脱辅基蛋白以硫醚键共价结合而成。在体内,藻胆蛋白生物合成的最后一步,藻胆色素与脱辅基藻胆蛋白的正确连接一般都需要特异的裂合酶来催化完成。最早被发现和研究的藻胆蛋白裂合酶基因cpcE和cpcF是在聚球藻Synechococcus sp. PCC7002存在的,而这两个基因在不同的藻种间有比较高的同源性。近些年有很多与蓝藻中色素裂合酶基因相关的报道,例如,2006年,Zhao等在鱼腥藻Anabaena sp. PCC 7120中发现了一种色素裂合酶基因cpeS (编号为alr0617),该基因编码的色素裂合酶CpeS可以催化藻蓝胆素(PCB)连接到藻蓝蛋白或者藻红蓝蛋白的β亚基Cys-84位点上。本实验通过同源分析软件在集胞藻Synechocystis sp. PCC 6803中找到了与cpeS同源性较高的基因,编号为slr2049。为了研究该基因所编码蛋白是否具有与其同源蛋白CpeS具有相同或者相似的功能,从集胞藻Synechocystis sp. PCC 6803的全基因组中克隆出能够在大肠杆菌中合成具有荧光性的藻蓝蛋白β-亚基的3个相关基因:血红素加氧酶1基因(ho1),藻蓝素铁氧还蛋白还原酶基因(pcyA)以及脱辅基蛋白β亚基基因(cpcB)。构建了表达质粒pCDF-cpcB-slr2049和pET-ho1-pcyA,然后在大肠杆菌BL21体内对PCB和藻蓝蛋白-β亚基进行了异源体内重组,并对重组产物进行了光谱测定。SDS-PAGE和光谱测定的实验结果表明,基因slr2049所编码的蛋白具有色素裂合酶的作用。另外,为了进一步研究基因slr2049编码蛋白的功能,本实验还对该基因进行了定点突变,构建了两个突变体slr2049(W14L)和slr2049(Y132S)。同样将这两个突变体进行异源体内重组,对重组产物进行了光谱测定。SDS-PAGE和光谱测定的实验结果表明,突变体Slr2049(W14L)仍具有催化活性,但是其催化能力很低;Slr2049(Y132S)的催化活性相对而言降低的较少。由此可推断,该蛋白的第14位色氨酸对其催化能力有积极作用,而第132位的酪氨酸对其催化能力没有很大的影响。

论文目录

  • 摘要
  • Abstract
  • 第1章 绪论
  • 1.1 蓝藻的研究概况
  • 1.1.1 蓝藻概述
  • 1.1.2 蓝藻分子生物学研究概况
  • 1.1.3 蓝藻基因工程应用研究概况
  • 1.2 集胞藻PCC 6803 研究进展
  • 1.2.1 集胞藻PCC 6803 概述
  • 1.2.2 集胞藻PCC 6803 基因组研究
  • 1.2.3 集胞藻PCC 6803 基因工程应用方面的特性
  • 1.3 藻胆蛋白的研究进展
  • 1.3.1 藻胆蛋白
  • 1.3.2 藻胆蛋白的理化性质
  • 1.4 藻胆蛋白裂合酶基因的研究进展
  • 1.5 实验方案设计及研究意义
  • 1.5.1 实验方案设计
  • 1.5.2 研究意义
  • 第2章 集胞藻Synechocystis sp. PCC 6803 基因slr2049 的生物信息学分析
  • 2.1 引言
  • 2.2 实验材料与方法
  • 2.3 结果与分析
  • 2.3.1 基因slr2049 基本信息
  • 2.3.2 Slr2049 蛋白二级结构预测
  • 2.3.3 Slr2049 的疏水性、信号肽及跨膜结构域的预测及分析
  • 2.3.4 Slr2049 的功能结构域的预测
  • 2.4 本章小结
  • 第3章 集胞藻(Synechocystis PCC 6803)基因slr2049 及三个相关基因的克隆载体的构建
  • 3.1 引言
  • 3.2 实验材料与方法
  • 3.2.1 实验材料
  • 3.2.2 实验试剂与仪器
  • 3.2.3 实验方法
  • 3.3 结果与分析
  • 3.3.1 四个基因PCR 结果的电泳检测
  • 3.3.2 构建克隆质粒的检测
  • 3.4 本章小结
  • 第4章 slr2049 突变体的构建
  • 4.1 引言
  • 4.2 实验材料与方法
  • 4.2.1 主要实验材料
  • 4.2.2 实验试剂与仪器
  • 4.2.3 实验方法
  • 4.3 结果与分析
  • 4.3.1 突变位点的选取
  • 4.3.2 突变体的构建与筛选
  • 4.4 本章小结
  • 第5章 集胞藻(Synechocystis sp. PCC 6803)藻蓝蛋白β亚基体内合成及其光谱性质研究
  • 5.1 引言
  • 5.2 实验材料、试剂与仪器
  • 5.2.1 实验材料
  • 5.2.2 实验试剂及仪器
  • 5.3 实验方法
  • 5.3.1 表达载体的构建
  • 5.3.2 大肠杆菌体内合成藻蓝蛋白β亚基
  • 5.4 结果与分析
  • 5.4.1 表达载体的构建
  • 5.4.2 体内合成藻蓝蛋白β亚基
  • 5.5 本章小结
  • 结论及展望
  • 参考文献
  • 致谢
  • 附录A 攻读硕士学位期间发表的学术论文
  • 相关论文文献

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