本文主要研究内容
作者郭睿,杜宇,周倪红,刘思亚,熊翠玲,郑燕珍,付中民,徐国钧,王海朋,耿四海,周丁丁,陈大福（2019）在《意大利蜜蜂幼虫肠道在球囊菌胁迫后期的差异表达微小RNA及其靶基因分析》一文中研究指出：【目的】蜜蜂球囊菌Ascosphaera apis(简称球囊菌)是一种特异性侵染蜜蜂幼虫肠道的致死性真菌病原。微小RNA(microRNA,mi RNA)是一种在转录后水平对m RNA进行负调控的关键调控因子。本研究旨在对意大利蜜蜂Apis mellifera ligustica(简称意蜂)幼虫肠道在球囊菌胁迫后期的差异表达mi RNAs(DEmiRNAs)及其靶基因进行深入分析,为揭示DEmiRNAs在胁迫应答中的作用提供重要信息。【方法】利用small RNA-seq(s RNA-seq)技术对正常及球囊菌侵染的意蜂6日龄幼虫肠道(分别表示为Am CK和Am T)进行测序,通过相关生物信息学软件对DEmiRNAs进行预测和分析。利用TargetFinder软件预测DEmiRNAs的靶基因,然后利用Blast软件对靶基因进行GO和KEGG数据库的功能注释。通过Cytoscape软件构建DEmiRNAs与其靶m RNAs的调控网络。通过茎环实时荧光定量PCR(stem-loop RT-qPCR)验证测序数据的可靠性。【结果】Am CK和Am T的测序分别得到9 230 496和10 823 667条有效序列标签; Am CK vs Am T比较组中包含15个上调和6个下调mi RNAs,分别结合3 503和3 252个靶基因,它们可分别注释到40和39个GO terms以及104和99条代谢通路;进一步分析发现调控网络中的17个DEmiRNAs靶向结合116个与丝氨酸蛋白酶相关的m RNAs,14个DEmiRNAs靶向结合54个与泛素介导的蛋白水解相关的m RNAs。Stem-loop RT-qPCR验证结果显示随机选择的4个DEmiRNAs (mi R-251-x,mi R-9277-y,mi R-1672-x和mi R-4968-y)的表达量变化趋势与测序结果一致,表明测序数据真实可信。【结论】本研究率先对意蜂幼虫肠道在球囊菌胁迫后期的DEmiRNAs及其靶基因进行预测与分析,提供了mi RNAs的表达谱和差异表达信息。ame-miR-927b,mi R-429-y和mi R-8440-y等DEmiRNAs可能参与对丝氨酸蛋白酶的调控和对泛素介导的蛋白水解的调控,DEmiRNAs与靶基因之间存在复杂的调控网络关系。DEmiRNAs可参与到意蜂幼虫肠道与球囊菌间的互作。
Abstract
【mu de 】mi feng qiu nang jun Ascosphaera apis(jian chen qiu nang jun )shi yi chong te yi xing qin ran mi feng you chong chang dao de zhi si xing zhen jun bing yuan 。wei xiao RNA(microRNA,mi RNA)shi yi chong zai zhuai lu hou shui ping dui m RNAjin hang fu diao kong de guan jian diao kong yin zi 。ben yan jiu zhi zai dui yi da li mi feng Apis mellifera ligustica(jian chen yi feng )you chong chang dao zai qiu nang jun xie pai hou ji de cha yi biao da mi RNAs(DEmiRNAs)ji ji ba ji yin jin hang shen ru fen xi ,wei jie shi DEmiRNAszai xie pai ying da zhong de zuo yong di gong chong yao xin xi 。【fang fa 】li yong small RNA-seq(s RNA-seq)ji shu dui zheng chang ji qiu nang jun qin ran de yi feng 6ri ling you chong chang dao (fen bie biao shi wei Am CKhe Am T)jin hang ce xu ,tong guo xiang guan sheng wu xin xi xue ruan jian dui DEmiRNAsjin hang yu ce he fen xi 。li yong TargetFinderruan jian yu ce DEmiRNAsde ba ji yin ,ran hou li yong Blastruan jian dui ba ji yin jin hang GOhe KEGGshu ju ku de gong neng zhu shi 。tong guo Cytoscaperuan jian gou jian DEmiRNAsyu ji ba m RNAsde diao kong wang lao 。tong guo jing huan shi shi ying guang ding liang PCR(stem-loop RT-qPCR)yan zheng ce xu shu ju de ke kao xing 。【jie guo 】Am CKhe Am Tde ce xu fen bie de dao 9 230 496he 10 823 667tiao you xiao xu lie biao qian ; Am CK vs Am Tbi jiao zu zhong bao han 15ge shang diao he 6ge xia diao mi RNAs,fen bie jie ge 3 503he 3 252ge ba ji yin ,ta men ke fen bie zhu shi dao 40he 39ge GO termsyi ji 104he 99tiao dai xie tong lu ;jin yi bu fen xi fa xian diao kong wang lao zhong de 17ge DEmiRNAsba xiang jie ge 116ge yu si an suan dan bai mei xiang guan de m RNAs,14ge DEmiRNAsba xiang jie ge 54ge yu fan su jie dao de dan bai shui jie xiang guan de m RNAs。Stem-loop RT-qPCRyan zheng jie guo xian shi sui ji shua ze de 4ge DEmiRNAs (mi R-251-x,mi R-9277-y,mi R-1672-xhe mi R-4968-y)de biao da liang bian hua qu shi yu ce xu jie guo yi zhi ,biao ming ce xu shu ju zhen shi ke xin 。【jie lun 】ben yan jiu lv xian dui yi feng you chong chang dao zai qiu nang jun xie pai hou ji de DEmiRNAsji ji ba ji yin jin hang yu ce yu fen xi ,di gong le mi RNAsde biao da pu he cha yi biao da xin xi 。ame-miR-927b,mi R-429-yhe mi R-8440-ydeng DEmiRNAske neng can yu dui si an suan dan bai mei de diao kong he dui fan su jie dao de dan bai shui jie de diao kong ,DEmiRNAsyu ba ji yin zhi jian cun zai fu za de diao kong wang lao guan ji 。DEmiRNAske can yu dao yi feng you chong chang dao yu qiu nang jun jian de hu zuo 。
论文参考文献
论文详细介绍
论文作者分别是来自昆虫学报的郭睿,杜宇,周倪红,刘思亚,熊翠玲,郑燕珍,付中民,徐国钧,王海朋,耿四海,周丁丁,陈大福，发表于刊物昆虫学报2019年01期论文，是一篇关于意大利蜜蜂论文,蜜蜂球囊菌论文,胁迫应答论文,微小论文,免疫防御论文,靶基因论文,昆虫学报2019年01期论文的文章。本文可供学术参考使用，各位学者可以免费参考阅读下载，文章观点不代表本站观点，资料来自昆虫学报2019年01期论文网站，若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权，请联系我们删除。
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