文昌鱼α2M和fndc3a基因的鉴定和功能初探

文昌鱼α2M和fndc3a基因的鉴定和功能初探

论文摘要

文昌鱼是现存与脊椎动物原始祖先最接近的头索动物,代表着从无脊椎动物到脊椎动物进化过程中的一个重要的过渡阶段,长期以来一直被作为研究脊椎动物起源与进化的模式生物。目前,文昌鱼的基因序列和表达模式已经被广泛应用于不同物种之间的比较基因组学研究和发育同源性分析。本文从文昌鱼(Branchiostoma japonicum)中分离出了具有完整编码框的alpha-2 Macroglobulin(α2M)基因和fibronectin typeⅢdomain containing 3a (fndc3a)基因片段,并对fndc3a基因部分序列进行了原核表达。首先,根据alpha-2 Macroglobulin (α2M)基因序列同源性资料,利用兼并引物RT-PCR、5’RACE和3’RACE方法从文昌鱼中克隆了一个全长5545 bp的α2McDNA (Bjα2M),其中5’非翻译区78 bp,3’非翻译区874 bp,该cDNA包含的最大开放阅读框为4593 bp,编码一个1530个氨基酸的蛋白,该cDNA编码的蛋白氨基端有一个16个氨基酸的信号肽。Bjα2M成熟蛋白含1514个氨基酸残基,理论分子量为164.2 kDa,等电点为4.6。糖基化位点预测显示,在728,978,1298和1412位氨基酸处存在四个潜在的糖基化位点。多序列比对发现,Bjα2M与其它物种α2M一样含有三个功能区:诱饵区(bait region),内部硫酯键(internal thiolester)和受体结合区(receptor-binding domain)。系统进化分析发现,Bjα2M与海鞘α2M聚为一支,且位于脊椎动物α2M的根部,进一步表明了文昌鱼在进化上的地位。我们还研究了Bjα2M基因在文昌鱼中的表达情况,Northern blotting结果显示,Bjα2M在文昌鱼中的转录产物为一条带,大小为5500 bp左右,与我们从文昌鱼中克隆的Bjα2M cDNA的大小基本一致。切片原位杂交分析表明Bjα2M在成体文昌鱼组织中呈特异性表达,在肝盲囊和后肠中的表达量最高,在卵巢和鳃中也有表达。分组织实时定量PCR结果表明,Bjα2M在成体文昌鱼肝盲囊和后肠表达量最高,而其它各组织的扩增水平都很低,与切片原位杂交结果基本一致,进一步证明Bjα2M具有组织特异性表达。免疫组织化学结果显示,Bjα2M在成体文昌鱼肝盲囊的表达最为丰富。用lipopolysaccharide (LPS)处理文昌鱼,结果显示,在处理后8小时的鱼体中Bjα2M基因表达水平显著升高。因此,推测文昌鱼α2M可能是一种急性时相蛋白,参与宿主免疫防御。同时,我们也在文昌鱼中克隆了fibronectin typeⅢdomain containing 3a(Bjfndc3a)基因的部分片段,该基因片段长度为2621 bp,编码873个氨基酸,smart预测显示该多肽序列编码8个纤连蛋白typeⅢ基序和一个跨膜区域,其中,这8个纤连蛋白typeⅢ基序均不含有RGD三肽序列。Northern blot杂交结果显示Bjfndc3a在文昌鱼中的转录产物为两条带,分别为4.4 kb和4.7 kb,有研究表明人类HUGO (fndc3a)基因也有两条转录产物。鳗弧菌感染文昌鱼,应用实时定量PCR分析发现,感染12小时后的鱼体中Bjfndc3a基因表达水平显著升高,推测fndc3a可能是一种免疫相关分子,参与宿主免疫防御。选择Bjfndc3a部分基因序列设计表达引物,构建重组表达质粒,IPTG诱导表达,SDS-PAGE分析表达产物。结果表明重组的Bjfndc3a部分基因在大肠杆菌中获得了表达,其大小为14 kDa。

论文目录

  • 摘要
  • 英文摘要
  • 第一章 文献综述
  • 0 前言
  • 0.1 文昌鱼的发现,分布和种类
  • 0.2 文昌鱼的形体结构
  • 0.3 文昌鱼胚胎发育模式
  • 0.4 文昌鱼分子生物学研究
  • 2-巨球蛋白研究进展'>1 α2-巨球蛋白研究进展
  • 1.1 α2-巨球蛋白的结构
  • 2-巨球蛋白的功能'>1.2 α2-巨球蛋白的功能
  • 2-巨球蛋白的作用机理'>1.3 α2-巨球蛋白的作用机理
  • 2-巨球蛋白纯化与分子克隆研究进展'>1.4 α2-巨球蛋白纯化与分子克隆研究进展
  • 1.5 研究目的
  • 2 fndc3a 的研究进展及研究目的
  • 3 本文采取的技术路线
  • 2-巨球蛋白基因的鉴定与功能初探'>第二章 文昌鱼α2-巨球蛋白基因的鉴定与功能初探
  • 0 前言
  • 1 材料与方法
  • 2M 基因全长cDNA 序列的克隆'>1.1 文昌鱼Bjα2M 基因全长cDNA 序列的克隆
  • 1.2 序列与系统进化分析
  • 2M mRNA水平在成体文昌鱼各组织中的表达'>1.3 Northern blot,切片原位杂交和实时定量PCR 分析Bjα2M mRNA水平在成体文昌鱼各组织中的表达
  • 2M 的免疫组织化学定位'>1.4 文昌鱼Bjα2M 的免疫组织化学定位
  • 2 结果
  • 2M 序列与系统进化分析'>2.1 文昌鱼Bjα2M 序列与系统进化分析
  • 2M 的组织特异性表达'>2.2 Northern blot,切片原位杂交,实时定量PCR 和免疫组织化学分析Bjα2M 的组织特异性表达
  • 2M 基因功能的初步研究'>2.3 文昌鱼Bjα2M 基因功能的初步研究
  • 3 讨论
  • 4 展望
  • 第三章 文昌鱼Bjfndc3a 基因片段的鉴定与功能初探
  • 0 前言
  • 1 材料与方法
  • 1.1 文昌鱼Bjfndc3a 基因片段的扩增及序列分析
  • 1.2 Northern blot
  • 1.3 Real-time PCR 分析文昌鱼感染鳗弧菌对Bjfndc3a 基因表达的影响
  • 1.4 重组蛋白pET28a/Bjfndc3a 片段原核表达
  • 2 结果
  • 2.1 文昌鱼Bjfndc3a cDNA 片段的克隆
  • 2.2 Northern blot
  • 2.3 Bjfndc3a 基因功能的初步研究
  • 2.4 重组蛋白的原核表达
  • 3 总结与讨论
  • 4 展望
  • 参考文献
  • 缩略语
  • 附录
  • 致谢
  • 个人简历
  • 相关论文文献

    标签:;  ;  ;  

    文昌鱼α2M和fndc3a基因的鉴定和功能初探
    下载Doc文档

    猜你喜欢