张茜:面向同源蛋白质探测的一种新型混合深度学习模型论文

张茜:面向同源蛋白质探测的一种新型混合深度学习模型论文

本文主要研究内容

作者张茜,孙一佳,白琳,李陶深(2019)在《面向同源蛋白质探测的一种新型混合深度学习模型》一文中研究指出:根据蛋白质氨基酸链探测其同源蛋白质,进而预测蛋白质的功能,是生物信息学研究领域的一个重要挑战,也是众多生物医学研究领域的基础研究内容,有着重要的科研价值和广泛的应用需求。其研究难点在于:(1)如何学习对同源蛋白质预测有效、有用的蛋白质特征信息;(2)如何更好地运用蛋白质特征信息,实现同源蛋白质的探测与识别。为了解决同源蛋白质探测与识别研究中的关键难点,本文提出一种基于混合深度学习架构的同源蛋白质探测与识别模型(HDLM-PHP)。通过采用统一的"管道式"深度学习架构,将蛋白质特征学习和探测识别统一为一个整体,提高同源蛋白质探测与识别的效能。采用多组并行的深度卷积神经网络,学习蛋白质的各种属性信息,以期获得丰富的待检测蛋白质和靶蛋白质的高级相关性特征,并通过全连接方式使用多层RBM结构融合和精炼这些相关性特征为全局相关性特征。通过统一的深度网络连接方式,以探测和识别任务为导向,学习到对于同源蛋白质预测最有效、最全面的蛋白质特征信息。在标准数据集SCOPe上,对所提模型进行性能与效率评测,结果表明:本文提出的模型能有效地学习到符合任务导向的蛋白质特征数据,提升同源蛋白质探测与识别的准确度和召回率,优于现有的模型和算法。

Abstract

gen ju dan bai zhi an ji suan lian tan ce ji tong yuan dan bai zhi ,jin er yu ce dan bai zhi de gong neng ,shi sheng wu xin xi xue yan jiu ling yu de yi ge chong yao tiao zhan ,ye shi zhong duo sheng wu yi xue yan jiu ling yu de ji chu yan jiu nei rong ,you zhao chong yao de ke yan jia zhi he an fan de ying yong xu qiu 。ji yan jiu nan dian zai yu :(1)ru he xue xi dui tong yuan dan bai zhi yu ce you xiao 、you yong de dan bai zhi te zheng xin xi ;(2)ru he geng hao de yun yong dan bai zhi te zheng xin xi ,shi xian tong yuan dan bai zhi de tan ce yu shi bie 。wei le jie jue tong yuan dan bai zhi tan ce yu shi bie yan jiu zhong de guan jian nan dian ,ben wen di chu yi chong ji yu hun ge shen du xue xi jia gou de tong yuan dan bai zhi tan ce yu shi bie mo xing (HDLM-PHP)。tong guo cai yong tong yi de "guan dao shi "shen du xue xi jia gou ,jiang dan bai zhi te zheng xue xi he tan ce shi bie tong yi wei yi ge zheng ti ,di gao tong yuan dan bai zhi tan ce yu shi bie de xiao neng 。cai yong duo zu bing hang de shen du juan ji shen jing wang lao ,xue xi dan bai zhi de ge chong shu xing xin xi ,yi ji huo de feng fu de dai jian ce dan bai zhi he ba dan bai zhi de gao ji xiang guan xing te zheng ,bing tong guo quan lian jie fang shi shi yong duo ceng RBMjie gou rong ge he jing lian zhe xie xiang guan xing te zheng wei quan ju xiang guan xing te zheng 。tong guo tong yi de shen du wang lao lian jie fang shi ,yi tan ce he shi bie ren wu wei dao xiang ,xue xi dao dui yu tong yuan dan bai zhi yu ce zui you xiao 、zui quan mian de dan bai zhi te zheng xin xi 。zai biao zhun shu ju ji SCOPeshang ,dui suo di mo xing jin hang xing neng yu xiao lv ping ce ,jie guo biao ming :ben wen di chu de mo xing neng you xiao de xue xi dao fu ge ren wu dao xiang de dan bai zhi te zheng shu ju ,di sheng tong yuan dan bai zhi tan ce yu shi bie de zhun que du he shao hui lv ,you yu xian you de mo xing he suan fa 。

论文参考文献

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  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自广西科学的张茜,孙一佳,白琳,李陶深,发表于刊物广西科学2019年03期论文,是一篇关于混合深度学习论文,同源蛋白质论文,深度卷积神经网络论文,蛋白质特征提取论文,深度学习模型论文,机器学习算法论文,广西科学2019年03期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自广西科学2019年03期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

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