刀鲚的形态学和遗传学研究

论文摘要

本实验对长江安徽段三个群体刀鲚样本进行形态和分子水平上的研究。形态学上使用变量均值比较、全长与体重的组成、单因子方差分析、聚类分析,结果表明,刀鲚群体间呈现出相似性,无为与安庆群体关系更为接近,但个体变量则出现交叉现象,从刀鲚全长与体重关系图中可看到各群体无明显的分界,而是个体间的集群。采用PCR扩增出三个群体刀鲚样本的细胞色素氧化酶亚基I基因（COI）和细胞色素b基因（Cyt b）基因片段序列（其中COI和Cyt b基因片段序列的扩增样本数分别为58、57）,并进行分析比较群体及个体间的差异。通过测定,得到606bp的COI基因片段,其中有3个缺失位点,9个变异位点,在群体间分布不均。序列中碱基C含量最低（17.97%）,G+C含量低于A+T的。计算得出个体间的遗传距离（Pairwise distances）为0.0000-0.0165,并基于Kimura-2模型构建UPGMA和NJ系统树,从系统树中发现个体间呈现交叉现象。从Gene bank上检索并下载了其它五个物种包括日本鲚、鳀鱼、真螈、小鼠、智人COI基因序列,与刀鲚三个群体,基于Kimura-2模型构建UPGMA和NJ系统树,显示三个群体之间关系,无为与安庆关系更近,这与形态分析一致。通过测定,得到410bp的Cyt b基因片段,其中无插入或缺失位点,仅有4个变异位点,并且均为碱基T变异为C。序列中碱基G含量最低,G+C含量低于A+T的。计算得出个体间的遗传距离为0.0000-0.0074。基于Kimura-2模型构建UPGMA和NJ系统树,发现刀鲚样本个体都聚在一起呈现平行关系,群体间个体的差异并不明显。从Gene Bank上检索并下载了其它五个物种包括日本鲚、鳀鱼、真螈、小鼠、智人Cyt b基因序列,与刀鲚三个群体,基于Kimura-2模型构建UPGMA和NJ系统树,两种关系树分类一致,显示安庆与当涂群体更为接近。通过对刀鲚群体的形态水平和分子遗传上的研究分析,得出长江安徽段的三个刀鲚群体:无为、安庆、当涂之间差异较小,亲缘关系很近,形态学上仅在D（头长/吻长）、H（体长/吻长）这两个变量上表现出差异性;遗传上则从系统树看出个体间有明显交叉现象.本文对刀鲚的初步探讨,以期为刀鲚种质资源合理开发和利用提供基础理论依据,同时填补安徽省关刀鲚种质资源研究的空白,对其多样性保护也具有重要意义。

论文目录

• 摘要
• Abstract
• 缩略词（Abbreviation）
• 文献综述
• 1 刀鲚的形态学研究
• 1.1 前言
• 1.2 材料与方法
• 1.2.1 材料来源
• 1.2.2 方法
• 1.3 结果
• 1.3.1 均值比较
• 1.3.2 全长、体重组成及体长与体重关系
• 1.3.3 单因子方差分析
• 1.3.4 聚类分析
• 1.4 讨论
• 2 刀鲚线粒体 COI 基因片段序列比较分析
• 2.1 前言
• 2.2 材料与方法
• 2.2.1 材料来源
• 2.2.2 主要仪器设备
• 2.2.3 主要试剂
• 2.2.4 软件工具
• 2.2.5 常规溶液及试剂配制
• 2.2.6 方法
• 2.3 结果
• 2.4 讨论与分析
• 3 刀鲚线粒体Cyt-b 基因片段序列比较分析
• 3.1 前言
• 3.2 材料与方法
• 3.2.1 材料
• 3.2.2 主要仪器设备
• 3.2.3 主要试剂
• 3.2.4 软件工具
• 3.2.5 常规溶液及试剂配制
• 3.2.6 方法
• 3.3 结果
• 3.4 讨论与分析
• 4 结论
• 参考文献
• 致谢
• 作者简介