中国荷斯坦牛leptin基因多态性及其与产奶性能的关系

论文摘要

Leptin是leptin基因在脂肪组织表达的一种蛋白质,已证明该基因单核苷酸多态性与奶牛的繁殖力、产奶量、体细胞计数、乳蛋白率等性状相关。本研究检测了中国荷斯坦牛leptin基因启动子区与外显子2区多态性,并进一步分析了这些多态性与产奶性能的关系,结果如下:以抽样的190头中国荷斯坦牛为研究对象,通过运用PCR-RFLP方法,对leptin基因外显子2区E2JW位点和E2FB位点进行了单核苷酸多态性检测,并获得不同基因型,然后结合DHI数据,设计混合模型,应用软件SAS 8.2分析了两个多态位点对产奶性能的影响;另外,通过运用PCR-SSCP方法对该基因启动子区进行多态性检测,发现了5种基因型（AA、AB、AC、BB、BC）,测序证实此序列存在3个等位基因（A: 528C-617G-618C,B: 528C-617A-618T,C: 528T-617G-618C）,并且包含UASMS2（即528 C/T）和PSD（即617G/A - 618C/T）两个多态位点,而PSD多态位点则为首次发现,并用同样的数据统计方法分析了此序列多态性对产奶性能的影响。结果发现:在leptin基因外显子2区,E2JW多态位点对乳脂率（P=0.02）、305天产奶量（P=0.03）的影响显著,E2FB多态位点对乳蛋白率的影响显著（P=0.04）。在分析E2JW和E2FB两多态位点交互效应时,对于305天产奶量来讲,MM*PQ和MM*QQ基因型牛个体与MN*PP基因型牛个体差异显著;NN*PQ基因型牛个体分别与MM*PP、MM*QQ和MN*QQ基因型牛个体差异显著;但此交互效应对牛乳蛋白率、乳脂率、体细胞计数影响均不显著。在leptin基因启动子区,本研究序列多态性与305天产奶量显著相关;对于乳脂率来讲,AB基因型牛个体（P=0.03）和BB基因型牛个体（P=0.04）均与BC基因型牛个体之间均存在显著性差异;但此序列多态性对乳蛋白率和SCC的影响不显著（P>0.05）。因此,leptin基因外显子2区E2FB多态位点可以作为中国荷斯坦牛305天产奶量和乳脂率的一个遗传分子标记,E2JW多态位点可以作为影响奶牛乳蛋白率的一个遗传分子标记,而E2FB和E2JW两个多态位点交互作用共同影响305天产奶量（P=0.045）;启动子区UASMS2和PSD多态位点可作为影响乳脂率和305天产奶量的遗传分子标记。

论文目录

• 符号说明
• 中文摘要
• 英文摘要
• 1 引言
• 1.1 DNA 分子标记
• 1.1.1 PCR
• 1.1.2 RFLP
• 1.1.3 SNP
• 1.1.4 其它DNA 分子标记
• 1.2 与产奶性状相关的几个候选基因
• 1.2.1 牛催乳素基因
• 1.2.2 牛生长激素和生长激素受体基因
• 1.2.3 κ–酪蛋白基因
• 1.2.4 摇摆基因
• 1.2.5 甘油酰基转移酶基因
• 1.3 肥胖基因
• 1.3.1 Leptin 的生理功能
• 1.3.2 牛leptin 基因多态性与生产性能的关系
• 1.4 与产奶性能相关的QTL 研究进展
• 1.5 本研究的目的和意义
• 2 材料与方法
• 2.1 材料
• 2.1.1 实验样品的来源、采样方法及DHI 数据
• 2.1.2 主要仪器设备及实验试剂
• 2.2 方法
• 2.2.1 基因组DNA 提取
• 2.2.2 引物设计
• 2.2.3 Leptin 基因外显子2 区多态性检测
• 2.2.4 Leptin 基因启动子区多态性检测
• 2.2.5 PCR 产物回收测序
• 2.3 统计分析方法
• 2.3.1 数据统计分析
• 2.3.2 同源性比对分析
• 3 结果与分析
• 3.1 基因组DNA
• 3.2 Leptin 基因外显子2 区多态性检测结果
• 3.3 Leptin 基因启动子区多态性检测结果
• 3.4 Leptin 基因多态性与产奶性能的关系
• 3.4.1 Leptin 基因外显子2 区
• 3.4.2 Leptin 基因启动子区
• 4 讨论
• 4.1 Leptin 基因外显子2 区
• 4.1.1 E2FB SNP
• 4.1.2 E2JW SNP
• 4.1.3 E2FB 和E2JW 两多态位点交互效应
• 4.2 Leptin 基因启动子区
• 4.3 误差分析
• 5 结论
• 参考文献
• 致谢
• 攻读硕士学位期间发表的学术论文
• 个人简介