除草剂异丙隆降解菌株的筛选鉴定及降解特性和应用研究

除草剂异丙隆降解菌株的筛选鉴定及降解特性和应用研究

论文摘要

随着城市化进程和农村劳动力转移的不断加快,为提高农业生产效率保证农业生产的正常进行,除草剂被大量广泛使用,取代脲类除草剂就是其中的一种。因取代脲类除草剂的大量使用而造成的除草剂残留问题已经引起人们的广泛关注,对污染环境修复问题已成为迫在眉睫的重要课题。生物修复因具有经济、安全、方便、高效等优点,成为处理有机物面源污染的重要手段。本研究将对异丙隆(取代脲类除草剂的一种)降解菌株的分离过程进行介绍,对降解菌株的生长和降解性状进行研究,在此基础上完成对菌株的修复取代脲类除草剂污染能力的评估,以期为人们认识取代脲类除草剂在环境中的生物降解过程提供帮助,并为解决取代脲类除草剂的面源污染提供一种安全高效的方法。采用富集培养的方式从长期受除草剂污染土壤中分离了五株细菌,分别命名为Y57、YBL1、YBL2、YBL3和CA6。其中菌株Y57、YBL1、YBL2和YBL3降解取代脲类除草剂异丙隆,菌株CA6可以降解取代脲类除草剂降解过程中产生的苯胺化合物。根据生理生化特性和16SrRNA基因序列比对,将其中的一株细菌Y57鉴定为鞘氨醇单胞菌属(Sphingomonas sp.)细菌。将细菌YBL1、YBL2和YBL3鉴定为鞘氨醇杆菌属(Sphingobium sp.)细菌。苯胺降解菌株CA6通过16S rRNA基因序列分析鉴定为固氮螺菌属细菌,但与目前该属内已发表的种存在较大的差异。经过生理生化试验发现,菌株CA6培养1d后,在NFb固体培养基平板上会出现肉眼可见的菌落,菌落呈圆形,光滑,凸起,微小,3d后菌落在NFb培养基平板上的单菌落逐渐长大,菌落的形态发生变化,菌落的表面变粗燥,突起,与固体培养基平板牢固的结合;CA6菌体大小约为0.7-0.9μm×1.5-2.4μm,菌体呈杆状,稍有螺旋,单极生鞭毛;革兰氏染色为阴性,不产芽孢,严格好氧,接触酶阳性,氧化酶阳性,不液化明胶,脲酶阳性,不水解淀粉,最适生长温度为37℃,但菌株可以在20-40℃广泛的温度范围内生长,最适生长pH值为6.0-7.0。不能发酵葡萄糖、乳糖、蔗糖产酸,菌株为化能异养,菌株可以在含有3%的氯化钠的NFb液体培养基中生长,柠檬酸盐还原、硝酸还原和亚硝酸还原反应阴性;不产生吲哚;H2S产生反应阴性;水解磷酸盐阴性。16SrRNA基因序列(GenBank No.EU573183)与菌株Azospirillum rugosum AFH-6T, Azospirillum brasilense DSM1690T和Azospirillum lipoferum DSM1691T的序列同源性达到96.6%、96.3%、96.2%;CA6的成分如下:Feature2(4.92%),13:1AT12-13(0.45%), unknown14.959(0.31%), Sum In Feature3(4.72%),16:1ω5c(2.59%),16:0(2.67%),16:03OH (2.77%), Sum In Feature5(0.36%),18:1ω9c (4.55%),18:1ω7c (66.39%),18:0(1.19%),19:0CYCLOω8c (4.61%),18:12OH(3.75%),18:03OH (0.74%).;菌株可以利用环糊精、糊精、吐温40、N-乙酰基-D半乳糖胺、N-乙酰基-D-葡萄糖胺、侧金盏花醇、D-果糖、a-D-葡萄糖、甲基丙酮酸、麦芽糖、D-甘露糖、D-棉子糖、L-棉子糖、蔗糖、单甲基琥珀酸、甲酸、L-丙氨酸胺、D-丙氨酸、L-丙氨酸、L-丙氨酰、甘氨酸、L-脯氨酸、p-羟基丁酸、丙酸、琥珀酸、溴丁二酸、D,L-乳酸等为唯一碳源生长。其中菌株对糊精、蔗糖、单甲基琥珀酸、p-羟基丁酸、L-丙氨酰甘氨酸的利用最好。通过与现有菌株的特性比较后初步将该菌鉴定为固氮螺菌属的一个新种,命名为宪武固氮螺菌(Azospirillum xianwuii),模式菌株为Azospirillum xianwuii sp. nov. CA6(CCTCC AB208097=JCM15509).菌株降解异丙隆的实验表明,在接种量为1.0%时,四株细菌均可以在36h之内将30mg·1-1的异丙隆完全降解,最终降解率达99%以上。在降解异丙隆的同时,四株细菌利用异丙隆提供的碳氮源进行生长。菌株Y57、YBL1、YBL2和YBL3降解异丙隆的最适pH分别为7.0,培养基中异丙隆的初始浓度对菌株的降解速度的影响较小,在培养基中添加不同的金属离子对菌株的降解能力和降解速度产生不同的影响,Mg2+对菌株的降解产生促进作用,1mmol·l-1的Cu2+或Ni2+对菌株的降解有明显地抑制作用;在培养基中添加葡萄糖对菌株的降解有促进作用;菌株YBL1、YBL2和YBL3降解异丙隆的最适温度为30℃,菌株Y57的最适降解温度为35℃。菌株YBL1、YBL2、 YBL3和Y57均具有较宽的降解谱,四株细菌均可以降解异丙隆、绿麦隆、敌草隆、氟草隆等N,N.二甲基取代脲类除草剂,而YBL1菌株还可以降解甲氧基取代脲类除草剂中的利谷隆;菌株Y57不但可以降解取代脲类除草剂,还可以降解酰胺类除草剂中的敌稗,降解率达到80%以上。菌株YBL1、YBL2、YBL3可以迅速降解马肝土中的异丙隆、绿麦隆、敌草隆等除草剂;但是菌株对红壤中的除草剂的降解效果明显差于马肝土中的降解,这可能是红壤的pH过低所致;在土壤中的接种量较低时,菌株对土壤中的异丙隆的降解效果较差,只有当菌株在土壤中的浓度超过一定的数值,菌株才能对异丙隆残留有较好的降解效果。菌株在灭土壤中降解异丙隆的速率略快于新鲜土壤中的降解速度。在土壤中添加碳源、土壤的含水量、土壤中的土著微生物等对菌株降解能力产生明显地影响,其中土壤pH的影响最大。菌株YBL2降解苯脲基类化合物时,首先作用于苯环侧链,逐一脱去异丙隆N原子上所连的两个甲基基团,通过进一步的酶促反应生成相应的苯胺化合物。菌株YBL1、YBL2和YBL3降解苯胺化合物,降解苯胺的过程中生成了邻苯二酚,再通过1,2位双加氧酶降解邻苯二酚生成顺,顺-粘糠酸。其中YBL1可以降解以异丙隆为代表的双甲基取代脲类除草剂和以利谷隆为代表的N-甲基-N-甲氧基取代脲类除草剂,并且可以降解苯胺类化合物,为首次报道。菌株YBL2可以降解4-甲基邻苯二酚,但不能降解3-甲基邻苯二酚,苯胺的间位上存在的取代基团对菌株的降解产生明显地影响,使得菌株在对间位上含有取代基团的苯胺进行双加氧反应时,只有一个方向可以进行。说明间位上存在取代基团会影响到间位含有取代基团的苯胺生成的化合物的种类。通过试验发现菌株可以降低因加入绿麦隆而引起的药害,降低因加入异丙隆而对油菜的药害。将所分离的菌株发酵成菌剂投加到同时含有绿麦隆和绿黄隆残留的泰兴某处农田中,经测定菌株可以在一周之内将土壤中的0.1mg·kg-1的绿麦隆残留完全降解,直至检测不出,但在加入绿黄隆降解菌株SW3时,可使降解绿黄隆残留但降解率较低。

论文目录

  • 摘要
  • ABSTRACT
  • 符号与缩略语说明
  • 前言
  • 文献综述
  • 第一章 农药污染的生物修复
  • 1 生物修复概述
  • 1.1 原位生物修复
  • 1.2 异位生物修复
  • 1.3 生物修复的优点与局限性
  • 2 农药残留的微生物修复
  • 2.1 降解农药的微生物
  • 2.2 微生物降解的机理
  • 2.3 微生物修复中降解基因和酶的研究
  • 2.4 影响微生物降解的因素
  • 参考文献
  • 第二章 取代脲类除草剂的残留药害及微生物降解研究
  • 1 取代脲类除草剂简介
  • 1.1 取代脲类除草剂的分子结构及性质
  • 1.2 取代脲类除草剂的除草机理及使用
  • 1.3 取代脲类除草剂的毒理试验
  • 1.4 各国关于取代脲类除草剂的使用及残留的相关规定
  • 2 取代脲类除草剂在环境中的行为
  • 2.1 取代脲类除草剂在水和土壤中的动态
  • 2.2 取代脲类除草剂对环境的影响
  • 3 取代脲类除草剂产生药害
  • 4 取代脲类除草剂的降解的研究的现状
  • 4.1 异丙隆在土壤中的降解和植物中的降解
  • 4.2 取代脲类除草剂的细菌降解和降解菌株的分离
  • 4.3 取代脲类除草剂的代谢途径的研究
  • 4.4 菌株代谢降解取代脲类除草剂过程中的协同代谢作用
  • 5 双加氧酶简介
  • 6 固氮螺菌属分类的简介
  • 参考文献
  • 实验部分
  • 第一章 异丙隆降解菌株的筛选及鉴定
  • 第一节 异丙隆降解菌株的筛选
  • 1 材料与方法
  • 1.1 培养基、试剂及菌株
  • 1.2 异丙隆降解细菌的富集、分离和纯化
  • 1.3 异丙隆分析测定方法
  • 1.4 菌体生长量的测定方法
  • 1.5 菌株的鉴定
  • 1.6 菌株的抗生素抗性
  • 1.7 降解菌株质粒提取
  • 1.8 ERIC-PCR方法
  • 2 结果与讨论
  • 2.1 异丙隆降解菌株的分离
  • 2.2 降解菌株的菌落、菌体形态及生理生化特征
  • 2.3 菌株基于16S rRNA基因序列的鉴定
  • 2.4 菌株质粒的提取
  • 2.5 ERIC-PCR结果
  • 第二节 异丙隆降解菌株的生长特性
  • 1 材料与方法
  • 1.1 试剂与菌种
  • 1.2 菌种制备及菌体生长量的测定方法
  • 1.3 生长曲线的测定
  • 1.4 菌株在不同碳、氮源条件下的生长
  • 1.5 培养条件对菌株生长的影响
  • 1.6 菌株的耐盐与需盐性
  • 1.7 金属离子对菌株存活与生长的影响
  • 2 结果与讨论
  • 2.1 菌株的生长曲线
  • 2.2 菌株在不同碳源条件下的生长
  • 2.3 菌株在不同氮源条件下的生长
  • 2.4 不同培养条件对菌株生长的影响
  • 2.5 金属离子对菌株YBL2的生长的影响
  • 2.6 碳氮比对菌株生长的影响
  • 2.7 菌株的耐盐性与需盐性
  • 第三节 一株可降解取代脲类除草剂代谢产物——间氯苯胺的细菌的分类鉴定
  • 1 材料与方法
  • 1.1 培养基与菌株
  • 1.2 菌株的分离
  • 1.3 菌株的鉴定
  • 1.4 菌株固氮能力的测定
  • 1.5 菌株降解间氯苯胺
  • 1.6 菌株降解间氯苯胺
  • 2 结果与讨论
  • 2.1 降解菌株的分离与初步鉴定
  • 2.2 降解菌株的形态和培养特征
  • 2.3 菌株的化学指标测定结果
  • 2.4 菌株CA6碳源利用测定
  • 2.5 菌株的固氮能力
  • 本章小结
  • 参考文献
  • 第二章 异丙隆降解菌株降解取代脲类除草剂的特性研究
  • 第一节 异丙隆降解菌株降解水环境中取代脲类除草剂
  • 1 材料与方法
  • 1.1 培养基与试剂
  • 1.2 供试菌株及菌悬液的制备
  • 1.3 降解曲线的测定
  • 1.4 环境因素对异丙隆降解菌降解的影响
  • 1.5 降解谱试验
  • 1.6 异丙隆分析测定方法
  • 1.7 菌体生长量的测定方法
  • 2 结果与讨论
  • 2.1 异丙隆菌株的降解曲线测定与性能
  • 2.2 环境条件对菌株降解异丙隆的影响
  • 2.3 降解谱实验
  • 第二节 菌株YBL1、YBL2和YBL3降解土壤中异丙隆的特性
  • 1 材料与方法
  • 1.1 培养基、试剂及菌株
  • 1.2 异丙隆降解菌株培养及处理
  • 1.3 土壤前期处理
  • 1.4 实验过程与方法
  • 1.5 降解菌株在土壤存活能力
  • 1.6 土壤样品除草剂的提取与检测
  • 2 结果与讨论
  • 2.1 菌株降解不同土壤中的异丙隆
  • 2.2 接种量对菌株降解土壤中异丙隆的影响
  • 2.3 温度对降解的影响
  • 2.4 添加碳氮源对降解的影响
  • 2.5 菌株在新鲜土和灭菌土中降解异丙隆的差别
  • 2.6 土壤含水量(通气状况)对降解的影响
  • 2.7 菌株降解土壤中残留的其他两种除草剂
  • 本章小结
  • 参考文献
  • 第三章 菌株降解取代脲类除草剂的途径
  • 1 方法与材料
  • 1.1 培养基与试剂
  • 1.2 菌株与培养条件
  • 1.3 菌株降解取代脲类除草剂
  • 1.4 菌株降解苯胺
  • 1.5 菌株和菌株的细胞破碎液降解邻苯二酚
  • 1.6 菌株中的catA基因的扩增
  • 2 结果与讨论
  • 2.1 菌株降解除草剂和可能的代谢中间产物
  • 2.2 菌株降解取代脲类除草剂的过程中产生红色物质
  • 2.3 菌株降解苯胺类化合物
  • 2.4 YBL2降解邻苯二酚及其衍生物
  • 2.5 异丙隆降解菌株细胞破碎液降解顺,顺-粘糠酸
  • 本章小结
  • 参考文献
  • 第四章 菌株降解取代脲类除草剂的盆钵和小区实验
  • 1 材料与方法
  • 1.1 菌株与培养基
  • 1.2 菌株的活化
  • 1.3 土壤前期处理
  • 1.4 菌株Y57降解土壤中的绿麦隆的盆钵试验
  • 1.5 菌株YBL1、YBL2和YBL3降解取代脲类除草剂的水培实验
  • 1.6 菌剂的发酵
  • 1.7 小区实验
  • 1.8 土壤中除草剂残留的测定
  • 2 结果与讨论
  • 2.1 菌株降解土壤中的样品中的绿麦隆
  • 2.2 菌株降解水培溶液中的异丙隆解除除草剂对油菜生长的影响
  • 2.3 菌剂降解土壤中的绿麦隆和绿磺隆残留
  • 本章小结
  • 参考文献
  • 全文总结
  • 本文的创新点
  • 附录1 培养基及试剂配方
  • 附录2 论文中的序列
  • 附录3 菌株CA6的保藏证明
  • 附录4 脂肪酸中英文名称对照
  • 附录5 在学期间发表论文
  • 致谢
  • 相关论文文献

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