应用RNAi技术抑制鸡传染性法氏囊病病毒复制的研究

应用RNAi技术抑制鸡传染性法氏囊病病毒复制的研究

论文摘要

鸡传染性法氏囊病(Infectious Bursal Disease,IBD)是危害雏鸡的一种急性、高度接触性、病毒性传染病,给世界范围的养鸡业造成巨大经济损失。病原为鸡传染性法氏囊病病毒(Infectious Bursal Disease Virus IBDV),IBDV对宿主淋巴细胞有严格嗜性,其RNA基因组易变异,常规的疫苗设计策略难以产生理想的免疫效果,因此,探索防治该病的新方法有重要意义。RNA干扰(RNA interference,RNAi)作为新的有效抗病毒工具,其机制与建立在病毒蛋白基础上的传统的疫苗免疫机制不同,是转录后mRNA水平上的基因沉默机制,通过双链RNA(double-stranded RNA,dsRNA)分子阻断或者降低同源基因的表达而达到抗病毒复制的效果。在哺乳动物细胞中,21~23nt的小干扰dsRNA(small interfering RNA,siRNA)可以诱导同源基因特异表达抑制,为探索抗病毒研究提供了新思路。本研究针对IBDV中RNA聚合酶(VP1)的编码基因、主要结构蛋白VP2、VP3的编码基因,使用http://www.ambion.com的靶位点筛选和设计工具,分别选取3个特异siRNA序列(VP1:siRNA618、siRNA1115和siRNA2571,VP2:siRNA989、siRNA1143和siRNA1311,VP3:siRNA222、siRNA314和siRNA448),同时设计无相关序列(siRNA-CON)对照,利用体外转录法产生siRNA。VP1-siRNA、VP2-siRNA、VP3-siRNA转染Vero细胞后感染IBDV,通过病毒蚀斑和荧光定量PCR法检测VP1-siRNA对IBDV复制的抑制效果。VP2-siRNA、VP3-siRNA与表达绿色荧光蛋白(Green fluorescent protein,GFP)的重组质粒pEGFP-VP2、pEGFP-VP3共转染Vero细胞,荧光显微镜下检测表达GFP蛋白细胞比例,快速筛选有效VP2-siRNA、VP3-siRNA片段,通过病毒蚀斑和流式细胞仪分析抑制效果,验证了筛选片段的基因沉默效果。本研究为RNAi技术应用于抗IBDV感染研究奠定了基础并为研究病毒蛋白功能提供了新途径。

论文目录

  • 中文摘要
  • 英文摘要
  • 1 引言
  • 1.1 研究的目的和意义
  • 1.2 文献综述
  • 1.2.1 鸡传染性法氏囊病研究概况
  • 1.2.2 RNAI研究进展
  • 2 材料与方法
  • 2.1 细胞和病毒
  • 2.2 主要材料和试剂
  • 2.2.1 主要器材
  • 2.2.2 主要试剂
  • 2.2.3 主要分析软件
  • 2.3 实验方法
  • 2.3.1 抑制IBDV VP1、VP2、VP3蛋白表达的有效SIRNA的筛选与合成
  • 2.3.2 PEGFP-VP2、PEGFP-VP3载体的构建
  • 2.3.3 SIRNA的转染
  • 2.3.4 RNAI效果的检测
  • 3 结果与分析
  • 3.1 IBDV VP1蛋白特异的有效SIRNA序列的筛选
  • 3.1.1 体外转录法合成VP1-SIRNA
  • 3.1.2 VP1-SIRNA抑制IBDV病毒粒子的形成
  • 3.1.3 荧光定量PCR标准品PMD18-T-B重组质粒的鉴定
  • 3.1.4 VP1-SIRNA在RNA水平减少VP1蛋白的表达
  • 3.2 IBDV VP2蛋白特异的有效SIRNA序列的筛选
  • 3.2.1 体外转录法合成VP2-SIRNA
  • 3.2.2 PEGFP-VP2重组质粒的鉴定
  • 3.2.3 VP2-SIRNA抑制N-EGFP融合蛋白的表达
  • 3.2.4 VP2-SIRNA抑制IBDV病毒粒子的形成
  • 3.2.5 流式细胞仪检测VP2-SIRNA抑制N-EGFP阳性细胞
  • 3.3 IBDV VP3蛋白特异的有效SIRNA序列的筛选
  • 3.3.1 体外转录法合成VP3-SIRNA
  • 3.3.2 PEGFP-VP3重组质粒的鉴定
  • 3.3.3 VP3-SIRNA抑制N-EGFP融合蛋白的表达
  • 3.3.4 VP3-SIRNA抑制IBDV病毒粒子的形成
  • 3.3.5 流式细胞仪检测VP3-SIRNA抑制N-EGFP阳性细胞
  • 3.3.6 VP3-SIRNA在RNA水平减少VP3蛋白的表达
  • 4 讨论
  • 4.1 应用RNAI技术对IBDV研究的必要性
  • 4.2 SIRNA的设计原则
  • 4.3 RNAI的T7体外转录体系的建立及验证
  • 4.4 转染的效率
  • 5 结论
  • 致谢
  • 参考文献
  • 附录
  • 攻读硕士学位期间发表的学术论文
  • 相关论文文献

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