串联重复序列标记
2023-01-10阅读(161)

问:基于重复序列变异的dna标记是什么
- 答:第一类为基于DNA.DNA杂交的DNA标记。主要有限制性片段长度多态性标记(RFLP)、可变数目串联重复序列标记(VNTR)、单链构象多态性RFLP(SSCP、RFLP)等;
第二类为基于PCR的DNA标记。主要有随机扩增多态性DNA(RAPD),简单重复序列DNA
标记(SSR),测定序列标签位点(STS),表达序列标签(EST),测序的扩增区段(SCAR);
第三类为基于PCR与限制性酶切技术结合的DNA标记。主要有两种,一种是扩增片段艮度多态性(AFLP),第二种是酶解扩增多态顺序(CAPS);
第四类为基于单核苷酸多态性的DNA标记。主要是单核苷酸酸多态性(SNP)。
问:ssr是什么?
- 答:SSR是Simple Sequence Repeat的缩写,意思是简单重复序列标记,SSR是以PCR技术为核心的DNA分子标记技术,或称微卫星序列标记(Microsatellite sequence,MS),或短串联重复标记( Short Tandem Repeat,STR)。
1982年,Hamade等人发现了简单重复序列标记(SSR)技术,或称微卫星序列标记(Microsatellite sequence,MS),或短串联重复标记( Short Tandem Repeat,STR)。
相关信息
SSR 标记具有高度重复性、丰富的多态性、共显性、高度可靠性等优点,但由于其需要对所研究物种的一系列微卫星位点进行克隆和测序分析,以便设计相应的引物,这是非常费时、费力和代价昂贵的工作,没有足够的投资、人力和时间,是不可能实现的,因而给它的利用带来了一定困难。
问:原核生物的串联重复序列是什么
- 答:串联重复序列(Tandem
repeat
sequences):在基因组上上一段DNA序列的多次重复,称为串联重复序列。