鸡Myf5和Myf6基因的SNP多态性及其与屠宰性状和肉质性状的相关性分析

鸡Myf5和Myf6基因的SNP多态性及其与屠宰性状和肉质性状的相关性分析

论文摘要

本试验以四川省畜牧科学研究院和大恒家禽育种有限公司培育的优质鸡(共233只)为研究对象,对Myf5/Myf6基因PCR-SSCP的遗传多态性进行了研究,同时结合测定的生产资料,分析了不同基因型与胴体性状和肉质性状的相关性。结果表明:鸡Myf5基因第一外显子内存在两个SNP位点,分别是G106T和G182C,这两个位点较近,并且都是在引物3扩增的片段中发现的,经单倍型分析得,H1(AC)的频率是31.85%,H2(AD)的频率是16.00%,H3(BC)的频率是39.39%,H4(BD)的频率是12.75%,其中单倍型H1和H3在群体中处于优势地位,其频率明显高于单倍型H2和H4。Myf6基因第一外显子内存在一个SNP位点G47A,由于人工选育的原因,该基因不同基因型的分布在5个优质肉鸡纯系中偏离了Hardy-Weinberg平衡,并且杂合度较低,遗传一致性较高,但在三个杂交配套系中仍都服从Hardy-Weinberg平衡,杂合度较高,达到了配套杂交的目的。通过最小二乘分析和显著性检验发现,Myf5基因各单倍型组合型对活体重、屠体重、胸肌重和腿肌重都有显著性影响(P<0.05),其中组合型H1H1、H1H3、H3H3的活重、屠体重、胸肌重和腿肌重均显著高于组合型H2H2(P<0.05),极显著的高于组合型H4H4(P<0.01)。Myf6基因各基因型对活体重、屠体重、胸肌重和腿肌重都有显著性影响(P<0.05),其中AA型为野生型,该基因型的活重、屠体重、胸肌重和腿肌重均显著高于突变型BB型和杂合型AB型(P<0.05),并且以增重的正向加性效应为主。Myf5基因各单倍型组合型对肌纤维密度和肌纤维直径两嫩度指标有显著性影响(P<0.05),组合型H1H1、H1H3、H2H4和H3H3的肌纤维密度均显著低于H2H2型和H4H4型(P<0.05),并且H2H2型显著低于H4H4型(P<0.05),而组合型H1H3和H3H3的肌纤维直径均显著高于H2H2型和H4H4型(P<0.05)。Myf6基因各基因型对肌纤维密度和肌纤维直径两嫩度指标有显著性影响(P<0.05),AA型和AB型的肌纤维密度均显著低于BB型(P<0.05),该基因对增加肌纤维密度的加性效应和显性效应分别为-29.99和-21.18,而AA型和AB型的肌纤维直径均显著高于BB型(P<0.05),其增加肌纤维直径的加性效应和显性效应分别为1.025和0.835。

论文目录

  • 中文摘要
  • 英文摘要
  • 1 文献综述
  • 1.1 Myf5/Myf6基因的研究进展
  • 1.1.1 Myf5/Myf6基因的发现及定位
  • 1.1.2 Myf5/Myf6基因的分子结构
  • 1.1.3 Myf5/Myf6基因的功能
  • 1.1.4 Myf5和Myf6基因的生物学效应
  • 1.2 鸡肉质性状的研究现状
  • 1.3 鸡肉品质遗传基础研究状况
  • 1.4 本试验研究的目的和意义
  • 2 试验材料与方法
  • 2.1 试验材料
  • 2.1.1 供试样本
  • 2.1.2 主要仪器设备
  • 2.1.3 主要试剂及配制
  • 2.2 试验方法
  • 2.2.1 技术路线
  • 2.2.2 总DNA的提取
  • 2.2.3 DNA浓度和纯度的检测
  • 2.2.4 目的基因的扩增
  • 2.2.5 PCR产物的检测
  • 2.2.6 PCR扩增产物的PCR-SSCP分析及基因型判定
  • 2.2.7 序列结果
  • 2.3 统计分析
  • 2.3.1 基因频率和基因型频率的计算
  • 2.3.2 遗传多态性分析
  • 2.3.3 Hardy-Weinberg平衡状态的检验
  • 2.3.4 基因型与鸡的生产性能的相关分析
  • 2.3.5 核苷酸序列分析
  • 3 试验结果
  • 3.1 基因组DNA抽提结果
  • 3.2 PCR扩增结果
  • 3.2.1 引物1 PCR产物的扩增结果
  • 3.2.2 引物2 PCR产物的扩增结果
  • 3.2.3 引物3 PCR产物的扩增结果
  • 3.2.4 引物4 PCR产物的扩增结果
  • 3.2.5 引物5 PCR产物的扩增结果
  • 3.2.6 引物6 PCR产物的扩增结果
  • 3.3 PCR-SSCP多态性检测结果
  • 3.3.1 引物1 PCR-SSCP检测结果
  • 3.3.2 引物2 PCR-SSCP检测结果
  • 3.3.3 引物3 PCR-SSCP检测结果
  • 3.3.4 引物4 PCR-SSCP检测结果
  • 3.3.5 引物5 PCR-SSCP检测结果
  • 3.3.6 引物6 PCR-SSCP检测结果
  • 3.4 Myf5/Myf6基因测序结果
  • 3.5 鸡MYF5基因遗传多态性的分析
  • 3.5.1 Myf5/Myf6基因的遗传变异
  • 3.5.2 鸡MYF5基因PCR-SSCP各基因型在不同品系的频率分布
  • 3.5.3 鸡MYF6基因PCR-SSCP各基因型在不同品系的频率分布
  • 3.5.4 Myf6基因在不同品系内的遗传变异分析
  • 3.6 各种基因型与生产性能的相关研究
  • 3.6.1 Myf5基因各单倍型与胴体性状的相关研究
  • 3.6.2 Myf6基因各基因型与胴体性状的相关研究
  • 3.6.3 Myf5基因各基因型与肉质性状的相关研究
  • 3.6.4 Myf6基因各基因型与肉质性状的相关研究
  • 4 讨论
  • 4.1 Myf5基因遗传分布与变异
  • 4.2 Myf6基因遗传分布与变异
  • 4.3 关于Myf6基因在各品系内的选择变异
  • 4.4 Myf5/Myf6基因多态性对屠宰性能的遗传效应
  • 4.5 Myf5╱Myf6基因多态性对肉质性能的遗传效应
  • 5 结论
  • 参考文献
  • 致谢
  • 攻读硕士学位期间发表的主要论文:
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    • [4].阿勒泰羊Myf5基因多态性与早期生长发育性状的相关性分析[J]. 中国草食动物科学 2014(05)
    • [5].大围山微型鸡和艾维茵肉鸡骨骼肌卫星细胞增殖分化及Myf5基因表达差异研究[J]. 中国家禽 2017(11)
    • [6].海南五指山猪Myf5与MyoD基因多态性分析[J]. 中国畜牧兽医 2015(06)
    • [7].五指山猪不同组织中Myf5与MyoD1基因的表达研究[J]. 家畜生态学报 2012(05)
    • [8].MyoG与Myf5基因与京海黄鸡生长性状的相关分析[J]. 中国兽医学报 2015(09)
    • [9].Myf5基因在马身猪和大白猪背最长肌中的发育性表达研究[J]. 畜牧兽医学报 2014(12)
    • [10].山猪MYF5基因SNPs及其形成的单倍型对部分肉质性状的影响[J]. 中国畜牧杂志 2014(15)
    • [11].鸭胚骨骼肌成肌细胞中MyoD1和Myf5基因的表达与分析[J]. 福建农林大学学报(自然科学版) 2014(03)
    • [12].陆川猪Myf5基因克隆及其在背最长肌中发育性变化表达研究[J]. 黑龙江畜牧兽医 2019(11)
    • [13].水牛MYF5基因克隆分析及真核表达载体构建[J]. 中国畜牧杂志 2018(10)
    • [14].湘西黄牛Myf5和Pax7基因的SNPs检测及其与体尺性状的关联分析[J]. 畜牧兽医学报 2014(09)
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    • [20].三个猪品种Myf5基因的克隆及序列分析[J]. 山地农业生物学报 2013(02)
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