一株嗜盐菌新种的分离鉴定与特性研究

论文摘要

从舟山册子岛船舶压载水泥样S3中分离纯化出41株菌株,大多数颜色为乳白色,其次是黄色、橙色、红色。菌落形态多为圆形,其次是椭圆形和不规则形状。根据菌株的形态学特征,挑选25株菌株进行16S rDNA序列同源性分析,结果表明这些菌株分属4个不同的属：Bacillus, Marinobacter, Kordiimonas, Kangiella,其中Marinobacter属最多有16株,Bacillus属7株,Kordiimonas与Kangiella属各1株。根据序列分析结果,筛选到一株细菌疑似新种,编号S3-22。依据16S rDNA序列同源性分析、系统发育学分析等分子水平鉴定以及生理生化特性研究,结果表明：菌株菌株S3-22与Kordiimonas gwangyangensis的16S rDNA序列相似性为96.05%。G+C摩尔含量54.9mol%,主要细胞醌型为甲基萘醌MK-5,脂肪酸iso-C17:1ω99c（24.99%）。S3-22细胞形态为杆状,革兰氏染色阴性。嗜盐,最适生长条件是30-37℃,pH 7,3%NaCl。接触酶、氧化酶、淀粉酶、酯酶、明胶酶和酪氨酸酶呈阳性,可以还原硝酸盐,不产H2S。能够利用葡萄糖、麦芽糖作为单一碳源生长,可以利用葡萄糖、麦芽糖产酸。该菌为Kordiimonas属的一个新种。菌株S3-22的16S rRNA基因序列的GenBank序列号为FJ847942。本文对舟山册子岛地区海域微生物资源进行研究,从中发现了Kordiimonas属的一个新种。关于Kordiimonas属国内外的报道很少,目前该属仅有一个有效种。Kordiimonas gwangyangensis分离自韩国黄海湾海底沉积物,两者来自不同的地理位置,因此对菌株S3-22的研究既具有理论意义,又具有应用价值。

论文目录

• 摘要
• Abstract
• 第1章 绪论
• 1.1 海洋微生物概述
• 1.1.1 海洋细菌
• 1.1.2 海洋极端微生物
• 1.1.3 海洋古菌
• 1.1.4 海洋真菌
• 1.2 海洋微生物活性物质
• 1.2.1 极端酶
• 1.2.2 新型抗生素
• 1.2.3 其它生物活性物质
• 1.3 细菌分类学及应用
• 1.3.1 分类学概况
• 1.3.2 系统分类学
• 1.3.3 多相分类学
• 1.4 研究目的与意义
• 1.5 研究的技术路线
• 第2章 一株嗜盐菌新种的分离鉴定与特性研究
• 2.1 实验材料、试剂和仪器
• 2.1.1 样品
• 2.1.2 实验主要试剂
• 2.1.3 实验仪器
• 2.1.4 分离培养基
• 2.2 实验方法
• 2.2.1 菌株的分离和培养
• 2.2.2 基因组DNA的提取
• 2.2.3 PCR扩增
• 2.2.4 表型特征的观察
• 2.2.5 16S rRNA基因序列分析
• 2.2.6 系统发育树的构建
• 2.2.7 G+C mol%含量的测定
• 2.2.8 脂肪酸的测定
• 2.2.9 醌的测定
• 2.2.10 最适生长条件的测定
• 2.2.11 酶学特性研究
• 2.2.12 硝酸盐还原
• 2.2.13 硫化氢产生情况
• 2.2.14 碳源利用
• 2.2.15 糖（醇）类产酸
• 2.2.16 抗生素敏感性鉴定
• 2.3 实验结果
• 2.3.1 菌株的分离
• 2.3.2 表型特征研究
• 2.3.3 16S rDNA序列与系统发育分析
• 2.3.4 G+C摩尔含量测定结果
• 2.3.5 脂肪酸含量的测定
• 2.3.6 最适生长条件的测定
• 2.3.7 主要特性比较
• 2.3.8 底物利用结果
• 2.3.9 糖（醇）产酸结果
• 2.3.10 抗生素敏感性
• 2.4 分析与讨论
• 2.4.1 菌株的分离
• 2.4.2 菌株的系统发育分析
• 2.4.3 嗜盐性的研究
• 2.4.4 生物活性物质的研究
• 2.4.5 Kordiimonas属的介绍
• 第3章 结论
• 致谢
• 参考文献
• 攻读硕士学位期间发表的论文及科研成果