BMY牛、婆罗门牛及云南黄牛的群体遗传结构及生长发育性状的分子标记研究

BMY牛、婆罗门牛及云南黄牛的群体遗传结构及生长发育性状的分子标记研究

论文摘要

本研究采用微卫星标记为技术手段,以BMY牛、婆罗门牛(Brahman)及云南黄牛(YN cattle)3个肉牛品种(系)共计179头成年公牛为研究对象,以凝胶成像系统为平台,结合计算机软件,分析了其基因组DNA在11个微卫星位点(SPS115、INRA035、HEL1、TGLA126、TGLA53、ETH3、ETH152、BM2113、BM1824、ETH10、TGLA227)上的遗传变异,检测3个肉牛品种(系)179个个体的基因型、判断其等位基因片段大小,通过计算遗传杂合度、多态信息含量、有效等位基因数、基因型频率,对其做了群体遗传结构分析,并以体尺性状作为衡量牛生长发育性状的指标,运用最小二乘线性模型,对所检测到的多态位点与生长发育性状的关系进行了分析,所得结果如下:(1)通过对3个肉牛品种(群体)11个微卫星位点进行分析,共检测到97个等位基因,平均每个位点的等位基因数为8.8个,SPS115位点在云南黄牛中观察到的等位基因数最多,为11个位点,ETH10位点在云南黄牛和婆罗门中最少,只有4个;有效等位基因数范围在2.9836~8.2026之间;多态信息含量范围在0.6176~0.8661之间,高于0.5,属于高度多态位点。(2) 11个微卫星位点在3个群体中均为高度多态位点;SPS115、BM2113和BM1824位点的等位基因数、有效等位基因数、杂合度和多态信息含量在3个群体相对较高;ETH10和ETH3位点的对应值相对较低。(3)不同的微卫星标记在三个群体中的多态信息含量基本一致,11个标记均为高度多态,体现了群体丰富的遗传多样性。BMY牛的平均杂合度最高,从基因水平揭示了BMY牛在生产性能、生活力上优势的基础,很好地证明了BMY牛继承了终端父本婆罗门牛的很多优良特性,如良好的母性,高产肉性能,抗蜱,耐热性等。(4) 11个多态微卫星位点基因型对BMY牛、婆罗门牛及云南黄牛的生长发育性状效果不一。对11个多态微卫星位点部分基因型与3个群体体尺性状关系的分析表明,SPS115位点,L-(236bp)在体重、体高、体长、十字部高、腰角宽及尻长指标上显著低于其他基因型;HEL1位点,AD(114/108)基因型在多项体尺指标上高于其他基因型呈正效应;TGLA126位点,AB(122/100)基因型在多项体尺上显著高于其他基因型;TGLA227位点,BE(104/92)基因型在体重、胸围、体长、提高、腰角宽和坐骨宽上显著高于其他基因型,与部分体尺指标存在正相关效应;BM2113位点,在YN黄牛群体中存在A-(145bp)与部分体尺有一定程度的负相关趋势。

论文目录

  • 摘要
  • ABSTRACT
  • 第一章 文献综述
  • 1.1 3 个牛品种(系)简介
  • 1.1.1 婆罗门牛
  • 1.1.2 云南黄牛
  • 1.1.3 BMY 牛
  • 1.2 中国黄牛概况
  • 1.2.1 中国黄牛在动物分类学上的地位
  • 1.2.2 中国黄牛的分类
  • 1.3 畜禽遗传多样性
  • 1.3.1 畜禽遗传多样性保存的意义
  • 1.3.2 保种理论与方法研究
  • 1.3.3 家畜遗传多样性评估方法
  • 1.4 分子标记与动物遗传育种
  • 1.4.1 分子标记简介
  • 1.4.2 微卫星DNA 标记
  • 1.5 展望
  • 第二章 试验材料与方法
  • 2.1 材料与方法
  • 2.1.1 试验材料
  • 2.1.2 试验药品和试剂
  • 2.1.3 仪器设备
  • 2.1.4 试剂配制
  • 2.1.5 试验方法
  • 2.1.6 PCR 扩增
  • 2.1.7 统计与分析
  • 2.2 结果与分析
  • 2.2.1 基因组DNA 的提取效果及PCR 产物的检测
  • 2.2.2 基因频率及基因型频率
  • 2.2.3 3 个肉牛品种(系)微卫星位点的群体遗传特性
  • 2.2.4 3 个肉牛品种(系)微卫星位点的固定指数估计
  • 2.2.5 微卫星位点多态性与生长发育性状的相关性分析
  • 2.3 讨论
  • 2.3.1 3 个牛群体的11 个微卫星位点的遗传特性
  • 2.3.2 3 个群体的群体遗传结构及多样性
  • 2.3.3 群体的遗传分化
  • 2.3.4 微卫星位点多态性与生长发育性状的关系
  • 2.3.5 关于微卫星技术的讨论
  • 2.3.6 关于微卫星位点的选择
  • 2.4 结论
  • 参考文献
  • 附录
  • 致谢
  • 作者简介
  • 相关论文文献

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