导读:本文包含了分子标记多样性论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献，主要关键词:沙打旺,EST-SSR,转录组,遗传多样性
分子标记多样性论文文献综述
宫文龙,王赞,赵桂琴,马琳,韦宝[1]（2019）在《沙打旺EST-SSR分子标记开发及其遗传多样性分析》一文中研究指出沙打旺是一种高产优质、抗逆性强的多年生异花授粉豆科牧草,但分子标记的缺乏限制了其在遗传育种等方面的研究和利用。本研究旨在开发大量沙打旺EST-SSR分子标记,为沙打旺种质改良和遗传多样性分析提供参考资源。首先利用De novo转录组测序技术对两个沙打旺种质(CF019650, CF020070)进行RNA-seq测序,并对测序数据进行拼接获得总长度为190587631 bp的151516个unigenes。进一步在其中的30262个unigenes中检测到39163个EST-SSR位点,SSRs分布频率为25.85%。其中6635 (21.93%)条unigenes含有两个及以上SSR位点,复合SSRs有3514个(11.61%)。对所有EST-SSR位点进行引物设计,共得到22367对特异性引物。利用两个沙打旺种质(CF019650, CF020070)对随机合成的100对引物进行初步筛选,其中90对可扩增出目的特异性条带。随机选择其中51对引物对27个沙打旺种质的遗传多样性进行评估,结果表明:51对引物的平均等位基因数、平均多态性信息含量(PIC)、平均期望杂合度(He)和平均观测杂合度(Ho)分别为8.750、0.682、0.719和0.730。主成分及聚类分析结果揭示不同生态型(匍匐或直立)沙打旺种质的遗传分布具有明显的种质特异性,且聚类结果与其地理来源之间具有较高的相关性。新开发的EST-SSR分子标记可促进沙打旺遗传改良和基因组学研究,有助于沙打旺分子标记辅助育种、QTL定位和遗传变异分析。(本文来源于《草业学报》期刊2019年11期）
林丽,张敏,杜争,朱田田,孙少伯[2]（2019）在《基于ISSR分子标记对黑河流域中下游黑果枸杞16个居群的遗传多样性分析》一文中研究指出目的研究黑河流域中下游黑果枸杞16个野生居群的遗传多样性,为黑果枸杞的遗传育种及保护机制研究提供依据。方法在建立ISSR分子标记的基础上,人工读带确定引物位点,利用Popgen32软件分析黑果枸杞的多态性、遗传相似系数及遗传距离。使用NTSYS软件建立黑果枸杞的遗传距离聚类图。结果采用6个ISSR引物对16个黑果枸杞居群的基因组DNA进行扩增后共检测到126个位点,多态位点百分率为92.86%,不同居群间的多态位点百分率范围为6.35%～50.00%。Nei’s基因多样性指数H为0.2228,Shannon信息指数I为0.3459,分析得出居群间的变异为41.85%。聚类的遗传距离介于0.03～0.16,大体聚为2类。结论黑河流域中下游黑果枸杞在种群水平上遗传多样性丰富,对环境的适应能力较强;黑果枸杞有复杂的遗传背景,且与地理来源相关性不强。(本文来源于《中国中医药信息杂志》期刊2019年11期）
魏小星,阿启兰,张燕,刘勇,刘文辉[3]（2019）在《基于ISSR分子标记的早熟禾种质资源遗传多样性分析》一文中研究指出本研究以青海和西藏不同地理位置的60份早熟禾种质资源为材料,通过ISSR分子标记进行遗传多样性分析,以期了解青藏高原主体地区早熟禾种质资源间遗传关系,为种质创新及新品种选育提供理论依据。结果表明,在30条ISSR引物中共扩增出297条谱带,其中多态性谱带296条,多态性比率达到99.66%;等位基因平均值(na*)为1.996 6,有效等位基因平均值(ne*)为1.539 3,Nei's基因指数平均值(h*)为0.320 1,shannon's信息指数平均值(I*)为0.484 7;遗传相似系数阈值范围在0.525 3～0.878 8之间;根据UPGMA聚类分析,在遗传相似系数0.61处,60份早熟禾种质材料被聚为4大类,其中A大类、B大类和C大类分别占总量的76.7%、5%、16.7%,D大类只有一份材料单独聚为一类;整个聚类分析中,大部分来自相近或者相同地理区域的种质材料聚于同一类或者亚类,但种质材料间也有交叉现象。(本文来源于《分子植物育种》期刊2019年20期）
樊丛照,郎乾坤,朱军,王果平,宋海龙[4]（2019）在《昆仑雪菊表型性状及分子标记的遗传多样性研究》一文中研究指出目的:从表型性状和分子学角度研究双色金鸡菊种质资源的多样性。方法:对双色金鸡菊19个采集地120份供试样品的10个表型性状进行统计,并用14条简单重复序列区间(ISSR)引物进行聚合酶链式反应(PCR)扩增,电泳检测后统计条带;使用SPSS 21.0等软件分析表型数据,PopGene 32分析条带统计结果。结果:表型性状中株高的遗传多样性信息指数最高,其次是花冠大小和花色差异、茎杆粗细;聚类结果可将19个采集地样品聚为两大类,其中引种高海拔山区的双色金鸡菊有聚在一起的趋势。ISSR-PCR扩增结果显示双色金鸡菊在物种水平上有较高的遗传多样性,不同产地有明显的遗传分化;聚类结果将19个采集地的双色金鸡菊分为5大类,皮山县等高海拔地区样品在遗传物质上显示出较强的地域性。结论:昆仑雪菊种质资源存在地域性的遗传分化,表型性状和ISSR分子标记可对昆仑雪菊的种质资源进行评价。(本文来源于《中国现代中药》期刊2019年10期）
夏春阳,杜吉到,韩毅强,孙浩月,李明[5]（2019）在《基于SSR分子标记的普通菜豆种质遗传多样性分析》一文中研究指出建立SSR-PCR反应体系对69份菜豆种质资源进行遗传多样性分析,并利用UPGMA法进行聚类分析及类群划分。17对SSR标记共检测获得等位变异位点55个,变幅2～5个,平均每对检测到标记3.24个;17对引物的多态性位点数17个,多态性百分含量100%。根据聚类分析结果:材料间遗传相似性系数(GS)变异范围0.392～0.963,平均值为0.659;在遗传相似系数0.67水平上将69份菜豆种子材料分为4个类群,说明普通菜豆种质遗传多样性丰富。(本文来源于《食品与机械》期刊2019年10期）
杨贞,蔡友铭,张永春,杨柳燕,王艺程[6]（2019）在《基于SRAP分子标记的铁皮石斛遗传多样性分析》一文中研究指出利用SRAP分子标记法对13份来自中国不同产地的铁皮石斛品种的基因组DNA进行分析,从分子水平研究铁皮石斛的遗传多样性和亲缘关系。结果表明:从81对引物中筛选出15对引物,在13份材料中共扩增出238条清晰的多态性条带,占总条带数的96. 75%。13份材料间的遗传相似系数为0. 44—0. 79,在相似系数0. 46处13份材料被划分为3个类群。研究结果可为不同产地铁皮石斛品种亲缘关系的鉴定以及种质资源的利用与保护提供理论依据。(本文来源于《上海农业学报》期刊2019年05期）
高鹏华,于文剑,赵芮,熊阳阳,王锦[7]（2019）在《基于ISSR标记的藤本月季品种遗传多样性及其分子身份证的构建》一文中研究指出38个藤本月季品种ISSR分子标记结果表明,23条引物共扩增出212个多态性位点,多态性比率高达72.35%。基因分化系数GS值变化范围在0.755～0.971,变化幅度较小,品种亲缘关系较近。38个藤本月季品种的群体遗传参数中平均观测等位基因数为1.973 5,平均有效等位基因数1.578 1,平均Nei's基因多样性指数为0.372 6,平均Shannon's信息指数为0.572 3。38个品种间的遗传分化系数(G_(st))为0.785 6,基因流(N_m)为0.058 4,表明38个品种遗传多样性丰富。由聚类分析图可知,38个品种可聚为3个大类7个分支。以23条引物中多态性较好且能区分这38个供试品种的17条引物对不同品种扩增条带进行统计,建立了38个藤本月季品种的分子身份证。(本文来源于《江苏农业科学》期刊2019年18期）
汪昊,牛玉蓉,荣成博,刘宇,王守现[8]（2019）在《19个香菇菌株基于ISSR、SRAP和TRAP分子标记的遗传多样性分析》一文中研究指出利用简单重复序列间扩增(inter-simple sequence repeat,简称ISSR)、相关序列扩增多态性(sequencerelated amplified polymorphism,简称SRAP)和目标区域扩增多态性(target region amplified polymorphism,简称TRAP)分子标记对19个香菇栽培菌株进行遗传多样性分析。结果显示,共筛选出34对(条)多态性丰富的引物,获得303条数据条带,其中多态性条带254条,多态性比例为83. 83%,在遗传相似系数为0. 75的水平上,将19个菌株分为6类。3种标记的多态性比例排序如下:TRAP(91. 14%)> ISSR(83. 15%)> SRAP(80. 00%)。由结果可知,综合不同分子标记进行香菇的遗传多样性分析,可更加准确地反映菌株间的亲缘关系。(本文来源于《江苏农业科学》期刊2019年17期）
刘亚令,耿雅萍,解潇冬,王芳,张鹏飞[9]（2019）在《基于SSR分子标记的药用黄芪遗传多样性与遗传结构分析》一文中研究指出为了能更好的了解药用黄芪(Astragali Radix)遗传多样性及遗传结构,本试验利用10对SSR引物对来自17个产地共380个样本的蒙古黄芪、膜荚黄芪进行遗传多样性及结构分析,结果显示药用黄芪具有较高程度的遗传多样性水平(I=2.112,H=0.781),其中蒙古黄芪遗传多样性水平(I=2.241,H=0.804)要高于膜荚黄芪(I=1.982,H=0.757),且两种黄芪的遗传变异主要发生在居群内;UPGMA聚类分析及STRUCTURE居群遗传结构分析可将其分为3组,即膜荚黄芪为单独一组,蒙古黄芪分为两组,其中来自山西产区的大部分居群分为一组,来自内蒙产区及部分山西产区的居群分为另一组。本研究结果对药用黄芪种质资源的有效利用、遗传多样性的保护、育种及开发优质黄芪种质资源提供一定的理论基础。(本文来源于《草地学报》期刊2019年05期）
蔡莉,赵致,刘红昌,李金玲,杨继勇[10]（2019）在《基于SRAP分子标记的金钗石斛遗传多样性研究》一文中研究指出目的研究贵州赤水主要金钗石斛种植基地的金钗石斛栽培种的遗传多样性。方法采集贵州赤水4个不同地区共15份金钗石斛栽培种样品,运用SRAP分子标记法检测其遗传多样性。结果 15对引物组合共扩增出383条带,其中多态性条带共351条,多态性百分率为91.64%。平均每对引物扩增出的条带数和多态性条带数分别为25.5条和23.4条。各金钗石斛栽培种样品间的遗传相似系数在0.4729～0.7977,平均为0.6063。从UPGMA聚类分析的结果来看,以阈值0.6063可将这15份栽培种样品分为3类。结论 15份金钗石斛样品多态性丰富,SRAP分子标记法能有效地反映出金钗石斛栽培种的遗传多样性;多年种植后同一栽培种的高矮杆遗传差异不明显,高矮杆可能是环境作用的结果;同一地区但不同栽培种遗传差异较大,环境并未完全同质化不同来源栽培种的遗传差异。(本文来源于《时珍国医国药》期刊2019年08期）
分子标记多样性论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
目的研究黑河流域中下游黑果枸杞16个野生居群的遗传多样性,为黑果枸杞的遗传育种及保护机制研究提供依据。方法在建立ISSR分子标记的基础上,人工读带确定引物位点,利用Popgen32软件分析黑果枸杞的多态性、遗传相似系数及遗传距离。使用NTSYS软件建立黑果枸杞的遗传距离聚类图。结果采用6个ISSR引物对16个黑果枸杞居群的基因组DNA进行扩增后共检测到126个位点,多态位点百分率为92.86%,不同居群间的多态位点百分率范围为6.35%～50.00%。Nei’s基因多样性指数H为0.2228,Shannon信息指数I为0.3459,分析得出居群间的变异为41.85%。聚类的遗传距离介于0.03～0.16,大体聚为2类。结论黑河流域中下游黑果枸杞在种群水平上遗传多样性丰富,对环境的适应能力较强;黑果枸杞有复杂的遗传背景,且与地理来源相关性不强。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
分子标记多样性论文参考文献
[1].宫文龙,王赞,赵桂琴,马琳,韦宝.沙打旺EST-SSR分子标记开发及其遗传多样性分析[J].草业学报.2019
[2].林丽,张敏,杜争,朱田田,孙少伯.基于ISSR分子标记对黑河流域中下游黑果枸杞16个居群的遗传多样性分析[J].中国中医药信息杂志.2019
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[4].樊丛照,郎乾坤,朱军,王果平,宋海龙.昆仑雪菊表型性状及分子标记的遗传多样性研究[J].中国现代中药.2019
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[10].蔡莉,赵致,刘红昌,李金玲,杨继勇.基于SRAP分子标记的金钗石斛遗传多样性研究[J].时珍国医国药.2019