蛙虹彩病毒RGV一个膜蛋白基因的鉴定

蛙虹彩病毒RGV一个膜蛋白基因的鉴定

论文摘要

从本实验室保存的蛙虹彩病毒(Ranivirus)RGV(Rana grylio virus)的基因组中,克隆出一个预测可能是膜蛋白的基因MMP (Myristylated membrane protein),运用病毒学技术、免疫学技术和分子生物学技术,对MMP基因进行特征分析。根据与RGV同源性很高的FV3相应基因设计引物从RGV基因组中克隆出全长1038bp的MMP基因,对其测序并使用几种软件进行分析。MMP基因最大的ORF长972bp,编码323个氨基酸,分子量为35kDa,氨基酸序列与同属的其它病毒相应蛋白的同源性高达91-99%,预测氨基酸序列有一个跨膜区。对MMP基因进行原核表达,得到分子量为53 kDa的缺失跨膜区的融合蛋白表达产物,制备出抗体。通过亚细胞定位和Western blot等实验初步证实MMP基因编码膜蛋白。

论文目录

  • 中文摘要
  • 英文摘要
  • 第一章 文献综述
  • 1.1 虹彩病毒的特性和分类
  • 1.2 蛙虹彩病毒的复制
  • 1.2.1 病毒的吸附、进入和脱壳
  • 1.2.2 病毒DNA的复制
  • 1.2.3 病毒的转录及翻译
  • 1.2.4 病毒的装配与释放
  • 1.3 蛙虹彩病毒与宿主细胞的相互作用
  • 1.4 病毒蛋白的特性
  • 1.5 病毒膜蛋白的特性及功能
  • 1.6 病毒膜蛋白的体外表达
  • 1.7 本研究的背景及研究目的
  • 实验材料
  • 第二章 蛙虹彩病毒RGV9506 MMP 基因的克隆及序列分析
  • 2.1 方法
  • 2.1.1 MMP 基因的克隆及序列分析
  • 2.1.2 PCR 片断的回收与载体连接
  • 2.1.3 转化感受态细胞
  • 2.1.4 阳性克隆的筛选及MMP 基因的序列测定
  • 2.1.5 序列同源性、多序列比对分析及遗传进化树的绘制
  • 2.2 结果
  • 2.2.1 RGV9506 MMP 基因的扩增
  • 2.2.2 MMP 序列及翻译
  • 2.2.3 蛋白同源性及多重序列比对结果
  • 2.2.4 跨膜结构域的预测
  • 2.2.5 系统进化树分析结果
  • 2.3 讨论
  • 第三章 蛙虹彩病毒RGV9506 MMP 基因的特征分析
  • 3.1 方法
  • 3.1.1 原核表达载体的构建
  • 3.1.1.1 PCR扩增MMP基因
  • 3.1.1.2 酶切
  • 3.1.1.3 连接
  • 3.1.1.4 质粒的提取
  • 3.1.2 MMP 原核表达及鉴定
  • 3.1.3 抗血清的制备
  • 3.1.3.1 蛋白制备
  • 3.1.3.2 蛋白纯化
  • 3.1.3.3 免疫
  • 3.1.4 Western blot 分析
  • 3.1.5 RGV MMP蛋白在细胞内分布的检测
  • 3.1.6 Western blot分析病毒MMP蛋白
  • 3.1.6.1 病毒纯化
  • 3.1.6.2 Western blot分析
  • 3.1.7 RT-PCR检测MMP基因及Western blot分析
  • 3.1.7.1 RNA 的提取
  • 3.1.7.2 RT-PCR 扩增MMP基因
  • 3.1.7.3 Western blot 分析
  • 3.1.8 药物抑制蛋白合成和病毒DNA 复制的实验
  • 3.1.9 真核表达分析
  • 3.1.9.1 重组真核表达质粒的构建
  • 3.1.9.2 重组真核表达质粒在FHM 细胞中的表达
  • 3.2 结果
  • 3.2.1 PCR 扩增MMP 基因
  • 3.2.2 构建的原核重组质粒
  • 3.2.3 诱导表达结果
  • 3.2.4 Western blot 分析结果
  • 3.2.5 MMP蛋白在细胞内分布的检测
  • 3.2.6 Western blot分析病毒MMP蛋白
  • 3.2.7 MMP 基因时序表达的RT-PCR 和Western Blot 分析
  • 3.2.8 药物抑制蛋白合成和病毒DNA 复制的实验
  • 3.2.9 真核表达分析
  • 3.2.9.1 PCR 扩增MMP 基因
  • 3.2.9.2 构建的真核重组质粒
  • 3.2.9.3 MMP 基因在FHM 细胞中的表达
  • 3.3 讨论
  • 小结
  • 参考文献
  • 致谢
  • 相关论文文献

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