论文摘要
制全貌，为临床诊治提供新的潜在靶点。 材料与方法：1、收集10例施行正位肝移植的HCC患者的癌、癌旁和正常肝组织，应用H&E染色确认相关组织的病理类型，应用Trizol一步法抽提配对组织的总RNA；2、应用1％琼脂糖凝胶电泳和芯片实验室（Lab-on-chip）进行RNA质量检测；3、按QIAGENRNeasy（?） Mini Kit说明，进行总RNA纯化、逆转录cRNA合成、荧光标记和纯化；4、将癌组织和正常肝组织、癌组织和癌旁肝组织的cRNA探针分别与Agilent寡核苷酸芯片（21，073探针）进行杂交，洗涤后应用Aailent Scanner获取图像，应用Feature Extraction软件进行定量分析处理，应用cluster分析软件进行聚类分析，通过Treeview软件以树状图形式显示；5、挑选明显差异表达的代表基因4个，其中包括上调和下调基因各2个，以β-actin为内对照基因，由上海生工生物公司设计合成目的基因引物前导链和后随链，按Invitrogen RT-PCR kit说明进行SYBR Green Ⅰ染料掺入的荧光real time RT-PCR绝对定量验证分析；6、挑选差异表达的代表基因6个，其中包括5个上调基因和1个下调基因，在高通量肝癌特异性组织芯片（产品批号：OD-CT-DgLiv01-001）上应用S-P法验证代表基因在蛋白水平的表达，采用SPSS10.0软件包分析相关基因的表达与HCC临床病理参数之间以及基因相互之间的相关性。 结果：1、H&E染色结果显示癌、癌旁以及正常肝组织呈现典型的组织病理变化，1％琼脂糖凝胶电泳和Lab-on-chip电泳结果均提示提示配对组织总RNA的质量高，无降解现象。2、高通量Agilent寡核苷酸芯片扫描发现在癌和癌旁组织的差异基因表达谱中，2倍上调的的差异表达基因（differentially expressed genes，DEGs）共1295个，而癌与正常肝组织的数目为1074个，综合两者的共同DEGs，共420个；相应的，在癌和癌旁组织2倍下调的DEGs共1320个，而癌与正常肝组织的数目为1107个，共同下调的DEGs为552个。3、Cluster聚类分析显示HCC的发生发展过程涉及癌基因与抑癌基因、编码离子通道和蛋白转运相关的基因、编码细胞周期相关蛋白的基因、与细胞应激相关的基因、细胞骨架和运动相关的基因、细胞凋亡相关的基因、调节DNA合成、修复和重排相关的基因、细胞因子受体相关基因、免疫蛋白相关基因、细胞代谢相关基因、信号转导相关基因、调节转录的基因、与生长发育相关的基因等，尚有部分基因不能分类或为表达序列标签（expression sequence tags，ESTs）。4、差异基因表达谱中，包含12个5倍以上上调表达的基因，分别是CTHRC1、UCHL1、PPP1R9A、CTSL2、POSTN、NQO1、DKK1、AGR2、MMP-12、SULT1C1、LAPTM4B和PEG10；7个10倍以上下调表达的基因，分别是3个细胞色素P450基因（CYP2C9、CYP2A7和CYP2C8）、
论文目录
相关论文文献
- [1].人肝癌组织及癌旁正常肝组织的mRNA差异表达谱[J]. 世界华人消化杂志 2014(31)
- [2].盘状结构域受体在人肝癌、肝硬化与正常肝组织中的表达及其意义[J]. 宁夏医学杂志 2014(09)
- [3].基于生物信息学筛选肝细胞癌年轻患者特有关键枢纽基因及其临床意义[J]. 中国肿瘤生物治疗杂志 2020(02)
- [4].肝血管平滑肌脂肪瘤一例[J]. 临床放射学杂志 2008(12)
- [5].EZH2在肝癌中的表达及其临床意义[J]. 广西医科大学学报 2010(01)
- [6].单酰甘油脂肪酶在原发性肝细胞肝癌中的表达及意义[J]. 广东医学 2012(18)
- [7].KHK的基因在癌细胞与正常肝组织中的表达有所不同[J]. 临床合理用药杂志 2016(11)
- [8].WFDC-1基因在原发性肝癌组织中的表达及其临床意义[J]. 中国癌症防治杂志 2011(01)
- [9].高尔基体α-甘露糖苷酶Ⅱ和E-钙黏素在正常肝组织及肝癌组织中的表达及其意义[J]. 中国生物制品学杂志 2011(05)
- [10].原发性肝癌癌旁组织生长激素受体的基因研究[J]. 岭南现代临床外科 2008(03)
- [11].VEGF-C蛋白在肝癌组织中的表达及临床意义[J]. 中国医药导刊 2013(03)
- [12].TFPI-2在肝癌和正常肝组织中表达的差异[J]. 重庆医科大学学报 2009(11)
- [13].组织因子途径抑制物-2基因在肝癌和正常肝组织中表达的差异——外源性TFPI-2基因导入及表达实验性肝癌治疗的前期探讨[J]. 内蒙古中医药 2010(13)
- [14].肝癌中Bcl-2、Bax和C-myc基因的表达及其临床意义[J]. 中国老年学杂志 2009(04)
- [15].H22荷瘤小鼠组织蛋白质的双向电泳比较[J]. 中国老年学杂志 2016(22)
- [16].精氨酸酶-1在肝细胞癌中的低表达及其临床意义[J]. 中国癌症杂志 2014(06)
- [17].肝细胞癌的磁共振弥散加权成像研究[J]. 西部医学 2013(11)
- [18].兔VX2肝移植瘤及正常肝组织的磁共振灌注成像的对比研究[J]. 国际医学放射学杂志 2012(01)
- [19].核转录因子与β-连环蛋白在肝癌中的表达及意义[J]. 现代肿瘤医学 2009(08)
- [20].FN及PTEN在肝细胞肝癌中的表达和临床相关性研究[J]. 中华普外科手术学杂志(电子版) 2015(05)
- [21].MDM2和PTEN表达与肝癌发生发展的相关性[J]. 广东医学 2010(09)
- [22].大肠癌肝转移灶及其周围正常肝组织中MMP2表达的比较[J]. 南京医科大学学报(自然科学版) 2009(09)
- [23].热休克蛋白70(HSP70)在肝癌中的表达及其临床意义[J]. 中国当代医药 2009(12)
- [24].肝细胞癌衍生生长因子与肝细胞癌的相关性[J]. 现代肿瘤医学 2017(10)
- [25].~(125)I放射性粒子组织间植入对兔VX2肝移植瘤疗效及对周围正常肝组织的影响[J]. 山东大学学报(医学版) 2012(02)
- [26].EZH2和血管内皮生长因子在肝癌中的表达及其临床意义[J]. 实用医学杂志 2009(23)
- [27].血管内皮生长因子在肝细胞癌中的表达及其临床价值[J]. 河北医学 2008(06)
- [28].Beclin1和NF-κB p65在肝癌中的表达及其临床意义[J]. 世界华人消化杂志 2008(20)
- [29].P-糖蛋白在肝细胞癌鉴别诊断中的价值[J]. 诊断病理学杂志 2017(04)
- [30].超声造影定量分析技术对肝血管瘤的诊断价值[J]. 现代医学 2020(09)