草酸盐高效降解菌的筛选及其酶学性质研究

草酸盐高效降解菌的筛选及其酶学性质研究

论文摘要

草酸盐降解菌及其降解酶的研究具有很多潜在的应用价值。一方面可用于致病真菌Sclerotinia sclerotiorum所引起的重要经济作物菌核病的防治,及抗病性转基因植物的生产:另一方面,草酸盐降解酶被用于诊断和治疗与草酸盐相关的疾病,如肾结石,以及环境的生物治理。本论文分离筛选出具有较强草酸盐降解能力的新菌,并对该菌降解酶的酶学性质及降解机理进行了研究。在酸性介质中草酸能够催化重铬酸钾对次甲基蓝的氧化脱色反应,这种催化效率与草酸浓度呈正相关,据此建立了次甲基蓝-重铬酸钾体系测定草酸的方法。实验证明,在660 nm处不加草酸与加草酸的次甲基蓝-重铬酸钾体系反应后的吸光度差值△A在0~80μg/mL范围内与草酸浓度呈线性关系,线性方程为:△A=0.0984ρ草酸-0.0044,相关系数为0.9986。反应的最适条件为3.752×10-5mol/L次甲基蓝、0.12mol/L H2SO4和2×10-3mol/L K2Cr2O7。以草酸盐为唯一碳源和能源,从土壤中分离筛选获得一株能够降解草酸及其盐类的细菌,命名为OXJ-11。该菌在形态培养基形成的菌落为乳白色,圆形;革兰氏阴性染色为阴性杆菌;经电镜观察,为端生双鞭毛。接触酶阳性:不还原硝酸盐。能够在温度25℃-35℃范围内和pH6.0-10.0范围内好氧生长。根据其形态特征、生理生化特征及16SrRNA序列同源性分型,OXJ-11为Pandoraea属的一株新菌。这种菌能够合成草酸盐降解酶。OXJ-11产酶的最适发酵培养基配方为:0.5%草酸钠,0.3%酵母浸粉,0.05%MgSO4·7H2O,最适温度为30℃,pH为6.0-7.0。Pandoraea sp.OXJ-11的草酸盐降解酶为底物草酸盐诱导酶。以次甲基蓝-重铬酸钾氧化还原法测定反应体系草酸盐的减少量,建立了草酸盐降解酶的酶促反应体系。该酶为胞壁酶,超声破碎的条件为:输出功率200w-300w,超声破碎0.5s、间歇5s,破碎总时间7min。草酸盐降解酶的最适初始底物浓度为0.7mg/mL;最适反应温度为30℃;30℃下保温酶活力较稳定;酶反应的最适pH范围较宽为5.5-8.0;粗酶液在pH7.0-8.0范围内保温比较稳定;不同浓度的Fe2+和Cr3+对酶均有抑制作用;SDS对酶有很强的抑制作用;10mmol/L的Mg2+对酶有一定的激活作用;NaCl对酶活力有较大的影响,0.15mol/L NaCl可使酶活力下降约50%,浓度达到0.3mol/L时酶活力完全丧失。草酸盐降解酶的酶解产物之一为二氧化碳,当反应体系中含有阳离子时,二氧化碳会与阳离子反应生成碳酸盐。而过氧化氢不是酶反应产物。甲酸盐为酶解反应的另一产物,但由于OXJ-11菌中含有甲酸盐脱氢酶,因此,甲酸盐被进一步降解生成二氧化碳。OXJ-11菌的草酸盐降解酶所催化的反应,必须在有氧条件下才能进行。草酸和琥珀酸为草酸盐降解酶的可替换底物。ATP和ADP对草酸钠降解酶活性均有不同程度的抑制作用。

论文目录

  • 摘要
  • Abstract
  • 引言
  • 1 文献综述
  • 1.1 草酸盐与植物
  • 1.1.1 植物草酸的功能
  • 1.1.2 过量草酸盐对植物的毒害作用及预防
  • 1.2 草酸盐在动物饲料中的毒害作用及预防
  • 1.3 草酸盐与人类健康
  • 1.3.1 草酸和草酸盐是天然有毒物质
  • 1.3.2 草酸盐与人类结石
  • 1.4 草酸盐与微生物
  • 1.4.1 草酸盐与真菌
  • 1.4.2 嗜草酸盐细菌
  • 1.4.3 草酸盐降解菌的生物技术应用
  • 1.5 草酸盐的检测方法
  • 1.5.1 比色法
  • 1.5.2 高效液相色谱法
  • 1.5.3 分光光度法及其利用草酸特性检测法
  • 1.5.4 离子色谱法
  • 1.5.5 酶法
  • 1.6 草酸盐降解酶
  • 1.6.1 草酸盐氧化酶
  • 1.6.2 草酸盐脱羧酶
  • 1.6.3 草酰辅酶A脱羧酶/甲酰辅酶A转移酶
  • 1.7 本论文研究的目的、意义及内容
  • 1.7.1 研究目的和意义
  • 1.7.2 研究内容
  • 2 草酸盐检测方法的确立
  • 2.1 材料与方法
  • 2.1.1 实验材料
  • 2.1.2 测定方法
  • 2.1.3 次甲基蓝-重铬酸钾体系的吸收光谱
  • 2.1.4 反应时间对次甲基蓝-重铬酸钾体系的影响
  • 2.1.5 次甲基蓝-重铬酸钾体系中各因素的反应条件优化
  • 2.1.6 温度对次甲基蓝-重铬酸钾体系的影响
  • 2.1.7 草酸催化反应的终止
  • 2.1.8 工作曲线、准确度及检出限
  • 2.1.9 干扰因素的影响
  • 2.1.10 次甲基蓝-重铬酸钾体系的分析应用
  • 2.1.11 次甲基蓝-重铬酸钾体系在酶活力测定中的应用
  • 2.2 结果与讨论
  • 2.2.1 次甲基蓝-重铬酸钾体系的吸收光谱
  • 2.2.2 反应时间对次甲基蓝-重铬酸钾体系的影响
  • 2.2.3 次甲基蓝-重铬酸钾体系中各因素的反应条件优化
  • 2.2.4 温度对次甲基蓝-重铬酸钾体系的影响
  • 2.2.5 草酸催化反应的终止
  • 2.2.6 工作曲线、准确度及检出限
  • 2.2.7 干扰因素的影响
  • 2.2.8 分析应用
  • 2.2.9 次甲基蓝-重铬酸钾体系在酶活力测定中的应用
  • 2.3 本章小结
  • 3 草酸盐降解菌的筛选鉴定及发酵条件研究
  • 3.1 材料与方法
  • 3.1.1 实验材料
  • 3.1.2 培养基的配制
  • 3.1.3 草酸盐降解菌的分离
  • 3.1.4 细菌的形态观察
  • 3.1.5 菌株的鉴定与生理生化反应
  • 3.1.6 16SrRNA基因片断序列分析
  • 3.1.7 系统发育树分析
  • 3.1.8 不同种类碳源对菌体生长及产酶活力的影响
  • 3.1.9 不同碳源含量对菌体生长及产酶活力的影响
  • 3.1.10 不同种类氮源对菌体生长及产酶活力的影响
  • 3.1.11 不同氮源含量对菌体生长及产酶活力的影响
  • 3.1.12 温度对菌体生长及产酶活力的影响
  • 3.1.13 初始pH对菌体生长及产酶活力的影响
  • 3.1.14 接种量对菌体生长及产酶活力的影响
  • 3.1.15 发酵生长曲线的测定
  • 3.1.16 培养时间对产酶活力的影响
  • 3.1.17 菌体量的测定方法
  • 3.1.18 草酸盐含量的测定方法
  • 3.1.19 酶活力的测定方法
  • 3.1.20 草酸离体叶片的防病实验
  • 3.2 结果与讨论
  • 3.2.1 草酸盐降解菌的分离
  • 3.2.2 生理生化特性
  • 3.2.3 16S rRNA序列分析
  • 3.2.4 不同碳源种类对菌体生长及产酶活力的影响
  • 3.2.5 不同碳源含量对菌体生长及产酶活力的影响
  • 3.2.6 不同氮源种类对菌体生长及产酶活力的影响
  • 3.2.7 不同氮源含量对菌体生长及产酶活力的影响
  • 3.2.8 温度对菌体生长及产酶活力的影响
  • 3.2.9 初始pH对菌体生长及产酶活力的影响
  • 3.2.10 不同接种量对菌体生长及产酶活力的影响
  • 3.2.11 发酵生长曲线的测定
  • 3.2.12 发酵时间对产酶活力的影响
  • 3.2.13 油菜离体叶片的防病实验
  • 3.3 本章小节
  • 4 粗酶酶学性质的研究
  • 4.1 材料与方法
  • 4.1.1 实验材料
  • 4.1.2 培养基的配制及接种方法
  • 4.1.3 酶在细胞中位置的确定
  • 4.1.4 蛋白含量的测定—考马斯亮蓝法
  • 4.1.5 蛋白质标准曲线的绘制
  • 4.1.6 超声破碎时间的确定
  • 4.1.7 酶促反应初速度时间范围的确定
  • 4.1.8 酶活力的测定方法
  • 4.1.9 初始底物浓度对酶活力的影响
  • 4.1.10 温度对酶活力的影响
  • 4.1.11 酶的热稳定性
  • 4.1.12 pH对酶活力的影响
  • 4.1.13 酶的酸碱稳定性
  • 4.1.14 金属离子对酶活力的影响
  • 4.1.15 不同试剂对酶活力的影响
  • 4.1.16 不同浓度NaCl对酶活力的影响
  • 4.2 实验结果与讨论
  • 4.2.1 酶在细胞中位置的确定
  • 4.2.2 蛋白质标准曲线的绘制
  • 4.2.3 超声破碎时间的确定
  • 4.2.4 酶促反应初速度时间范围的确定
  • 4.2.5 初始底物浓度对酶活力的影响
  • 4.2.6 温度对酶活力的影响
  • 4.2.7 酶的热稳定性
  • 4.2.8 pH对酶活力的影响
  • 4.2.9 酶的酸碱稳定性
  • 4.2.10 金属离子对酶活力的影响
  • 4.2.11 不同试剂对酶活力的影响
  • 4.2.12 不同浓度NaCl对酶活力的影响
  • 4.3 本章小结
  • 5 酶降解机理的研究
  • 5.1 材料与方法
  • 5.1.1 实验材料
  • 5.1.2 培养基的配制及接种方法
  • 5.1.3 酶降解产物的测定方法
  • 5.1.4 酶系组成的研究
  • 5.1.5 酶解需氧情况的研究
  • 5.1.6 可替换底物的研究
  • 5.1.7 产物抑制
  • 5.1.8 底物影响
  • 5.2 结果与讨论
  • 5.2.1 酶解产物研究
  • 5.2.2 酶系组成的研究
  • 5.2.3 酶解需氧情况研究
  • 5.2.4 可替换底物的研究
  • 5.2.5 产物抑制
  • 5.2.6 ATP、ADP对酶活力的影响
  • 5.2.7 琥珀酸钠对酶活力的影响
  • 5.3 本章小结
  • 6 结论
  • 1 本文实验研究总结
  • 2 本论文的创新之处
  • 3 工作展望
  • 参考文献
  • 攻读博士学位期间发表学术论文情况
  • 致谢
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