凉水国家自然保护区天然红松种群遗传多样性在时间尺度上变化的cpSSR分析

论文摘要

本文应用叶绿体微卫星（cpSSR）技术对凉水国家自然保护区天然红松（Pinus koraiensis）种群的遗传多样性在时间尺度上的变化进行了遗传分析。共选择121个树龄在1581-1900年间的红松个体,连续分为6个龄级。从6对叶绿体SSR引物筛选出两对引物,共检测到7个位点,其中多态位点5个,多态位点比率为71.43%。利用POPGENE分析软件计算了红松各龄级内的遗传多样性指数,分析了遗传多样性在红松各龄级间的变化。由Nei指数估算出红松龄级内基因多样性的平均值为0.1985,龄级间基因多样性的平均值为0.0164,种群基因多样性平均值为0.2149,可以算出,龄级内的遗传变异占92.37%,而龄级间只有7.63%,表明红松龄级间遗传多样性分化不明显,遗传多样性主要存在于龄级内。由红松各龄级的Shannon指数和Nei指数的走势可以看出该保护区内的红松遗传多样性在这320年间没有发生太大的波动,基本呈现稳定的趋势。说明该时期的天然红松种群未受到人类活动的破坏,属于自然演替过程,遗传多样性基本稳定。

论文目录

• 摘要
• Abstract
• 前言
• 1.1 红松简介
• 1.1.1 红松的地理分布
• 1.1.2 红松的生物学特征
• 1.1.3 红松的生活史特征
• 1.1.4 红松的经济价值和生态价值
• 1.2 遗传多样性的研究方法及应用
• 1.2.1 遗传多样性的概念
• 1.2.2 遗传多样性的研究方法
• 1.3 微卫星 D N A 简述
• 1.3.1 微卫星标记的特点
• 1.3.2 微卫星的功能
• 1.3.3 微卫星标记在植物学中的应用
• 1.4 叶绿体微卫星
• 1.5 红松研究现状
• 材料与方法
• 2.1 实验材料
• 2.2 实验方法
• 2.2.1 DNA 的提取纯化、浓度和测定
• 2.2.2 SSR - PCR 反应体系和反应条件的建立
• 2.2.3 电泳及银染
• 2.2.4 SSR 谱带的记录
• 2.2.5 SSR 数据的统计分析
• 实验结果
• 3.1 红松 SSR 电泳图谱
• 3.2 软件分析结果
• 3.2.1 SSR 多态位点比率
• 3.2.2 Shannon 指数和 Nei 指数估算红松遗传多样性
• 3.2.3 SSR 的遗传距离和遗传一致度
• 讨论
• 4.1 . 红松遗传多样性在时间尺度上变化的 SSR 分析
• 4.1.1 SSR 多态位点比率分析
• 4.1.2 Nei 指数遗传多样性分析
• 4.1.3 Shannon 指数和 Nei 指数走势分析
• 4.1.4 时间尺度和空间尺度的研究数据的分析比较
• 4.2 . 凉水国家自然保护区红松遗传资源的保护
• 4.2.1 红松生境片段化的现状
• 4.2.2 重建原始红松林生态系统的方法和措施
• 参考文献
• 致谢