基于SSR标记的彩色马铃薯亲缘关系分析及指纹图谱构建

论文摘要

马铃薯是一种世界重要的粮菜兼用作物,在生产中的地位日益突出,彩色马铃薯因富含花青素等营养成分而具有更高的营养价值,对其种质资源研究和品种鉴定也越来越重要。本研究利用SSR分子标记对86份彩色马铃薯材料进行亲缘关系分析,筛选出一批具有较高多态性的SSR引物,并构建了指纹图谱。主要结果如下：1.选用8份形态差异较大的彩色马铃薯材料,从200多对SSR引物中筛选出56对多态性高、条带清晰易读的引物,用于彩色马铃薯亲缘关系分析及指纹图谱构建。2.56对引物在86份材料中共检测出238个等位位点,其中232个位多态性位点,多态性比率达97.48%。每对SSR引物扩增出的位点数为1-11个,平均每对引物扩增出4.25个,多态信息量（PIC）变化范围为0.3253～0.9394,平均为0.7985。扩增产物片段大约在79-318bp之间。3. UPGMA聚类分析表明,除JK2外的其他85份材料遗传相似系数均在0.6以上,从分子水平上说明供试材料的遗传背景相当狭窄,有部分材料出现所有扩增片段完全相同的情况。在相似系数0.63处可将86份材料分为3个大类。聚类分析与形态学形状基本一致。4.进一步分析发现用S038、S072、S102、StI005以及StI007这5对引物可将86份供试材料完全区分开,并利用这5对引物构建了86份彩色马铃薯材料（实际80个基因型）的指纹图谱。5.对部分彩色马铃薯基因型块茎中的类胡萝卜素、维生素C、绿原酸、总酚以及龙葵素含量进行了测定。

论文目录

• 摘要
• Abstract
• 缩略词表
• 1 前言
• 1.1 马铃薯概述
• 1.2 彩色马铃薯的定义及其营养价值
• 1.3 国内外彩色马铃薯的研究现状
• 1.4 遗传多样性研究的意义与技术的发展
• 1.5 SSR标记及其在马铃薯种质遗传多样性研究中的应用
• 1.5.1 SSR标记产生的机理及发展
• 1.5.2 SSR标记在马铃薯遗传学研究中的发展与应用
• 1.6 本研究的内容及目的意义
• 2 材料与方法
• 2.1 实验材料
• 2.2 实验方法
• 2.2.1 马铃薯基因组DNA的提取
• 2.2.2 SSR引物筛选与PCR扩增
• 2.2.3 数据处理及聚类分析
• 2.2.4 指纹图谱的构建
• 2.2.5 彩色马铃薯块茎相关成分含量测定
• 2.2.5.1 类胡萝卜素含量测定
• 2.2.5.2 维生素C含量测定
• 2.2.5.3 绿原酸含量测定
• 2.2.5.4 总酚含量测定
• 2.2.5.5 龙葵素含量测定
• 3 结果与分析
• 3.1 基因组DNA抽提
• 3.2 SSR引物筛选
• 3.3 SSR标记分析
• 3.4 SSR聚类分析
• 3.5 SSR指纹图谱分析
• 3.6 部分彩色马铃薯基因型块茎相关成分测定
• 3.6.1 类胡萝卜素
• 3.6.2 维生素C
• 3.6.3 绿原酸
• 3.6.4 总酚
• 3.6.5 龙葵素
• 4 讨论
• 4.1 本研究中供试材料的遗传多样性分析
• 4.2 基于SSR标记的指纹分析
• 4.3 SSR标记在染色体上的分布
• 4.4 优良彩色马铃薯基因型发掘
• 4.5 本研究中存在的问题和展望
• 4.5.1 存在的问题
• 4.5.2 展望
• 参考文献
• 致谢
• 附录
• 附录Ⅰ 聚丙烯凝胶电泳（PAGE）及染色方法
• 附录Ⅱ 56对引物序列信息
• 附录Ⅲ 86份彩色马铃薯材料的的指纹数字图