猪VDR和PPARγ2基因多态性与肉质相关性的研究

猪VDR和PPARγ2基因多态性与肉质相关性的研究

论文摘要

本研究以山猪、长白、大约克等品种及其杂交组合猪的背最长肌为对象,采用PCR-RFLP和测序联用技术研究维生素D受体(Vitamin D receptor, VDR)和过氧化酶体增殖因子活化受体(Peroxisome proliferation-activated receptor y2, PPARy2)肉质目标基因的多态性,试图探索其与肉质品质的相关性。并且建立GLM数学模型分析不可数变量(基因型)与可数变量(肉质性状)的关系。12组猪肉质品质研究发现,不同品种和杂交组合猪LD的生鲜肉剪切力山猪最小,为2.00±0.57(Kg-fN)(P<0.05),其他组合间无显著性差异。大理石纹评分得到,山猪评分最高为3.75±0.35(P<0.01),最低为杜申。12组猪LD的肌内脂肪均在1.5%-4%之间。不同品种和杂交组合间肌内脂肪含量差异较大,其中大申的含量最高,达到3.40%±1.25%(P<0.05),其次是巴山。含量最低的为皮申和申农1号。大理石纹评分和IMF二者趋势基本相似。VDR基因研究表明,其在12组猪骨骼肌中均有表达,平均表达量为0.76±0.08。VDR表达量与其剪切力间成相同趋势(Y=1.84X+0.902, R=0.22)。 Fokl位点多态性结果显示,碱基片段GGATG中T被C置换,野生f型突变为F型。101头猪中F、Ff和f型比例分别为:41.58%、36.63%和21.78%。山猪LD该位点存在三种基因型,即f型、Ff型和F型;但长白和大约克f型缺失和F型高表达;而杂交山猪或申农1号Fokl基因型频度发生明显变化,f型和杂合Ff型显著增加并伴随F型减少。GLM模型以VDR Fokl基因型为主效因素,建立与LD剪切力的关系,达到显著水平(P<0.05)。VDR f型和F型对LD剪切力的影响力达到极显著差异(P<0.01)。推测VDR Fokl位点多态性是影响猪骨骼肌肌纤维粗细的主效因素,以f和Ff型高表达,猪肉剪切力小且嫩度改善,并以我国猪种-山猪肉质为典型代表。对PPARy2基因的研究注意到,12品种和杂交组合猪LD中表达量均较低,其相对表达量在0.35±0.07-0.58±0.07之间。Bsrl位点CCAGT中鸟嘌呤G被腺嘌呤A置换后,形成CCAAT,由b型突变为B型。B、Bb和b型比例分别为:54.46%、33.66%和11.88%。山猪LD PPARy2基因Bsrl位点存在三基因型,二元杂交后b型比例下降,三元杂交会出现b型缺失。同时注意到,长白和大约克LD b型不表达,长白猪仅有B型,而申农1号Bb型高表达,其二元、三元杂交组合Bb型也高表达。以PPARy2基因型为主效因素与肉质性状拟合建立GLM模型,不同基因型间猪LD大理石纹、IMF和剪切力存在显著差异(P<0.05)。b型高表达有利脂肪细胞分化和增生,故可维系较高的IMF。而较高的IMF含量使得肌肉具有适宜的嫩度,提示其可作为优质肉目标基因。

论文目录

  • 摘要
  • ABSTRACT
  • 中英文对照表
  • 第一章 文献综述
  • 1 肉品的表观性状
  • 1.1 感官评价
  • 1.2 理化及营养性
  • 2 肉质性状目标基因的研究现状
  • 2.1 肉质性状的主效基因
  • 2.2 肉质基因的候选基因
  • 2.3 维生素D受体基因
  • 2.4 过氧化物酶增殖物激活受体
  • 3 基因多态性进展
  • 3.1 多态性概述
  • 3.2 基因多态性研究的技术进展
  • 3.3 限制性片段长度多态性
  • 4 研究意义与目的
  • 5 主要研究内容
  • 第二章 维生素D受体Fok1位点多态性与肉质相关性分析
  • 1 材料与方法
  • 1.1 背最长肌及相关参数
  • 1.2 试剂与仪器
  • 1.3 VDR基因引物设计
  • 1.4 VDR半定量扩增
  • 1.5 VDR基因PCR-RFLP酶切分型
  • 1.6 数据处理和生物统计学分析
  • 2 结果与讨论
  • 2.1 猪LD剪切力
  • 2.2 VDR基因引物验证
  • 2.3 T-RNA鉴定及VDR半定量扩增
  • 2.4 VDR基因Fok1位点的识别与比较
  • 3 本章小结
  • 第三章 PPARγ2基因Bsr1位点多态性与肉质的相关性
  • 1 材料与方法
  • 1.1 背最长肌与相关参数
  • 1.2 试剂与仪器
  • 1.3 基因克隆与PCR半定量分析
  • 1.4 PPARγ2基因PCR-RFLP酶切分型
  • 1.5 数据处理和生物统计学分析
  • 2 结果与讨论
  • 2.1 猪LD剪切力、大理石纹和肌内脂肪
  • 2.2 T-RNA验证及PPARγ2基因半定量
  • 2.3 PPARγ2基因Bsrl位点的识别与比较
  • 3 本章小结
  • 全文结论
  • 论文创新点
  • 参考文献
  • 硕士期间成绩
  • 附录1:12组猪VDR基因Fok1位点酶切结果
  • 附录2:12组猪PPARγ2基因Bsr1位点酶切结果
  • 致谢
  • 相关论文文献

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