4种鲇形目鱼类的RAPD研究

4种鲇形目鱼类的RAPD研究

论文摘要

怀头鲇(Silurus soldatovi Nikolsky et Soin)、鲇(Silurus asotus Linnaeus)、黄颡鱼(Pelteobagrus fulviridraco Richardson)和乌苏里拟鲿(Pseudobagrus ussuriensisDybowski)都为黑龙江的优质经济鱼类。本文对这4种鲇形目鱼类进行了随机扩增多态性DNA(RAPD)研究,分析了这4种鱼的群体遗传多样性,为其种质保护以及资源的合理开发利用提供科学依据。根据RAPD的特点对PCR条件进行了优化,确定了本实验的最佳反应条件,采用120条10碱基随机引物对这4种鲇形目鱼基因组DNA进行RAPD—PCR反应,共筛选出23条引物作其群体遗传多样性分析。23条引物共检测出419个位点,其中有408个位点表现出多态性,群体间多态位点比例(P)为97.37%;有效等位基因数(Ne)为1.5840;Nei’s基因多样性指数(H)为0.3455;Shannon’s信息指数(H0)为0.5191。4种鲇形目鱼类群体的多态位点比例(P)介于20.29%和41.77%之间,差异较大;有效等位基因数(Ne)为1.1584~1.7771;Nei’s基因多样性指数(H)为0.0871~0.1734;各群体的Shannon’s信息指数(H0)为0.1254~0.2514。结果表明4种鱼类的群体遗传多样性处于中游水平。其中,鲇群体的遗传多样性水平最高,黄颡鱼群体的遗传多样性水平最低。通过软件PopGen32统计分析4个群体的遗传距离,结果显示:怀头鲇与鲇的遗传距离最小,为0.2011;怀头鲇与黄颡鱼的遗传距离最大,为1.0109。根据遗传距离,用UPGMA法和NJ法进行聚类分析,构建了4种鲇形目鱼类的亲缘关系树状图。得到的结果较为一致,怀头鲇群体和鲇群体聚为一类,黄颡鱼群体与乌苏里拟鲿群体聚为一类,怀头鲇与鲇的遗传相似度要大于黄颡鱼与乌苏里拟鲿。

论文目录

  • 摘要
  • Abstract
  • 1 绪论
  • 1.1 生物多样性简述
  • 1.2 遗传多样性简述
  • 1.3 遗传多样性研究水平
  • 1.3.1 形态学水平
  • 1.3.2 细胞学水平
  • 1.3.3 生化水平
  • 1.3.4 分子DNA水平
  • 1.4 RAPD在鱼类遗传学中的研究现状
  • 1.5 4种鲇形目鱼的研究进展
  • 1.6 本研究的目的及意义
  • 2 材料与方法
  • 2.1 实验材料
  • 2.1.1 实验用鱼
  • 2.1.2 主要仪器和设备
  • 2.1.3 主要试剂和酶
  • 2.2 方法
  • 2.2.1 基因组DNA的提取
  • 2.2.2 RAPD-PCR扩增反应
  • 2.2.3 引物的筛选
  • 2.2.4 RAPD数据分析
  • 3 结果与分析
  • 3.1 基因组DNA提取结果
  • 3.2 随机引物PCR扩增结果
  • 3.3 4种鲇形目鱼类群体遗传多样性分析
  • 3.4 4种鲇形目鱼类群体间遗传距离及聚类分析
  • 4 讨论
  • 4.1 关于取样部位与样本容量的问题
  • 4.2 RAPD条件的确定和稳定性问题
  • 4.3 4种鲇形目鱼类群体遗传多样性的评价
  • 4.4 4种鲇形目鱼类的聚类分析
  • 4.5 4种鲇形目鱼类遗传多样性的保护
  • 结论
  • 参考文献
  • 攻读学位期间发表的学术论文
  • 致谢
  • 相关论文文献

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