外源性microRNA阻断HBV和HBV复制相关的宿主基因表达对HBV复制水平的影响

外源性microRNA阻断HBV和HBV复制相关的宿主基因表达对HBV复制水平的影响

论文摘要

乙型肝炎病毒(hepatitis B virus, HBV)感染是全球重要的公共卫生问题。目前全球慢性HBV感染人数己超过3.5亿,是导致肝硬化、重型肝炎及肝细胞癌(hepatocellular carcinoma, HCC)的主要原因。在中国,有大约10%的人口存在慢性HBV感染,直到目前,尚无有效的药物能完全达到理想的抗病毒效果或者清除病毒。因此,寻找一种新的治疗策略治疗慢性HBV感染是必要而且紧迫的。RNA干扰(RNA interference, RNAi)是一项新兴的基因沉默技术,主要通过siRNA和microRNA(miRNA)两种小RNA分子来发挥作用。siRNA介导的RNAi沉默基因表达是通过小片段双链RNA以序列特异性的方式与靶基因的mRNA相结合来实现的。但越来越多的研究发现,许多病毒在治疗选择压力下可以通过靶基因序列的突变或产生抑制因子来逃避RNAi,针对病毒的RNAi治疗效果因为病毒的变异而降低疗效,甚至失去治疗作用。miRNA作用方式很大程度上和siRNA介导的RNAi途径重叠。与siRNA相比,miRNA仅仅需要和靶基因部分的结合即可以发挥作用,因而可以在很大程度上避免因为病毒变异导致的RNAi治疗失败。这将对容易发生变异的病毒(如HCV, HBV, HIV)病的治疗更有优势。miRNA功能的研究可能有助于提出治疗病毒感染性疾病的新方法。另一种有效的病毒RNAi治疗途径将可能是针对病毒感染和复制所需要的宿主细胞因素进行RNA干扰研究。HBV在体内感染细胞和体内病毒复制需要宿主基因的参与,因此,以其为靶位进行RNA干扰降低宿主基因表达,可能会导致病毒复制水平的降低。以宿主基因为靶位RNAi治疗的优点是它不依赖于病毒的基因组,因而能避免病毒通过突变逃避RNAi的缺点。但目前国内外尚未见利用microRNA介导的RNA干扰技术对HBV和HBV复制所需的宿主基因进行基因治疗的研究报道。最近大量研究表明,通过借助于miRNA表达框架,可以实现将靶向特定基因的外源性人工合成的miRNA(artificial microRNA, amiRNA)导入细胞内,达到抑制靶基因的效果。因此,本实验研究分别构建了靶向HBV不同位点和靶向La蛋白基因和ASGPR1基因等宿主基因的外源性amiRNA表达载体,瞬时和稳定转染HepG2.2.15细胞,观察外源性amiRNA介导的RNA干扰能否阻断HBV和HBV复制相关的宿主基因表达,通过测定靶基因的抑制程度和HBV蛋白以及HBV DNA降低的程度,从而了解靶向HBV和相关宿主基因的外源性amiRNA表达对HBV复制水平的影响。目的:通过利用miRNA表达框架构建能够特异性靶向HBV和HBV感染和复制相关宿主基因的amiRNA表达载体,转染到HepG2.2.15细胞中,观察外源性amiRNA介导的RNA干扰对HBV复制水平的影响。方法:构建13个靶向HBV不同位点、La蛋白基因和ASGPR1基因的外源性amiRNA表达载体,测序证实插入序列的正确性。然后通过脂质体转染技术瞬时和稳定转染HepG2.2.15细胞,半定量RT-PCR方法观察靶基因mRNA的抑制程度;Western blotting方法观察La蛋白和ASGPR1蛋白的抑制程度;测定培养上清中的HBsAg、HBeAg浓度和HBV DNA的水平,观察靶向HBV、La蛋白基因和ASGPR1基因的外源性amiRNA对HBV复制和表达水平的影响。结果:1.瞬时转染amiRNA-HBV对HBsAg和HBeAg的抑制作用将构建的7个amiRNA表达质粒转染HepG2.2.15细胞,流式细胞仪检测转染效率在50%60%左右。在这种情况下,HBsAg和HBeAg测定结果显示:7个质粒均有不同程度的抑制作用,其中有3个质粒对HBsAg和HBeAg的表达具有显著的抑制作用。抑制效应在转染后48h抑制效果开始较明显,72h病毒抑制达到高峰,96h后抑制作用开始渐减弱。其中以amiRNA-HBV-S608对HBsAg的抑制作用最为明显,amiRNA-HBV-S608在转染后的48h、72h和96h三个时间点对HBsAg的平均抑制率分别为29.5%,49.8%和46.3%, P<0.01;amiRNA-P2227对HBeAg的抑制最显著,amiRNA-HBV-P2227在转染后的48h、72h和96h三个时间点对HBeAg的平均抑制率分别为36.4%,45.2%和40.3%, P<0.01。而阴性对照组对蛋白表达的影响与空白对照组相比无显著性差异, P>0.05。2.瞬时转染amiRNA-HBV对HBV DNA复制的抑制作用对瞬时转染各个时间点培养上清中的HBV DNA水平采用实时荧光定量PCR检测结果表明:与HBsAg和HBeAg抑制的作用相似,7个质粒对培养上清中的HBV DNA也均有不同程度的抑制作用,而阴性对照组载体与空白转染组相比对HBV DNA抑制无显著性差异, P>0.05。其中amiRNA-HBV-S608和amiRNA-HBV-P2227的抑制效果最为明显,但整体抑制率低于对HBsAg和HBeAg的抑制率。amiRNA-HBV-S608在转染后48h、72h和96h对HBV DNA的平均抑制率为27.8%,39.0%和36.5%,P<0.01。amiRNA-HBV-P2227在转染后48h、72h和96h对HBV DNA的平均抑制率为35.7%,48.2%和39.5%,P<0.01。3.稳定转染amiRNA-HBV对HBsAg和HBeAg的抑制作用检测结果显示,与2.2.15细胞相比,转染了阴性质粒得到的稳定株的HBsAg和HBeAg的分泌没有显著性变化,P>0.05,而转染的三个干扰HBV表达的质粒均显示了显著的抑制效果。其中amiRNA-HBV-P2227组对HBsAg和HBeAg的抑制率分别为76.2%和74.9%,P<0.01。amiRNA-HBV-S608组对HBsAg和HBeAg的抑制率分别为81.3%和58.2%,P<0.01。amiRNA-HBV-X402组对HBsAg和HBeAg的平均抑制率分别为70.2%和70.5%,P<0.01。4.稳定转染amiRNA-HBV对HBV DNA复制水平的影响在稳定转染的细胞株中,与瞬时转染相比,对HBV DNA的抑制率更高。荧光定量PCR (FQ-PCR)检测结果显示,amiRNA-HBV能够高效、特异地抑制HBV DNA的复制。amiRNA-HBV-S608组对培养上清中HBV DNA的平均抑制率为70.1%,P<0.01amiRNA-HBV-P2227对培养上清中HBV DNA的抑制率最高,达76.1%,P<0.01。amiRNA -HBV-X402的平均抑制率为67.9%,P<0.01。5.靶向宿主基因La蛋白的外源性amiRNA对HBV复制和表达水平的影响实验结果显示:转染amiRNA-La质粒后,HepG2.2.15细胞的细胞增殖和细胞形态与对照比较无显著差异;在La mRNA和蛋白水平上,结果显示3种amiRNA均能明显降低La mRNA和蛋白的表达,amiRNA-La-1130抑制效应最强,在转染后72h,La mRNA和蛋白的水平分别下降了58.6%和50.6%,P<0.01;但在病毒水平3种amiRNA-La质粒中仅有1个质粒能显著抑制相应细胞株中HBsAg和HBeAg的分泌,且抑制作用不强,其中以amiRNA-La-1130抑制作用最好,它对培养72h的细胞上清中的HBsAg和HBeAg平均抑制率分别为23.3%和25.8%,P<0.01,HBV DNA的平均抑制率为22.3%,P<0.01。6.靶向宿主基因ASGPR1的外源性amiRNA对HBV复制和表达水平的影响实验结果显示:转染amiRNA-ASGPR1质粒后,HepG2.2.15细胞的细胞增殖以及细胞生长速度与对照无显著差异,提示导入ASGPR1蛋白特异性amiRNA表达载体对HepG2.2.15细胞的生长无明显影响;在mRNA和蛋白水平上,RT-PCR结果证实3种amiRNA均能明显降低ASGPR1 mRNA和蛋白的表达;amiRNA-ASGPR1-610抑制效应最强,在转染后72h,ASGPR1 mRNA和蛋白的水平分别下降了57.3%和49.8%,P<0.01;在病毒水平3种amiRNA均能明显抑制相应细胞株中HBsAg和HBeAg的分泌,其中以amiRNA-ASGPR1-772抑制作用最强,它对培养72h的细胞上清中的HBsAg和HBeAg抑制率分别为31.3%和33.6%, P<0.01,HBV DNA的抑制率为29.7%,P<0.01。结论1.外源性amiRNA介导的RNA干扰能够高效特异性的阻断HBV的复制和表达。2.外源性amiRNA介导的RNA干扰可以高效阻断La和ASGPR1宿主靶基因的表达。3.宿主基因La和ASGPR1的表达水平与HBV的复制和表达有密切关系,进一步证实两者在HBV的感染和复制中起着关键作用。与HBV感染和复制相关的宿主基因可以作为HBV基因治疗的一个候选靶位。4.在提高转染效率的情况下,外源性amiRNA能够作为一种新的抗HBV的基因治疗手段。

论文目录

  • 中英文缩写词对照
  • 中文摘要
  • 英文摘要
  • 研究背景
  • 第一部分 外源性MICRORNA阻断HBV表达对HBV复制水平的影响
  • 1. 前言
  • 2. 材料与方法
  • 2.1 细胞株的培养
  • 2.2 菌种、质粒和DNA 合成
  • 2.3 引物序列
  • 2.4 主要试剂与仪器
  • 2.5 质粒的构建、纯化和转染
  • 2.6 半定量RT-PCR
  • 2.7 乙肝五项定量的检测
  • 2.8 HBV-DNA 的荧光定量 PCR 检测
  • 2.9 统计学分析
  • 3. 结果
  • 3.1 靶基因HBV amiRNA 序列的筛选及载体的构建结果
  • 3.2 重组质粒的构建及鉴定
  • 3.3 优化转染条件
  • 3.4 瞬时转染amiRNA-HBV 对HBsAg 和HBeAg 的抑制作用
  • 3.6 瞬时转染amiRNA-HBV 对HBV DNA 的抑制作用
  • 3.7 瞬时转染amiRNA-HBV 对HBV mRNA 的抑制作用
  • 4. 讨论
  • 4.1 microRNA 介导的RNA 干扰和外源性amiRNA 干扰技术
  • 4.2 外源性amiRNA 抑制HBV 靶基因的表达
  • 4.3 影响RNA 干扰疗效的因素
  • 5. 小结
  • 第二部分 外源性MICRORNA 稳定转染HEPG2.2.15 细胞对HBV 复制水平的影响
  • 1. 前言
  • 2. 材料与方法
  • 2.1 主要试剂和试剂配制
  • 2.2 主要仪器
  • 2.3 引物序列
  • 2.4 质粒的构建、纯化
  • 2.5 确定杀稻瘟菌素的最佳抑制浓度
  • 2.6 质粒的稳定转染
  • 2.7 半定量RT-PCR
  • 2.8 乙肝五项定量的检测
  • 2.9 HBV-DNA 的检测
  • 3. 结果
  • 3.1 杀瘟稻霉素浓度的确定及细胞克隆的筛选
  • 3.2 稳转细胞株的筛选
  • 3.3 稳定转染AMIRNA-HBV 对HBSAG 和HBEAG 的抑制作用
  • 3.4 稳定转染AMIRNA-HBV 对HBV DNA 的抑制作用
  • 3.5 稳定转染AMIRNA-HBV 对HBV MRNA 的抑制作用
  • 4. 讨论
  • 5. 小结
  • 第三部分 外源性MICRORNA 阻断HBV 复制相关的宿主基因表达对HBV 复制的影响
  • 1. 前言
  • 2. 材料与方法
  • 2.1 主要试剂
  • 2.2 主要试剂配制
  • 2.3 主要仪器
  • 2.4 引物序列
  • 2.5 质粒的构建、纯化和转染
  • 2.6 半定量RT-PCR
  • 2.7 乙肝五项定量的检测
  • 2.8 HBV-DNA 的检测
  • 2.9 Western blotting 实验
  • 2.10 细胞增殖检测
  • 3. 结果
  • 3.1 靶基因La amiRNA 和ASGPR1 amiRNA 序列的筛选及载体的构建结果
  • 3.2 重组质粒的构建及鉴定
  • 3.3 瞬时转染amiRNA-La 对La mRNA 的抑制作用
  • 3.4 瞬时转染amiRNA-La 对La 蛋白的抑制作用
  • 3.5 瞬时转染amiRNA-La 对HBsAg 和HBeAg 的抑制作用
  • 3.6 瞬时转染amiRNA-La 对HBV DNA 的抑制作用
  • 3.7 瞬时转染amiRNA-ASGPR1 对ASGPR1 mRNA 的抑制作用
  • 3.8 瞬时转染amiRNA-ASGPR1 对ASGPR1 蛋白的抑制作用
  • 3.9 瞬时转染amiRNA-ASGPR1 对HBsAg 和HBeAg 的抑制作用
  • 3.10 瞬时转染amiRNA-ASGPR1 对HBV DNA 的抑制作用
  • 3.11 amiRNA-La 和amiRNA-ASGPR1 转染对细胞增殖的影响
  • 4. 讨论
  • 5. 小结
  • 结论
  • 参考文献
  • 附录一 个人简历
  • 附录二 致谢
  • 附录三 慢性乙型肝炎基因治疗的研究进展
  • 1. 引言
  • 2.H BV 的基因组特点和感染机制
  • 2.1 HBV 的基因组特点
  • 2.2 HBV 感染宿主细胞的机制
  • 2.3 HBV 复制循环中所需要的肝细胞宿主因素
  • 2.3.1 La 蛋白(La protein)
  • 2.3.2 肝富集转录因子(liver-enriched transcription factors,LETFs)
  • 3. 反义RNA、核酶与RNAI 等基因治疗技术的比较
  • 4. 抗HBV 基因治疗的现状
  • 5. 病毒逃避SIRNA 介导的RNAI 治疗的研究现状及可能的解决办法
  • 5.1 病毒逃避RNAI 的研究现状
  • 5.2 针对宿主细胞基因的基因治疗研究
  • 5.3 MICRORNA 介导的RNAI 可能是一种潜在的解决病毒逃避RNAI 的方法
  • 6. 展望
  • 参考文献
  • 相关论文文献

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