安太健:基于生物信息学考察骨髓干细胞治疗缺血性脑卒中的潜在机制论文

安太健:基于生物信息学考察骨髓干细胞治疗缺血性脑卒中的潜在机制论文

本文主要研究内容

作者安太健,张威,杨红,王庆峰(2019)在《基于生物信息学考察骨髓干细胞治疗缺血性脑卒中的潜在机制》一文中研究指出:背景:在治疗缺血性脑卒中过程中,干细胞疗法已经获得了广泛的关注,然而对于其所涉及到的复杂调控机制,相关研究较少。目的:应用生物信息学方法研究骨髓干细胞治疗缺血性脑卒中的分子调控机制。方法:应用DisGeNET数据库调取缺血性脑卒中的背景网络,再通过GEO在线数据库获得骨髓干细胞治疗前后差异表达明显的基因;再将这些基因对上述背景网络进行打靶处理,最终获得与缺血性脑卒中相关的靶点,应用DAVID和String数据库分析这些靶标基因之间的关系。结果与结论:(1)DisGeNET数据库可调取的缺血性脑卒中的调控分子靶标共计393个;GEO数据库获得的骨髓干细胞治疗缺血性脑卒中的数据集内,与缺血性脑卒中发病密切相关的分子靶点共计39个,其中下调的分子靶点包含FBN1,NPY,MMP10,ITGB3,GLA等30个,上调的分子靶点包含EZH2,ESR1,IL16,LGALS2等9个;(2)由String数据库获得其对应的互作关系后,可获得上述39个靶点的互作关系,共有10个节点大于平均节点度,分别为TP53,SPP1,VCAM1,PTGS2,ESR1,F3,TIMP2,CD40,EZH2,ITGB3,除了ESR1和EZH2是上调基因外,其余均为下调基因;(3)在该过程中,主要调控的通路有血管剪切力调节及松弛素信号通路;IL-7、NFKB等炎症相关的信号通路;神经活性配体-受体、同种异体排斥反应等信号通路。

Abstract

bei jing :zai zhi liao que xie xing nao cu zhong guo cheng zhong ,gan xi bao liao fa yi jing huo de le an fan de guan zhu ,ran er dui yu ji suo she ji dao de fu za diao kong ji zhi ,xiang guan yan jiu jiao shao 。mu de :ying yong sheng wu xin xi xue fang fa yan jiu gu sui gan xi bao zhi liao que xie xing nao cu zhong de fen zi diao kong ji zhi 。fang fa :ying yong DisGeNETshu ju ku diao qu que xie xing nao cu zhong de bei jing wang lao ,zai tong guo GEOzai xian shu ju ku huo de gu sui gan xi bao zhi liao qian hou cha yi biao da ming xian de ji yin ;zai jiang zhe xie ji yin dui shang shu bei jing wang lao jin hang da ba chu li ,zui zhong huo de yu que xie xing nao cu zhong xiang guan de ba dian ,ying yong DAVIDhe Stringshu ju ku fen xi zhe xie ba biao ji yin zhi jian de guan ji 。jie guo yu jie lun :(1)DisGeNETshu ju ku ke diao qu de que xie xing nao cu zhong de diao kong fen zi ba biao gong ji 393ge ;GEOshu ju ku huo de de gu sui gan xi bao zhi liao que xie xing nao cu zhong de shu ju ji nei ,yu que xie xing nao cu zhong fa bing mi qie xiang guan de fen zi ba dian gong ji 39ge ,ji zhong xia diao de fen zi ba dian bao han FBN1,NPY,MMP10,ITGB3,GLAdeng 30ge ,shang diao de fen zi ba dian bao han EZH2,ESR1,IL16,LGALS2deng 9ge ;(2)you Stringshu ju ku huo de ji dui ying de hu zuo guan ji hou ,ke huo de shang shu 39ge ba dian de hu zuo guan ji ,gong you 10ge jie dian da yu ping jun jie dian du ,fen bie wei TP53,SPP1,VCAM1,PTGS2,ESR1,F3,TIMP2,CD40,EZH2,ITGB3,chu le ESR1he EZH2shi shang diao ji yin wai ,ji yu jun wei xia diao ji yin ;(3)zai gai guo cheng zhong ,zhu yao diao kong de tong lu you xie guan jian qie li diao jie ji song chi su xin hao tong lu ;IL-7、NFKBdeng yan zheng xiang guan de xin hao tong lu ;shen jing huo xing pei ti -shou ti 、tong chong yi ti pai chi fan ying deng xin hao tong lu 。

论文参考文献

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  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自中国组织工程研究的安太健,张威,杨红,王庆峰,发表于刊物中国组织工程研究2019年33期论文,是一篇关于缺血性脑卒中论文,干细胞疗法论文,骨髓间充质干细胞论文,分子网络论文,生物信息学分析论文,蛋白互作网络论文,发育论文,中国组织工程研究2019年33期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自中国组织工程研究2019年33期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

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