玉米矮化基因D2003的图位克隆与功能分析

玉米矮化基因D2003的图位克隆与功能分析

论文摘要

在玉米育种过程中,理想株高对品种的种植密度和抗倒伏性有重要影响,是育种者追求的重要农艺性状之一。因此,研究玉米株高调控的遗传机制不仅具有重要的理论价值,而且在玉米育种实践中具有巨大的应用潜力。本研究对玉米矮化突变体d2003中的矮化基因进行了精细定位与克隆。该突变体是从玉米自交系K36中发现的一个自然突变体,株高不到K36的1/3,但节数增多,且节间严重缩短。利用旱21xd2003、农531×d2003等F2群体,通过图位克隆的方法克隆了D2003基因。序列分析和等位测验结果表明,它是Viviparous8(Vp8)基因的一个等位基因,编码膜定位的谷氨酸羧肽酶,但它的作用机理目前还没有得到很好的解析。序列比较发现,在d2003的第一个外显子上有一个单碱基“C”的插入,造成移码突变,并产生终止密码子,造成翻译的提前终止。从K36中扩增了D2003基因的全长cDNA序列,构建植物表达载体,并转化D2003在拟南芥中同源基因的突变体ampl,几乎全部转基因植株都恢复到野生型的表型。同时,通过连续回交并结合分子标记辅助选择的方法构建了d2003基因在16个不同遗传背景中的近等基因系,发现d2003在这16个背景中均具有矮化的表型。基因表达分析表明,D2003是一个组成型表达基因,在所检测的几个组织中均有不同水平的表达,但在茎顶端分生组织、幼嫩的叶片和发育中的微管系统中表达量最高,在雄穗中表达量居中,而在雌穗和根中最低。D2003蛋白的亚细胞定位结果显示,其定位情况与内质网标记蛋白HDEI-GFP的定位情况完全重合,表明D2003蛋白在细胞中主要定位在内质网膜上。蛋白结构分析发现,其N端存在着信号肽区域和跨膜区域,当把该区域去掉后亚细胞定位情况发生了明显的变化,不再定位在内质网上。并且,去掉部分N端信号肽编码序列的D2003/Vp8△26AA基因转入拟南芥突变体ampl,不能恢复表型。这些结果表明,D2003蛋白N端的信号肽区域和跨膜区对蛋白质的正确定位以及功能的发挥起着重要的作用。激素处理实验表明,d2003对四种促进细胞分裂或伸长的激素GA3,IAA,6-BA和BR均有不同程度的响应,但是它们都不能使d2003恢复到正常植株的表型。另外,RNA-Seq检测到蛋白激酶基因GRMZM2G035098在d2003和K36之间表达量有很大的差异,该基因在酵母的正常细胞进程中发挥着重要的作用,包括细胞的分裂,细胞的增殖,细胞周期的正常进行和染色质的正常维持等。综合以上结果,在玉米生长发育过程中D2003基因可能通过参与调控细胞的分裂而调节节间的伸长,从而进一步调控玉米的株高。

论文目录

  • 摘要
  • Abstract
  • 第一章 文献综述
  • 1.1 控制玉米株高的QTL定位
  • 1.2 控制玉米株高基因的克隆
  • 1.3 米株高调节的作用机制
  • 1.3.1 GA调控玉米的株高
  • 1.3.2 IAA调控玉米的株高
  • 1.3.3 BR调控玉米的株高
  • 1.3.4 其它可能参与玉米株高调控的因素
  • 1.4 图位克隆技术在玉米基因分离中的应用
  • 1.4.1 图位克隆技术的遗传定位原理
  • 1.4.2 图位克隆的关键技术环节
  • 1.4.3 提高图位克隆效率的可行方法
  • 1.4.4 图位克隆中可能遇到的问题及解决措施
  • 1.5 本研究的目的和意义
  • 第二章 d2003突变体的表型鉴定和初步分析
  • 2.1 材料与方法
  • 2.1.1 实验材料
  • 2.1.2 实验方法
  • 2.2 结果与分析
  • 2.2.1 突变体的获得和遗传分析
  • 2.2.2 突变体的表型分析
  • 2.2.3 节间细胞形态比较
  • 第三章 突变体d2003与植物激素关系验证
  • 3.1 材料与方法
  • 3.1.1 实验材料
  • 3.1.2 实验方法
  • 3.2 结果与分析
  • 3.2.1 GA3处理结果
  • 3.2.2 6-BA处理结果
  • 3.2.3 IAA处理结果
  • 3.2.4 BR处理结果
  • 第四章 D2003基因的图位克隆、等位测验及互补实验
  • 4.1 材料与方法
  • 4.1.1 实验材料
  • 4.1.2 实验方法
  • 4.2 结果与分析
  • 4.2.1 D2003基因的精细定位
  • 4.2.2 D2003基因的克隆
  • 4.2.3 等位测验
  • 4.2.4 转基因互补实验
  • 第五章 d2003基因在不同遗传背景中的表型分析
  • 5.1 材料和方法
  • 5.1.1 实验材料
  • 5.1.2 实验方法
  • 5.2 结果与分析
  • 第六章 D2003基因的表达分析
  • 6.1 材料和方法
  • 6.1.1 实验材料
  • 6.1.2 实验方法
  • 6.2 结果与分析
  • 6.2.1 组织特异性表达分析
  • 6.2.2 细胞定位分析
  • 第七章 自交系K36和突变体d2003转录组分析
  • 7.1 材料和方法
  • 7.1.1 实验材料
  • 7.1.2 实验方法
  • 7.2 结果与分析
  • 第八章 讨论
  • 8.1 D2003基因的功能多样性
  • 8.2 在玉米中D2003基因可能参与促进细胞的增殖
  • 8.3 d2003与植物激素的关系
  • 8.4 内质网定位对D2003蛋白功能的重要性
  • 8.5 可能参与D2003调控途径的基因
  • 第九章 全文结论
  • 参考文献
  • 致谢
  • 作者简历
  • 附录
  • 相关论文文献

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