虎皮鹦鹉在驯化中的遗传分化初探

论文摘要

采用鸡的8对微卫星引物首次在家养虎皮鹦鹉上进行跨类群扩增,结果显示,在鸡和虎皮鹦鹉之间,这套微卫星引物（MCW0085,LEI0066,LEIOI66,ADL0166,MCW0145,MCW0032和LEI0094）具有较强的通用性,可以用于家养虎皮鹦鹉群体水平上的研究;同时亦表明在虎皮鹦鹉与鸡之间,微卫星跨类群扩增成功与否、系统发育距离以及多态性三者间并无本质的联系。 首次以野生型淡绿色类型（POP1）、黄色类型（POP2）、天蓝色类型（POP3）、和白色类型（POP4）家养虎皮鹦鹉为研究对象,利用8个微卫星标记分析了群体內和群体间的遗传多样性。8对微卫星引物均表现出低到高度多态,各微卫星位点的平均等位基因数为4.8800个;平均期望杂合度为0.6616;平均多态信息含量为0.6070。就单个群体的所有位点而言,多态信息含量在0.5020（POP1）～0.5760（POP4）之间;观察杂合度在0.4875（POP4）～0.5667（POP2）之间;期望杂合度在0.5607（POP1）～0.6368（POP4）之间,表明各位点具有丰富的多态性,能够准确地反映各群体内的遗传结构和群体间的相互关系,对群体的遗传检测结果有较深刻的说服力。在8个微卫星位点中,除LEI0094外,其它7个位点在整个家养虎皮鹦鹉群体中显著偏离Hardy-Weinberg平衡。显示杂合子缺失位点上的哑等位基因频率在0.0495（LEI0094）到0.4595（LEI0066）之间,但MCW0032位点中没有显示出哑等位基因存在。每个群体中的成对位点间都有不同程度的基因型不平衡: .其中,最多的有3对（POPl）,最少的有2对（POP4）.就所有群体而占,有14个位点组合间的基因型在整个群体中呈现不平衡状态,其中,8对极显著,6对显

论文目录

• 1.文献综述
• 1.1 虎皮鹦鹉资源概况
• 1.2 虎皮鹦鹉的进化历史
• 1.3 虎皮鹦鹉不同羽色群体的驯化历史
• 1.4 微卫星标记及其在鸟类研究中的应用
• 1.5 微卫星标记在鸟类研究中的应用
• 1.6 研究目的与意义
• 2. 材料与方法
• 2.1 材料来源
• 2.2 基因组DNA提取方法
• 2.3 引物与试剂
• 2.4 主要仪器和设备
• 2.5 微卫星标记检测
• 2.6 数据统计
• 3. 结果与分析
• 3.1 基因组DNA的提取及其浓度、纯度检测
• 3.2 微卫星DNA的PCR扩增结果及其多态性
• 3.3 标记位点多态性分析
• 3.4 不同羽色群体的遗传结构特点
• 3.5 Hardy-Weinberg平衡和基因型不平衡检验
• 3.6 遗传分化
• 3.7 遗传距离及其聚类分析图
• 3.8 群体的分配检测
• 3.9 瓶颈效应
• 4.讨论
• 4.1 虎皮鹦鹉DNA提取
• 4.2 实验分析技术
• 4.3 影响微卫星引物跨类群扩增的因素以及各因素之间的关系
• 4.4 微卫星跨类群扩增时的特点以及应注意的事项
• 4.5 PCR扩增与微卫星基因型判断的准确性
• 4.6 群体内遗传分析
• 4.7 近期分离群体的进化特点
• 4.8 聚类分析
• 4.9 分配检测
• 4.10 瓶颈效应的预测
• 5.结论
• 参考文献
• 致谢
• 参与发表的论文目录