棕榈（Trachycarpus fortunei）的遗传多样性研究

论文摘要

棕榈科是泛热带分布的科,棕榈（Trachycarpus fortunei）是其中少数可以分布到温带的植物,在中国的分布遍及长江以南各个省区。本文通过对棕榈标本和文献的查阅,结合对云南、广西、湖南三省棕榈的实地调查和观察,分析棕榈的分布范围和居群特征。棕榈居群内个体数少,幼树和幼苗极少,年龄结构呈现衰退型。同时对棕榈属植物的分布进行分析。 从棕榈的干燥叶片或新鲜叶片中采用CTAB法摸索和提取棕榈基因组DNA,找出最好的提取条件和药剂用量。在此基础上,对棕榈ISSR—PCR进行扩增,对影响ISSR反应的各因子(模板DNA浓度、Mg2+用量、dNTP浓度、退火温度、热循环数及不同厂家生产的药品与仪器)设置梯度进行探讨,确定了该研究的最佳反应条件,建立了棕榈ISSR反应的最佳反应体系,为进行棕榈居群遗传多样性的研究奠定了基础。摸索获得的最佳ISSR反应条件应用于棕榈13个居群200个样本的扩增。从100条ISSR引物中筛选出可以扩增出清晰、重复性好的12条带的引物,结果共产生了107条带,其中102条具有多态性,扩增条纹的大小在300—1900bp,多态性百分率为95.33%,单态率为4.67%,平均每个引物能扩增出8.9条带。棕榈的遗传多样性及分化系数由POPGENE软件获得。棕榈物种水平的遗传多样性（HT）为0.3234,居群内遗传多样性（HS）是0.1982。棕榈的(GST)值为0.3827,即38.27%的变异存在于居群间,61.73%的变异存在于居群内,说明棕榈的遗传变异主要存在于居群内。Nei’s遗传多样性指数h为0.3218,Shannon’s信息指数I为0.4843。 由UPGMA法获得的基于Nei的无加权计算遗传距离棕榈各居群的聚类图。棕榈各居群的遗传距离在0.06和0.27之间,遗传距离最小的是0.06,在广西黄沙镇居群GHS6和广西花坪自然保护区居群GHP7之间;其次是云南文山居群DWS1和DWS2,DWS2和DWS3,云南玉溪居群DYX4

论文目录

• 摘要
• Abstract
• 1.引言
• 1.1 棕榈属植物的地理分布
• 1.1.1 棕榈属种的主要形态特征及命名
• 1.1.2 棕榈属的地理分布
• 1.1.2.1 棕榈
• 1.1.2.2 对叶棕榈
• 1.1.2.3 宽裂棕榈
• 1.1.2.4 山棕榈
• 1.1.2.5 龙棕
• 1.1.2.6 泰国棕榈
• 1.1.2.7 石门棕
• 1.1.2.8 喜马拉雅棕榈
• 1.1.2.9 魏格纳棕榈
• 1.1.3 棕榈属的利用情况
• 1.1.3.1 棕榈（T.fortunei）广泛的应用
• 1.1.3.2 棕榈属其它种的应用
• 1.2 分子标记的选择及在棕榈科居群遗传多样性中的应用
• 2.材料与方法
• 2.1 材料
• 2.1.1 野外调查与植物材料采集
• 2.1.2 主要化学试剂
• 2.2 研究方法
• 2.2.1 DNA提取
• 2.2.1.1 所用药品的配制
• 2.2.1.2 DNA提取过程
• 2.2.2 PCR扩增
• 2.2.2.1 预扩增
• 2.2.2.2 对影响ISSR—PCR扩增效果的各成分与条件设置梯度
• 2.2.3 利用琼脂糖电泳对DNA与扩增产物进行检测
• 2.2.3.1 DNA的检测与定量
• 2.2.3.2 扩增产物的检测
• 2.2.4 数据分析及主要遗传参数
• 3.结果与分析
• 3.1 棕榈在中国的地理分布
• 3.2 ISSR—PCR反应条件筛选与优化
• 3.2.1 模板DNA浓度对ISSR反应体系的影响
• 2+对棕榈ISSR的影响'>3.2.2 Mg²⁺对棕榈ISSR的影响
• 3.2.3 dNTP浓度对ISSR反应的影响
• 3.2.4 引物浓度对ISSR反应的影响
• 3.2.5 退火温度及热循环数对ISSR的影响
• 3.2.6 TaqDNA聚合酶与PCR厂家及型号的不同对ISSR扩增效果的影响
• 3.2.7 反应条件的确定
• 3.3 由ISSR揭示的棕榈的遗传多样性
• 3.3.1 棕榈物种水平的遗传多样性
• 3.3.2 棕榈各居群的遗传多样性比较
• 3.3.3 棕榈的遗传结构
• 3.3.4 各棕榈居群的聚类分析
• 4.讨论
• 4.1 棕榈的分布及其棕榈属植物的分布格局与起源初探
• 4.2 关于分子标记ISSR
• 4.3 ISSR-PCR反应条件筛选与优化
• 4.4 棕榈居群的遗传结构
• 4.5 棕榈的保护
• 主要参考文献
• 附录：
• 附表1 缩写词及英汉对照
• 附表2 实验中所用ISSR引物
• 附图1 引物810对居群XAR的扩增
• 附图2 引物810对居群GJX8的扩增
• 附图3 引物864对云南文山居群DWS1，DWS2，DWS3的扩增
• 攻读学位期间学术论文发表情况
• 致谢