不同江豚群体遗传多样性及其血清维生素含量分析

论文摘要

江豚（Neophocaena phocaenoides）是一种小型齿鲸,近年来由于受到直接或间接的人类活动的影响,江豚的种群数量尤其是长江江豚的种群数量正在迅速下降,目前长江江豚已被IUCN定为“濒危级”鲸类地理种群名录。本研究首次采用ISSR分子标记对中国水域隶属于不同江豚亚种的两个种群即长江种群和渤海种群的遗传多样性进行分析。此外,为合理评价饲养江豚的营养状况和该物种的人工繁殖奠定基础,本研究还分别测定了20头野生长江江豚与3头饲养江豚的血清维生素A和维生素E含量并进行相关比较分析。本研究主要结果如下: （1）用ISSR标记技术从63个引物当中筛选到16条ISSR引物及3对引物组合对两个种群共36个样品的基因组DNA进行PCR扩增,共得到115个清晰的扩增位点,其中多态性位点48个,多态位点百分比（PPL）为41.71%。POPGENE分析结果表明:两个江豚种群的总体遗传多样性水平相对较低（He=0.1643;Ho=0.2413）;长江种群的遗传多样性水平（He=0.1530;Ho=0.2223）稍高于渤海种群（He=0.1402;Ho=0.2059）。两群体内个体间遗传相似度分析结果亦表明长江江豚个体间差异比渤海江豚个体间差异也要大一些。 （2）Nei’s基因多样性分析和AMOVA分析所揭示的两个江豚群体间已产生一定程度的遗传分化(φst=0.1829,P<0.001),但Nei’s遗传多样性分析结果表明种群结构水平较低而基因流水平较高(Gst=0.1049;Nm=4.2676);两个江豚群体共36个样品的个体UPGMA聚类分析显示来自同一群体的个体没有聚为两个明显的类群。这些结果提示两种群在历史上可能发生过较强的基因交流。 （3）比较野生江豚和饲养江豚的血清VA和VE的含量发现,野生江豚的VA含量要明显高于饲养江豚的VA含量（p<0.05）,而两者的VE含量则没有差异（p>0.05）;通过对血清VA、VE的含量与性别之间的关系可以看出,不管是VA还是VE雄性都比雌性的含量高,且VA具有显著性差异（p<0.05）;野生江豚的VA和VE的含量与其体长和体重没有明显的关系。

论文目录

• 摘要
• Abstract
• 目录
• 1. 文献综述
• 1.1 鲸类保护遗传学研究简介
• 1.1.1 社群行为研究
• 1.1.2 物种鉴定
• 1.1.3 个体扩散和基因流
• 1.1.4 遗传瓶颈分析
• 1.1.5 遗传多样性研究及保护管理单元的确定
• 1.2 江豚遗传多样性研究概况
• 1.3 本项目研究的目的、意义以及主要内容
• 2. 材料与方法
• 2.1 江豚样本来源
• 2.2 主要试剂和仪器
• 2.3 ISSR引物序列来源
• 2.4 实验方法
• 2.4.1 基因组DNA的提取
• 2.4.2 基因组DNA浓度和质量的检测
• 2.4.3 PCR产物电泳检测
• 2.4.4 ISSR-PCR最佳反应体系的建立
• 2.4.5 集团分离分析法筛选多态性引物
• 2.4.6 使用引物组合进行扩增反应
• 2.5 数据分析
• 2.6 野生江豚和饲养江豚血清VA、VE含量的测定
• 2.6.1 血清的提取
• 2.6.2 实验仪器、试剂和方法
• 2.6.3 色谱条件
• 2.6.4 标准溶液的配制及标定
• 2.6.5 样品测定
• 2.6.6 数据分析
• 3. 结果与分析
• 3.1 基因组DNA的提取
• 3.2 ISSR最佳反应体系的建立
• 3.3 ISSR引物的筛选及扩增结果分析
• 3.3.1 BSA法引物筛选
• 3.3.2 引物扩增结果
• 3.4 江豚的ISSR遗传多样性分析
• 3.4.1 江豚的ISSR遗传多样性
• 3.4.2 江豚群体之间遗传变异的分析
• 3.4.3 两江豚群体内个体之间遗传相似度分析
• 3.4.4 江豚个体间的聚类分析
• 3.5 野生江豚和饲养江豚的血清VA和VE含量
• 3.5.1 野生江豚和饲养江豚的血清维生素含量比较
• 3.5.2 野生江豚的血清维生素含量与性别之间的关系
• 3.5.3 野生江豚血清维生素水平与体重和体长的关系
• 4. 讨论
• 4.1 ISSR技术
• 4.2 江豚的遗传多样性
• 4.3 关于两个江豚群体的遗传多样性水平差异
• 4.4 两江豚群体的遗传结构和分化
• 4.5 野生江豚和饲养江豚血清VA和VE含量的比较分析
• 4.6 江豚的保护策略
• 参考文献
• 致谢