PLCE1和C20orf54基因多态与慢性食管炎易感性

论文摘要

1.研究背景与目的食管癌是世界上最常见的六大恶性肿瘤之一,在中国癌症相关死亡原因中排第四位。食管癌变被认为是一个多阶段、进行性的发展过程,在这个过程中,环境因素和遗传因素都起着很重要的作用。环境中各种致癌因素的作用,可使食管上皮细胞DNA的结构和功能发生改变,在这个变化过程的不同阶段,可能有多种基因发生变化,并作用于不同阶段,可能发生不同的生物学改变,二者相互之间或多或少存在着不同的影响,而慢性食管炎为食管粘膜上皮癌变提供了一种微环境。我们前期利用全基因组关联分析方法（GWAS）发现了两个重要的食管癌易感基因（PLCE1和C20orf54）,其中,PLCE1对调节上皮细胞的增生、分化、凋亡和再生具有重要作用；C20orf54是核黄素转运基因,在肠道吸收核黄素中起着重要的作用。本研究的目的旨在通过对高低发区慢性食管炎流行病学特征的分析以及从分子水平利用GWAS方法分析PLCE1和C20orf54单核苷酸基因多态性（SNP）与慢性食管炎的风险性,探讨慢性食管炎的发病特点及其与食管癌的关系,深入解析慢性食管炎、食管癌的病变过程及其发病机制,为建立食管癌高危人群筛查预警、早诊早治及个体化预防等策略提供一定的遗传学依据和分子靶标。2.研究对象与方法2.1研究对象所有的调查对象均来自2008年底-2010年底河南省安阳市肿瘤医院、河北省磁县人民医院及山西省长治市和平医院等食管癌高发区和商丘市人民医院、濮阳市人民医院及信阳市人民医院等食管癌低发区门诊胃镜就诊患者。2.2流行病学调查及基因型测定2.2.1所有调查对象（32833例）主要采用门诊问卷调查、部分入户调查及随访方法采集姓名、性别、年龄、籍贯等一般资料,并且全部经过电子胃镜检查并明确诊断。2.2.2 725例慢性食管炎患者及2187例正常对照的单核苷酸多态性-2274223和rs13042395的基因型（通过国际公认的Illumina Human 610-Quad BeadChips SNP芯片获得）用于分析。2.3资料的收集与整理所有调查结果均采用Excel进行数据录入及软件处理。并且通过查阅病人就诊档案及部分随访,进一步确认胃镜诊断及病理学诊断,并收集相关资料（包括临床背景资料,联系方式等）。2.4血样采集和处理在就诊者知情同意的前提下,对其采集空腹外周静脉血（每人每次5m1）,现场抗凝处理,再转入实验室进入实验或-40℃/-80℃冰箱备用。2.5统计方法分析进行病例组和对照组人群的均衡性检验,以确定病例组与对照组之间有无选择性差异。所有数据的分析均采用SPSS17.0软件,采用卡方检验分析每一变量,检验显著性水准取α=0.05,P<0.05有显著性意义；应用多因素非条件Logistic回归分析（选入变量和剔除变量标准分别为0.05和0.10）,从分子水平探讨不同因素对慢性食管炎发病的影响。3.结果3.1慢性食管炎检出率慢性食管炎的检出率为9.78%（3203/32833）。高发区慢性食管炎的检出率10.98%（1065/9702）略高于低发区9.24%（2138/23131）（P=1.35E-6,χ2=23.35,OR--1.21,95%CI为1.12-1.31）。高发区重度慢性食管炎的检出率7.68%（745/9702）明显高于低发区的检出率1.25%（289/23131）（P=1.83E-203,χ2=926.35,OR=6.57,95%CI为5.73-7.55）。3.2慢性食管炎性别和年龄分布3.2.1慢性食管炎发病性别比例分别为男性64.06%（2052/3203）、女性35.94%（1151/3203）；平均年龄为52±12岁,年龄范围16-84岁,发病年龄以40-60岁为主（57.70%）。3.2.2高发区（男：63.10%,女：36.90%）与低发区（男：64.55%,女：35.45%）慢性食管炎病人性别分布都提示以男性为主,高/低发区性别之间未见显著性差异（P=4.21E-1,χ2=0.65,OR=0.94,95%CI为0.81-1.10）3.2.3高发区和低发区慢性食管炎平均年龄分别为54±11岁和51±12岁,年龄范围分别为18-84岁和16-83岁,两者平均年龄之间有显著性差异（P=3.59 E-4）；高发区与低发区慢性食管炎都集中在40-60岁之间,分别为60.37%、56.36%,高/低发区慢性食管炎年龄分部之间有显著统计学差异（P=-1.11 E-8）。3.3基因多态和慢性食管炎3.3.1病例组与对照组rs2274223与rs13042395位点基因型和等位基因总体分布都具有统计学意义（P=5.30E-3,χ2=10.48及P=1.72E-3,χ2=9.83,OR=1.25,95%CI为1.09-1.43；P=4.62E-2,χ2=6.15及P=4.91E-2,χ2=3.87,OR=1.14,95%CI为1.00-1-31）。3.3.2高发区与低发区慢性食管炎患者之间rs2274223与rs13042395位点基因型分布均无统计学意义（P未调整=9.47E-1,P调整=9.26E-1,χ2=0.11；P未调整=1.68E-1,P调整=6.67E-2,χ2=3.57）。3.3.3 Logistic回归分析结果提示,病例组与对照组rs2274223位点基因型分布具有统计学意义（P=1.09E-2,χ2=6.47,OR=1.52,95%CI为1.10-2.14）；而rs13042395位点基因型分布没有统计学意义（P=5.66E-1,χ2=0.37,OR=1.11,95%CI为0.80-1.53）。3.4慢性食管炎发病危险因素分析Logistic回归分析综合评价发现：男性、40-60岁年龄、高发区是慢性食管炎发生的危险因素；PLCE1基因突变增加了慢性食管炎的患病风险。4.结论4.1食管癌高发区慢性食管炎发生率高于低发区；男性比女性容易发生慢性食管炎；慢性食管炎好发于40-60岁人群。4.2PLCE1基因多态与慢性食管炎的易感性有关；C20orf54基因多态与慢性食管炎的易感性无关。4.3 Logistic回归分析结果进一步证实：性别、年龄、高低发区与慢性食管炎密切相关。

论文目录

• 摘要
• ABSTRACT
• 图和附表清单
• 符号说明
• 1 引言
• 2 材料与方法
• 3 结果
• 4 讨论
• 5 结论
• 6 参考文献
• 图表
• 综述 炎症与恶性肿瘤的研究进展
• 参考文献
• 致谢
• 附录
• 个人简介
• 硕士研究生学习期间发表的文章及参加实践