圩猪和皖南黑猪H-FABP基因多态性及其对经济性状的遗传效应分析

论文摘要

本试验利用现代分子标记技术对安徽省地方优良品种猪（圩猪和皖南黑猪）心脏脂肪酸结合蛋白（H-FABP）基因5’-上游区和第二内含子的多态性进行分析及克隆测序，分析其多态性与胴体性状、肉质性状的相关性。旨在为圩猪和皖南黑猪的保护和开发奠定基础，并为其在配套系的培育提供理论支撑。试验结果表明：（1）圩猪和皖南黑猪中：5’-上游区，HinfⅠ位点上存在多态性，等位基因H的基因频率分别为0.6545和0.6223，分别表现为中度多态（PIC=0.3500和PIC=0.3596）；第二内含子区：HaeⅢ位点上也存在多态性，等位基因D的基因频率分别为0.6301和0.9239，分别表现为中度多态和低度多态（PIC=0.3575和PIC=0.1307），皖南黑猪只检测到DD和Dd两种基因型；而MspⅠ位点上，两个猪种均未检测到多态，基因型均为AA型；在Hinf Ⅰ*位点上，圩猪和皖南黑猪也存在多态性，等位基因B的基因频率分别为0.7195和0.7826，均表现为中度多态（PIC=0.3222和PIC=0.2824）。χ2检验表明：在圩猪中，基因频率和基因型频率都处于Hardy-Weinberg平衡状态（P>0.05）；在皖南黑猪中，除5’-上游区HinfⅠ多态位点外，其他3个位点均达到Hardy-Weinberg平衡状态（P>0.05）。（2）对圩猪和皖南黑猪H-FABP基因3个多态片段进行克隆测序分析发现， HinfⅠ-RFLP均由1324bp处T→C的突变引起，H aeⅢ-RFLP均由1811bp处C→G的突变引起，Hinf Ⅰ*-RFLP均由1970bp处C→T的突变引起。（3）H-FABP基因各多态位点与胴体性状的相关分析，在圩猪群体中：HaeⅢ位点Dd型胴体瘦肉率显著高于dd型（P<0.05），基因型的性状值大小关系为Dd>DD>dd；皖南黑猪中：Hinf Ⅰ*位点Bb型屠宰率显著高于bb型（P<0.05），基因型的性状值大小关系为Bb>BB>bb。其他位点各基因型在胴体性状各项指标上均未达到差异显著水平（P>0.05）。（4）H-FABP基因各多态位点与肉质性状的相关分析：HinfⅠ位点上，圩猪HH型肉色评分显著高于hh型（P<0.05），表现为HH>Hh>hh；皖南黑猪Hh型肉色a*值显著高于hh型（P<0.05），表现为Hh>HH>hh；在大理石纹评分上，试验猪群HH型和Hh型均显著高于hh型（P<0.05）。HaeⅢ位点上，圩猪Dd型和dd型的肉色L*值极显著高于DD值（P<0.01），表现为Dd>dd>DD，该检测结果与皖南黑猪的检测结果相近；圩猪DD型肌肉水分极显著高于Dd型和dd型肌肉水分（P<0.01）表现为：DD>Dd>dd；皖南黑猪DD型与Dd型在肉色评分上有显著影响（P<0.05），表现为DD>Dd；Hinf Ⅰ*位点上，皖南黑猪Bb型滴水损失显著高于bb型（P<0.05），表现为Bb>BB>bb。（5）H-FABP基因各多态位点对肌内脂肪（IMF）含量的相关分析：所检测的基因型对IMF含量影响的趋势均为：HH＞Hh＞hh，dd＞Dd＞DD。其中，HH型IMF含量显著高于Hh型（P<0.05）而极显著高于hh型（P<0.01），Hh型显著高于hh型（P<0.05）；dd型显著高于Dd型（P<0.05）而极显著高于DD型（皖南黑猪除外）（P<0.01），Dd型显著高于DD型（P<0.05）；BB、Bb、bb三种基因型在IMF含量上差异不显著（P>0.05），但呈现出BB＞Bb＞bb的趋势，B基因有使IMF含量增加的趋势。该研究结果对H-FABP基因的研究及其作为影响圩猪和皖南黑猪的胴体及肉质性状的候选基因提供了初步依据。

论文目录

• 摘要
• Abstract
• 缩略词（Abbreviation）
• 文章综述
• 1 安徽省地方品种猪的种质资源特性
• 1.1 安徽省地方品种猪的分布特征及特点
• 1.2 圩猪和皖南黑猪的种质特性及利用
• 1.2.1 圩猪的种质特征
• 1.2.2 圩猪种质资源的开发利用现状
• 1.2.3 皖南黑猪的种质特征
• 1.2.4 皖南黑猪种质资源的开发利用现状
• 2 猪心脏脂肪酸结合蛋白（H-FABP）基因研究进展
• 2.1 猪 H - FABP 基因结构及基因座的定位
• 2.2 H-FABP 基因的表达及功能
• 2.3 猪 H-FABP 基因的多态性研究
• 2.4 猪 H-FABP 基因的多态性与经济性状影响的研究
• 2.4.1 H-FABP 基因的多态性与胴体性状关系的研究
• 2.4.2 H-FABP 基因的多态性与肉质性状关系的研究
• 2.4.3 H-FABP 基因与肌内脂肪（IMF）含量关系的研究
• 2.4.4 H-FABP 基因的多态性与生长性能的关系
• 3 PCR-RFLP 技术
• 1 引言
• 2 材料与方法
• 2.1 试验材料
• 2.1.1 耳样
• 2.1.2 主要仪器设备
• 2.1.3 主要试剂
• 2.1.4 软件工具
• 2.1.5 常规溶液及试剂配制
• 2.2 实验方法
• 2.2.1 DNA 提取
• 2.2.2 DNA 浓度和纯度的测定
• 2.2.3 引物设计
• 2.2.4 H-FABP 基因 PCR 扩增
• 2.2.5 H-FABP 基因 PCR 扩增产物的琼脂糖凝胶电泳检测
• 2.2.6 H-FABP 基因 PCR 扩增产物的酶切
• 2.2.7 H-FABP 基因 PCR-RFLP 片段克隆测序
• 2.2.8 胴体性状及肉质性状测定
• 2.2.9 统计分析方法
• 2.2.10 H-FABP 基因各位点对胴体性状及肉质性状分析方法
• 3 结果与分析
• 3.1 基因组 DNA 提取结果检测
• 3.1.1 紫外分光光度计检测
• 3.1.2 DNA 琼脂糖凝胶电泳检测
• 3.2 H-FABP 基因的 PCR-RFLP 检测结果
• 3.2.1 H-FABP 基因的 PCR 检测结果
• 3.2.2 H-FABP 基因 PCR-RFLP 结果
• 3.3 试验猪群 H-FABP 基因的基因型频率和基因频率分析
• 3.4 试验猪群黑猪群体遗传学分析
• 3.5 试验猪群胴体性状的相关分析
• 3.6 试验猪群肉质性状的相关分析
• 3.7 试验猪群胴体性状和肉质性状的相关分析
• 3.8 试验猪群 H-FABP 基因不同位点各基因型胴体性状的测定结果
• 3.9 试验猪群 H-FABP 基因不同位点各基因型肉质性能的测定结果
• 3.10 试验猪群 H-FABP 基因多态性对 IMF 含量的影响
• 3.10.1 试验猪群 IMF 含量的比较
• 3.10.2 试验猪群不同位点各基因型 IMF 含量的比较
• 3.11 H-FABP 基因测序结果
• 4 讨论
• 4.1 H-FABP 基因的 PCR-RFLP 在试验猪群中的分布
• 4.2 试验猪群 H-FABP 基因的 PCR-RFLPs 与 IMF 含量的影响
• 4.3 H-FABP 基因对试验猪群胴体和肉质性状的效应分析
• 4.4 试验猪群胴体性状与肉质性状的相关分析
• 4.5 本试验存在的不足以及下一步值得研究的工作
• 5 结论
• 参考文献
• 致谢
• 个人简介