应用SSR和SRAP分子标记构建花生的遗传连锁图谱

论文摘要

花生是我国重要的油料和经济作物,在农业生产和国民经济发展中地位举足轻重。DNA分子标记的兴起为花生研究注入了活力,相对其它作物而言,现代高新技术在花生中的应用还较少。最初在花生上使用的标记主要为RFLP和RAPD标记,近些年来的AFLP, DAF,SSR,SRAP等技术的兴起为花生的DNA遗传多样性研究提供了更多的手段。同时在花生遗传连锁图谱构建方面已经有了一定的发展,构建了几张遗传连锁图谱,但是这些都是在野生种的基础上建立起来的,利用这些图谱对于花生栽培种中一些重要的农艺性状和经济性状的研究存在很大的难度,所以构建以花生栽培种品种之间杂交为基础的分离群体进行遗传图谱构建很有必要。本研究利用SSR和SRAP分子标记技术构建花生的遗传连锁图谱,并通过遗传分析和SSR标记探讨花生种皮粉红色颜色基因的遗传连锁规律。取得以下的研究成果:花生SSR连锁图谱的初步构建:用SSR对粤油7号和六月雪进行多态性筛选,对得到的经过x2测验后的25个多态性标记进行连锁分析,采用Mapmaker/EXP version 3.0作图软件构建花生遗传连锁图。23个标记进入4个连锁群（LOD≥3.0 ）,总长569.5cM,标记间平均图距为24.7cM。每个连锁群上的标记数在2～7个之间,连锁群的长度在25.5～199.8 cM之间。标记在整个连锁群中分布比较均匀,没有标记聚集在一起的现象。花生粉红色种皮颜色基因的遗传连锁分析:以种皮颜色为粉红色的粤油7号和种皮颜色为白色的六月雪的杂交后代群体为材料,通过遗传分析和SSR分子标记探讨花生种皮颜色基因的遗传连锁规律。结果表明,花生粉红色种皮颜色可能受一对完全显性的主效基因控制,该基因与SSR标记PMX121的连锁距离为36cM。花生的SRAP分子遗传连锁图谱的初步构建:用SRAP对粤油7号和六月雪进行多态性筛选,结果表明SRAP标记在两个亲本之间表现出较好的多态性,每个引物组合可产生10-30个左右清晰可辨的条带。选取多态性好的35个引物组合进行群体分析,共得到112条多态性条带,平均每个引物组合产生3.2个多态性条带。每组合的多态性条带数从1～5不等。对得到的经过x2测验后的95个多态性标记进行连锁分析,构建花生遗传连锁图。77个标记进入11个连锁群（LOD≥3.0 ）,总长1661.2cM。标记间平均图距为21.5cM。每个连锁群上的标记数在2～7个之间,连锁群的长度在91～195.7cM之间。标记在整个连锁群中分布比较均匀,也没有标记聚集在一起的现象。

论文目录

• 摘要
• Abstract
• 缩略语
• 第一章 前言
• 1.1 花生的分类
• 1.2 栽培种花生的遗传多样性
• 1.3 遗传标记
• 1.3.1 遗传标记的发展
• 1.3.2 常用DNA 分子标记的原理以及特点
• 1.3.2.1 RFLP 标记技术
• 1.3.2.2 RAPD 标记技术
• 1.3.2.3 CAPS 标记技术
• 1.3.2.4 AFLP 标记技术
• 1.3.2.5 SSR 标记技术
• 1.3.2.6 SNP 标记技术
• 1.3.2.7 SRAP 标记技术
• 1.4 目前在国内花生研究中常利用的几种分子标记的研究进展
• 1.4.1 RAPD 标记的应用进展
• 1.4.2 AFLP 标记的应用进展
• 1.4.3 SSR 标记的应用进展
• 1.4.4 SRAP 标记的应用进展
• 1.5 分子遗传连锁图谱的构建及研究进展
• 1.5.1 理论基础
• 1.5.2 作图群体的建立
• 1.5.2.1 亲本的选配
• 1.5.2.2 分离群体类型的选择
• 1.5.2.3 群体大小的确定
• 1.5.2.4 分离数据的收集与数字化
• 1.5.3 遗传连锁图谱的研究进展
• 1.5.4 构建DNA 分子遗传图谱的应用研究
• 1.5.4.1 QTL 定位
• 1.5.4.2 比较基因组研究
• 1.5.4.3 基于遗传图谱的基因克隆
• 1.5.4.4 标记辅助选择（Marker-assisted seleetion，MAS）
• 1.6 研究的目的和内容
• 第二章 花生SSR 标记连锁图谱的构建
• 2.1 材料
• 2.1.1 分离群体的构建
• 2.1.2 引物
• 2.2 方法
• 2.2.1 花生基因组DNA 的提取及检测
• 2.2.2 PCR 反应体系及程序
• 2.2.3 聚丙烯酰胺凝胶电泳检测
• 2.3 结果与分析
• 2.3.1 引物的筛选
• 2.3.2 SSR 标记的统计与分析
• 2.3.3 遗传作图数据处理与统计分析
• 2.3.4 花生SSR 分子标记连锁图的构建
• 第三章 花生粉红色种皮颜色基因的遗传连锁分析
• 3.1 材料
• 3.2 方法
• 3.3 结果与分析
• 3.3.1 种皮颜色的遗传分析
• 3.3.2 种皮颜色的遗传连锁分析
• 第四章 花生SRAP 标记连锁图谱的构建
• 4.1 材料
• 4.1.1 分离群体的构建
• 4.1.2 引物
• 4.2 方法
• 4.2.1 花生基因组DNA 的提取及检测
• 4.2.2 PCR 反应体系及程序
• 4.2.3 聚丙烯酰胺凝胶电泳检测
• 4.3 结果与分析
• 4.3.1 引物组合的筛选
• 4.3.2 SRAP 标记的统计方法
• 4.3.3 遗传作图数据处理与统计分析
• 4.3.4 花生SRAP 分子标记连锁图的构建
• 第五章 讨论
• 5.1 SSR 和SRAP 标记
• 5.2 标记偏分离分析
• 5.3 遗传连锁图谱
• 5.4 本研究的不足及改进措施
• 参考文献
• 附录
• 致谢