复杂疾病连锁不平衡分析及诱变小鼠模型研究

复杂疾病连锁不平衡分析及诱变小鼠模型研究

论文摘要

互作用,常常伴有环境因素或其他未知的随机因素参与,在各种因素共同协同作用下发生。复杂疾病在普通人群中发病率较高(一般≥1%),所以也称作常见疾病,如精神分裂症、老年黄斑、糖尿病、哮喘、心血管疾病等等,均属于复杂疾病。由于缺乏对复杂疾病的致病机制的了解,一直没有找到有效的治疗手段,因而也日益成为各国科学家们的研究热点。本论文的主要工作是采用连锁不平衡的分析方法在中国汉族人群中研究精神分裂症和老年黄斑变性这两种复杂疾病和它们的易感基因之间的相关性。精神分裂症(MIM 181500)是最严重精神疾病之一,在世界范围发病率为1%左右。双生子,家系,寄养子的研究结果,提供了强有力的证据表明精神分裂症是一种复杂遗传疾病,具有很强的遗传性。但引发精神分裂症的基因仍然不明。精神疾病的谷氨酸假说中提示,NMDA受体对精神类疾病的易感性起着重要的作用。由NOS1催化产生的一氧化氮是NMDA的二级信使,在神经系统,免疫系统和心血管系统中起着重要的调节作用。NOS1定位在12q22-24,是和许多精神疾病相关的一个易感基因。我们选择了11个位点,包括一个微卫星标记在总共1705份病例对照组样品中采用测序的手段进行了连锁不平衡分析。我们发现rs3782206这个位点即使经过校正也在全部的病例对照组样品中与精神分裂症显著关联p<0.05。而且由它和rs3837437组成的单倍型也和精神分裂症以及偏执型亚型存在显著的关联.我们的实验结果证实了NOS1是中国汉族人群中精神分裂症的易感基因,也支持了精神分裂症的谷氨酸通路假说。DISC1自从1990年在苏格兰精神病大家系中被发现后,一直是研究者的焦点候选基因。特别是最近几年研究者们陆续阐明了DISC1的通路以及通路上的蛋白。DISC1通过跟PDE4B、NDEL1、LIS1、FEZ1等蛋白的相互作用影响了神经元的迁移、细胞骨架定位和神经传导过程。DISC1和它的通路很好的支持了精神类疾病的神经发育假说并且给认知障碍的发病机制提供了可信的解释。我们选择了覆盖了整个DISC1基因的16个SNPs位点,采用TaqMan的分型手段在576份病例对照组样品中进行了分型。结果显示rs1322784、rs7514199、rs2738864、rs1000731、和rs16841582都显示出与精神分裂症的关联P<0.05。而rs1322784、rs7514199和rs2738864组成的核心单倍型也显示出了强烈的关联。同时,我们对基因表达水平在病例和对照组的外周血细胞中进行了研究,发现这些基因的表达关联程度很强, NDEL1和PDE4B在病例组中都显著的高于正常组。通过Logistic多元回归方法构建的疾病模型,发现NDEL1和DISC1能够具有73.74%的准确度将样品的疾病状态分类。我们的结果在分子遗传和表达水平上都支持DISC1作为中国人群中的精神分裂症的易感基因。老年性黄斑变性(MIM 153800)是一种随年龄增加而发病率上升并导致双眼中心视力损害,是视网膜色素上皮细胞和神经视网膜退行性变造成的一种不可逆性视力下降或丧失的疾病。最近科学家们通过全基因组连锁分析和关联分析的手段找到了致病的两个候选基因CFH和ARMS2。我们在192个病例对照样本中进行了关联分析。结果显示在中国人群中CFH的致病位点Y402H的作用并不像在高加索人群中那样显著。在中国人群中发现了一系列同义和非同义突变rs800292、rs2274700、rs3753396、rs1329428和rs1065489与疾病有显著的相关(P<0.05,OR>1.5)。而针对ARMS2的A69S我们得出了较为一致的结果,尤其在湿性老年黄斑变性中,P值达到了1.55×10-7,OR达到了5.46。在相互作用分析当中我们也证实了它们之间是相对独立的作用于疾病模式。我们的实验结果进一步的支持了CFH和ARMS2是中国人群中老年黄斑变性的易感基因。论文的另一部分是关于ENU(乙酰基亚硝基脲)诱变小鼠模型的研究。ENU是公认的强有力的化学诱变剂,能够随机地诱导出各种表型。国际上一些研究机构通过大规模ENU诱变筛选建立了一系列突变小鼠模型家系,通过对这些小鼠模型的研究,从另一个侧面研究人类的罕见疾病和复杂疾病。我们通过ENU诱变筛查出了具有转圈表型的小鼠,通过建立小鼠家系,将突变基因定位在4号染色体上,尔后通过测序在Chd7基因的exon13上寻找到一个从精氨酸到终止子的新的突变。CHD7基因曾被发现是常染色体显性遗传病CHARGE综合症的致病基因,基于它的临床表型和Chd7突变小鼠之间存在太多的表型相似,我们相信这个ENU诱变鼠系能够成为研究CHARGE综合症发病机制的一个非常宝贵的工具。

论文目录

  • 摘要
  • ABSTRACT
  • 文中常用缩写列表
  • 引言
  • 第一章 背景知识介绍
  • 第一节 复杂疾病介绍及其研究方法概述
  • 1.1 遗传性疾病的概念及分类
  • 1.2 复杂疾病的复杂性
  • 1.3 复杂疾病的研究手段和工具
  • 1.4 人类基因组计划和单倍体图谱计划
  • 1.5 连锁分析
  • 1.6 关联分析
  • 1.7 连锁不平衡
  • 1.8 复杂疾病研究的其他方法
  • 第二节 精神分裂症概况和研究进展
  • 1.1 精神分裂症的诊断与分类
  • 1.2 精神分裂症的流行病学研究和致病风险因素
  • 1.3 精神分裂症的病因假说
  • 1.4 精神分裂症的分子遗传学研究
  • 第三节 老年黄斑变性
  • 1.1 老年黄斑变性简介
  • 1.2 老年性黄斑变性的诊断标准和分类
  • 1.3 诊断方法研究进展
  • 1.4 治疗手段
  • 1.6 老年黄斑变性的病因学
  • 1.7 老年黄斑变性的分子遗传学研究
  • 1.8 老年黄斑变性的动物模型及其研究进展
  • 第四节 ENU 诱变小鼠模型
  • 1.1 ENU 诱变原理
  • 1.2 ENU 诱变小鼠的筛查
  • 1.3 突变基因的定位
  • 1.4 ENU 诱变的历史和现状
  • 第二章 实验部分
  • 第一节 .NOS1 与精神分裂症的关联分析
  • 1.1 候选基因NOS1 介绍
  • 1.2 材料与方法
  • 1.3 实验结果
  • 1.4 讨论
  • 第二节 DISC1 基因与精神分裂症的连锁不平衡分析以及通路基因表达分析研究
  • 2.1 候选基因DISC1 介绍
  • 2.2 材料与方法
  • 2.3 实验结果
  • 2.4 讨论
  • 第三节 老年黄斑变性疾病的致病候选基因 FH和ARMS2的连锁不平衡 分析 C
  • 3.1 CFH和ARMS2 和老年黄斑变性
  • 3.2 材料和方法
  • 3.3 实验结果
  • 3.4 讨论
  • 第四节 ENU 诱变小鼠表型的定位、突变查找和功能预测
  • 4.1 ENU 诱变获得突变系小鼠
  • 4.2 ENU 诱导小鼠表型的定位以及查找突变
  • 4.3 讨论和展望
  • 第五节 总结和展望
  • 参考文献
  • 致谢
  • 攻读学位期间发表的学术论文及会议摘要
  • 附件
  • 相关论文文献

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