我国大豆疫霉菌遗传多样性的初步分析

论文摘要

大豆疫霉根腐病是一种毁灭性的土传病害,由大豆疫霉菌(Phytophthora sojae)引起,自20世纪90年代在我国东北地区被发现以来,逐渐在全国都有报道发生,成为影响大豆产量的重要病害之一。本研究从中国东北地区和新疆采集到大量大豆根腐病病样,通过建立CAPS和SSR标记对179个大豆疫霉菌株进行遗传多样性分析,研究结果如下:1.从东北地区和新疆采集到了442株大豆病样,其中有205株是被大豆疫霉菌侵染发病。从新鲜感病组织和感病严重的干老组织上分离到137株大豆疫霉菌。改进了分离方法,大豆疫霉菌的分离率达到31%。2.用代表4个大豆疫霉菌基本基因型的模式菌系筛选CAPS和SSR标记,对大豆疫霉菌群体进行遗传多样性分析。3.对179个供试菌株进行的遗传多样性分析表明,有41个菌株和四个基本基因型相同,同时部分菌株产生了不同于四个模式菌系的带型,表明国内的大豆疫霉菌存在不同于四个基本基因型的变异;聚类分析将179个分离物划分为7个聚类组,东北群体在7个聚类组中均有分布,新疆群体分布在4个聚类组中,且东北群体的Shannon’s多样性信息指数高于新疆群体,这表明东北群体的遗传多样性比新疆群体的丰富;东北群体和新疆群体的遗传相似性很高(0.9935)。在基因型多样性分析中,新疆群体所出现的基因型在东北群体中均有分布,而东北群体中有3种基因型是新疆群体所没有的,据此推测新疆的大豆疫霉菌有可能是从东北传入。

论文目录

• 摘要
• ABSTRACT
• 第一章 文献综述
• 1.1.大豆疫霉菌引起的病害症状及其致病规律
• 1.1.1 大豆疫霉菌引起的病害症状
• 1.1.2 大豆疫霉菌致病规律
• 1.2.大豆疫霉根腐病病原菌的分类学及生物学特性
• 1.2.1 大豆疫霉根腐病病原菌分类学地位的变迁
• 1.2.2 大豆疫霉菌的形态学特征和生物学特性
• 1.3.大豆疫霉菌的检测和分离
• 1.3.1 大豆疫霉菌的检测方法
• 1.3.2 大豆疫霉菌的分离
• 1.4.病原菌的群体遗传结构
• 1.4.1 群体遗传结构的概念
• 1.4.2 植物病原菌群体遗传结构的研究方法
• 1.5 大豆疫霉菌的群体遗传结构研究
• 1.5.1 疫霉菌群体遗传结构的研究
• 1.5.2 大豆疫霉菌群体遗传结构的研究
• 1.6 本研究目的和意义
• 第二章 大豆疫霉菌的采集、分离和基因组DNA的提取
• 2.1 大豆疫霉菌的采集
• 2.2.分离大豆疫霉菌
• 2.2.1 从新鲜的病样中分离大豆疫霉
• 2.2.2 从干老病组织中分离大豆疫霉
• 2.3 大豆疫霉菌基因组DNA的提取
• 2.4 讨论
• 第三章 多态性标记的设计和筛选
• 3.1.CAPS标记的设计
• 3.2.CAPS标记的筛选
• 3.2.1 PCR扩增
• 3.2.2 PCR产物的检测和纯化
• 3.2.3 PCR产物的酶切
• 3.2.4 酶切产物的检测
• 3.3 新CAPS引物的设计
• 3.4 SSR引物的设计
• 3.5 SSR引物的筛选
• 3.5.1 PCR扩增
• 3.5.2 PCR产物的检测
• 3.6 讨论
• 第四章 新疆和东北地区大豆疫霉菌的遗传多样性分析
• 4.1.用CAPS标记分析大豆疫霉菌的遗传多样性
• 4.1.1 PCR扩增
• 4.1.2 PCR产物的检测和纯化
• 4.1.3 PCR产物的酶切
• 4.1.4 酶切产物的检测
• 4.2 用SSR标记分析大豆疫霉菌的遗传多样性
• 4.2.1 PCR扩增
• 4.2.2 遗传多样性的检测
• 4.3 结果及分析
• 4.4 讨论
• 结论
• 参考文献
• 致谢
• 作者简介